MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 chromosome

Total Repeats: 12586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009487	T	6	6	90526	90531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009487	ATG	2	6	90536	90541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009487	AGT	2	6	90614	90619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009487	TGT	2	6	90630	90635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009487	ATT	2	6	90684	90689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009487	ACT	2	6	90698	90703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009487	T	6	6	90752	90757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009487	TGG	2	6	90834	90839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009487	ATTT	2	8	90841	90848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009487	T	6	6	90846	90851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009487	ATT	2	6	90927	90932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009487	ATT	2	6	91400	91405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009487	TAA	2	6	91458	91463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009487	ATA	2	6	91466	91471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009487	ATTCA	2	10	91504	91513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
516	NC_009487	ATT	2	6	91520	91525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009487	T	6	6	92185	92190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009487	AGA	2	6	92222	92227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009487	ATA	2	6	92250	92255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009487	TTA	2	6	92279	92284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009487	AATA	2	8	92310	92317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009487	ATA	2	6	92326	92331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009487	A	6	6	92346	92351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009487	ATT	2	6	92367	92372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009487	A	6	6	92392	92397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009487	GTT	2	6	92458	92463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009487	AGCA	2	8	92544	92551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_009487	TGA	2	6	92566	92571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009487	TAT	2	6	92602	92607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009487	AGA	2	6	92611	92616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009487	AATT	2	8	92677	92684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009487	TGA	2	6	92704	92709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009487	AC	3	6	92738	92743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_009487	GAT	2	6	92809	92814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009487	AGA	2	6	92860	92865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009487	T	6	6	92891	92896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009487	GAA	2	6	92947	92952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009487	ATG	2	6	92967	92972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009487	AAAG	2	8	92995	93002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009487	ATT	2	6	93007	93012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009487	TTC	2	6	93077	93082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_009487	CCAA	2	8	93114	93121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_009487	AGA	2	6	93148	93153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009487	CAA	2	6	93269	93274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009487	CCA	2	6	93329	93334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_009487	ACT	2	6	93347	93352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_009487	TTA	2	6	93353	93358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009487	AT	3	6	93363	93368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009487	TAG	2	6	93378	93383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009487	CTAAA	2	10	93405	93414	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
551	NC_009487	CAAAA	2	10	93436	93445	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
552	NC_009487	GAT	2	6	93458	93463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009487	TACT	2	8	93473	93480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_009487	TAA	2	6	93523	93528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009487	AT	3	6	93543	93548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009487	GAA	2	6	93569	93574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009487	TAC	2	6	93792	93797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_009487	AGA	2	6	93863	93868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009487	AGA	2	6	93893	93898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009487	ATG	2	6	93913	93918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009487	TTA	2	6	93958	93963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009487	A	6	6	93970	93975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009487	GAA	2	6	93984	93989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009487	AGA	2	6	94037	94042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009487	AATT	2	8	94055	94062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009487	TTAA	2	8	94095	94102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009487	AAAG	2	8	94110	94117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009487	CAA	2	6	94118	94123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009487	TTA	2	6	94129	94134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009487	AGA	3	9	94160	94168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009487	ATA	2	6	94186	94191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009487	CAA	2	6	94200	94205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009487	TTA	2	6	94206	94211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009487	ACA	2	6	94214	94219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_009487	ATTA	2	8	94289	94296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009487	ACA	2	6	94411	94416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_009487	ATG	2	6	94420	94425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009487	ATT	3	9	94511	94519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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584	NC_009487	TATT	2	8	94538	94545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009487	AATT	2	8	94576	94583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_009487	ACG	2	6	94650	94655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_009487	TATG	2	8	94673	94680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009487	ACT	2	6	94705	94710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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605	NC_009487	AAAG	2	8	95550	95557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009487	A	6	6	95576	95581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009487	TA	3	6	95583	95588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009487	AGCT	2	8	96133	96140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_009487	T	6	6	96143	96148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009487	TA	3	6	96153	96158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009487	AAT	2	6	96196	96201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009487	TAAT	2	8	96207	96214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009487	A	6	6	96267	96272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009487	TAAT	2	8	96279	96286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009487	AGAA	2	8	96298	96305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_009487	TAA	2	6	97385	97390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009487	CAA	2	6	97393	97398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009487	TAT	2	6	97399	97404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009487	TTGT	2	8	97417	97424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009487	ATA	2	6	97435	97440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009487	AT	3	6	97471	97476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009487	AACAAA	2	12	97483	97494	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
626	NC_009487	AGA	2	6	97506	97511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009487	TAA	2	6	99957	99962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009487	AGA	2	6	99998	100003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009487	AATC	2	8	100807	100814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_009487	ATA	3	9	100823	100831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009487	AAT	2	6	101669	101674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_009487	T	6	6	103994	103999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009487	A	6	6	104020	104025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009487	TGT	2	6	104043	104048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009487	ATAA	2	8	104056	104063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009487	ATG	2	6	104077	104082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009487	AATATA	2	12	106784	106795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009487	TTAT	2	8	106841	106848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_009487	GTT	2	6	106852	106857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_009487	TA	3	6	106875	106880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_009487	TA	4	8	106889	106896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_009487	ATT	2	6	107012	107017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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