MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009482	GA	3	6	41884	41889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009482	TC	3	6	66021	66026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009482	GA	3	6	89697	89702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009482	TC	3	6	106074	106079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009482	TC	3	6	181409	181414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009482	CG	3	6	191494	191499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009482	GT	3	6	195942	195947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009482	AT	3	6	199689	199694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009482	TC	3	6	199729	199734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009482	AT	3	6	200034	200039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009482	GA	3	6	206943	206948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009482	AT	3	6	210453	210458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009482	TC	3	6	224168	224173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009482	TC	3	6	263441	263446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009482	TG	4	8	263447	263454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009482	CA	4	8	265952	265959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009482	CA	3	6	268999	269004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009482	GC	3	6	283652	283657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009482	TC	3	6	318741	318746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009482	GA	3	6	320020	320025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009482	AG	3	6	321005	321010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009482	TC	3	6	324559	324564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009482	AG	3	6	341468	341473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009482	AG	3	6	349832	349837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009482	AC	3	6	349906	349911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009482	AC	3	6	350075	350080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009482	CA	3	6	350868	350873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009482	GC	3	6	351162	351167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009482	AG	3	6	351169	351174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009482	TG	3	6	351288	351293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009482	TG	3	6	351775	351780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009482	CT	4	8	352483	352490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009482	GA	3	6	352796	352801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009482	TG	3	6	353202	353207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009482	AG	3	6	361950	361955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009482	TG	5	10	365126	365135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009482	AT	3	6	384666	384671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009482	GC	3	6	409372	409377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009482	GA	3	6	435531	435536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009482	GC	3	6	447993	447998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009482	CA	3	6	458158	458163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009482	TC	3	6	463852	463857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009482	TG	3	6	466278	466283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009482	GC	3	6	466568	466573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009482	AG	3	6	473989	473994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009482	TG	4	8	497920	497927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009482	GA	3	6	498592	498597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009482	CT	3	6	502033	502038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009482	CT	3	6	569415	569420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009482	CG	3	6	570437	570442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009482	AG	3	6	575644	575649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009482	GC	3	6	598226	598231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009482	CT	3	6	610567	610572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009482	TC	3	6	625449	625454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009482	GT	3	6	631126	631131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009482	GT	3	6	664507	664512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009482	TC	3	6	665909	665914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009482	GA	3	6	693532	693537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009482	CA	3	6	745807	745812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009482	AG	3	6	777240	777245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009482	TC	3	6	806345	806350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009482	GC	3	6	807744	807749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009482	CT	3	6	807774	807779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009482	CT	3	6	810728	810733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009482	TG	3	6	818352	818357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009482	TC	4	8	827221	827228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009482	AG	3	6	832634	832639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009482	CT	3	6	832773	832778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009482	CA	3	6	860090	860095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009482	GA	3	6	872481	872486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009482	TG	3	6	904945	904950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009482	TC	3	6	937656	937661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009482	GC	3	6	937939	937944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009482	GT	3	6	941680	941685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009482	CT	3	6	942024	942029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009482	GC	4	8	942997	943004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009482	CG	3	6	943716	943721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009482	GC	3	6	945345	945350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009482	TG	3	6	956036	956041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009482	TC	3	6	957466	957471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009482	AG	3	6	958491	958496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009482	GA	3	6	963356	963361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009482	GC	3	6	966824	966829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009482	GT	3	6	966960	966965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009482	AG	3	6	967009	967014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009482	TC	3	6	970143	970148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009482	GC	3	6	970917	970922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009482	AG	3	6	971118	971123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009482	GT	3	6	972215	972220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009482	TC	3	6	972865	972870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009482	GT	4	8	982917	982924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009482	CA	3	6	1013420	1013425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009482	AC	3	6	1034681	1034686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009482	TC	3	6	1043145	1043150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009482	AG	3	6	1043178	1043183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009482	CG	3	6	1057139	1057144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009482	GC	3	6	1113879	1113884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009482	TA	3	6	1113958	1113963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009482	AG	3	6	1114017	1114022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009482	CT	3	6	1114551	1114556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009482	AG	3	6	1142338	1142343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009482	AG	3	6	1170799	1170804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009482	AC	3	6	1176178	1176183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009482	CT	4	8	1212575	1212582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009482	GC	3	6	1233093	1233098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009482	CA	3	6	1255379	1255384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009482	TC	3	6	1257560	1257565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009482	GA	3	6	1270569	1270574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009482	TC	3	6	1285894	1285899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009482	CA	3	6	1291269	1291274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009482	CT	3	6	1305986	1305991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009482	GC	3	6	1333488	1333493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009482	GC	3	6	1337699	1337704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009482	GA	3	6	1346500	1346505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009482	GC	3	6	1346643	1346648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009482	AG	3	6	1349337	1349342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009482	GA	3	6	1368114	1368119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009482	GT	3	6	1368265	1368270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009482	TG	3	6	1379537	1379542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009482	CA	3	6	1379682	1379687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009482	CA	3	6	1380213	1380218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009482	AC	3	6	1423559	1423564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009482	CA	3	6	1435876	1435881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009482	GT	3	6	1436024	1436029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009482	GA	3	6	1467224	1467229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009482	AG	3	6	1501558	1501563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009482	CA	3	6	1538183	1538188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009482	TG	3	6	1541481	1541486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009482	GC	3	6	1541495	1541500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009482	GC	3	6	1543261	1543266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009482	GC	3	6	1544672	1544677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009482	AG	3	6	1551121	1551126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009482	CG	3	6	1572519	1572524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009482	GC	3	6	1639094	1639099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009482	GC	3	6	1644597	1644602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009482	CT	3	6	1644867	1644872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009482	GC	3	6	1653638	1653643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009482	GC	3	6	1653691	1653696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009482	CT	3	6	1653755	1653760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009482	GA	3	6	1654524	1654529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009482	CT	3	6	1656923	1656928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009482	GA	3	6	1658732	1658737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009482	CT	3	6	1658899	1658904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009482	GC	3	6	1663162	1663167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009482	CA	3	6	1684354	1684359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009482	AG	3	6	1699719	1699724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009482	GA	3	6	1705118	1705123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009482	GC	3	6	1720284	1720289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009482	AC	3	6	1720300	1720305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009482	AG	3	6	1721034	1721039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009482	AG	3	6	1721042	1721047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009482	AG	3	6	1721507	1721512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009482	TG	3	6	1722803	1722808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009482	AC	4	8	1727503	1727510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_009482	GA	3	6	1728249	1728254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009482	CG	3	6	1732938	1732943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_009482	CA	3	6	1738444	1738449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_009482	AG	3	6	1740992	1740997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009482	GT	3	6	1743206	1743211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009482	CT	3	6	1756261	1756266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_009482	TG	3	6	1773832	1773837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009482	TC	3	6	1774475	1774480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_009482	GA	3	6	1790798	1790803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009482	CG	4	8	1828984	1828991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_009482	CG	3	6	1829001	1829006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
166	NC_009482	GA	3	6	1860520	1860525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009482	AC	3	6	1883988	1883993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_009482	GT	3	6	1900590	1900595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009482	GC	3	6	1910371	1910376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_009482	GA	3	6	1933908	1933913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009482	CA	3	6	1952654	1952659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_009482	GA	3	6	1956388	1956393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009482	TC	3	6	1959073	1959078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_009482	TG	3	6	1983929	1983934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009482	CA	3	6	2012777	2012782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_009482	TC	3	6	2023820	2023825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
177	NC_009482	GC	3	6	2023829	2023834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_009482	GA	3	6	2036744	2036749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_009482	TC	3	6	2048533	2048538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_009482	AG	3	6	2049136	2049141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009482	TG	3	6	2064267	2064272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009482	TA	3	6	2064416	2064421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009482	GC	3	6	2097874	2097879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
184	NC_009482	GC	3	6	2102407	2102412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
185	NC_009482	GA	3	6	2121323	2121328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009482	GA	3	6	2121750	2121755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009482	GA	3	6	2122476	2122481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009482	GA	3	6	2123183	2123188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009482	CT	3	6	2123214	2123219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_009482	AG	3	6	2123527	2123532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009482	TC	3	6	2140092	2140097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
192	NC_009482	AG	3	6	2163728	2163733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_009482	CA	4	8	2189711	2189718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
194	NC_009482	AC	3	6	2214862	2214867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.