MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 2537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009482	ACA	2	6	1279788	1279793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_009482	GAG	2	6	1279807	1279812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_009482	TTG	2	6	1279844	1279849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_009482	A	8	8	1281098	1281105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009482	GAGGGC	2	12	1281116	1281127	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1506	NC_009482	AGCTG	2	10	1281138	1281147	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_009482	A	6	6	1282279	1282284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009482	T	6	6	1282342	1282347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_009482	CGG	2	6	1285809	1285814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_009482	TCA	2	6	1285821	1285826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_009482	TC	3	6	1285894	1285899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_009482	TCG	2	6	1285938	1285943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_009482	AAC	2	6	1285955	1285960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_009482	TGG	2	6	1285977	1285982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009482	TGA	2	6	1291199	1291204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_009482	CA	3	6	1291269	1291274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_009482	TCT	2	6	1291278	1291283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_009482	CT	3	6	1305986	1305991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_009482	ATC	2	6	1306126	1306131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_009482	CAA	2	6	1306140	1306145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_009482	A	6	6	1306144	1306149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_009482	GATG	2	8	1306208	1306215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009482	GCC	2	6	1306254	1306259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_009482	ATCA	2	8	1306281	1306288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_009482	TGG	2	6	1306923	1306928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_009482	AAC	2	6	1306953	1306958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_009482	GCC	2	6	1306973	1306978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_009482	C	6	6	1307013	1307018	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1529	NC_009482	AGC	2	6	1307125	1307130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_009482	CAA	2	6	1307166	1307171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_009482	GCC	2	6	1307179	1307184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_009482	GAG	2	6	1307193	1307198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_009482	GCC	2	6	1307512	1307517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_009482	CAG	2	6	1307560	1307565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_009482	AAAG	2	8	1307608	1307615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_009482	CAG	2	6	1313681	1313686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_009482	GTC	2	6	1314775	1314780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_009482	GCT	2	6	1315265	1315270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_009482	CAG	2	6	1315283	1315288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_009482	GAC	2	6	1318687	1318692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_009482	GCA	2	6	1319738	1319743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_009482	CTGG	2	8	1319839	1319846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_009482	CCG	2	6	1319874	1319879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_009482	GCC	2	6	1323101	1323106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_009482	AAG	2	6	1326506	1326511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009482	GCA	2	6	1327813	1327818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_009482	AGC	2	6	1327834	1327839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_009482	A	7	7	1330697	1330703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009482	GGC	2	6	1331849	1331854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_009482	TCCT	2	8	1331973	1331980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_009482	CGA	2	6	1333403	1333408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_009482	CCT	2	6	1333428	1333433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_009482	GAA	2	6	1333451	1333456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009482	GC	3	6	1333488	1333493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_009482	CGGC	2	8	1336038	1336045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_009482	GCA	2	6	1336056	1336061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_009482	GGT	2	6	1336063	1336068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009482	GGC	2	6	1336096	1336101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_009482	CGT	2	6	1336113	1336118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_009482	GGC	2	6	1336226	1336231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_009482	G	6	6	1336255	1336260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_009482	C	6	6	1336280	1336285	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1563	NC_009482	CAA	3	9	1336364	1336372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_009482	CAA	3	9	1336427	1336435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_009482	TCT	2	6	1336467	1336472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_009482	GTC	2	6	1336488	1336493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_009482	AGC	2	6	1336582	1336587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_009482	CCAAG	2	10	1336854	1336863	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1569	NC_009482	CCA	2	6	1337281	1337286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_009482	CGC	2	6	1337620	1337625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_009482	TGG	2	6	1337692	1337697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009482	GC	3	6	1337699	1337704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_009482	TGA	2	6	1340930	1340935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009482	TCC	2	6	1340939	1340944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_009482	CCA	2	6	1340963	1340968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_009482	CAG	2	6	1340971	1340976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_009482	T	8	8	1341058	1341065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009482	AAG	2	6	1343510	1343515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_009482	GCA	2	6	1346208	1346213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_009482	CCA	2	6	1346454	1346459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_009482	GA	3	6	1346500	1346505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_009482	AAC	2	6	1346532	1346537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_009482	GCA	2	6	1346627	1346632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_009482	GC	3	6	1346643	1346648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_009482	GTG	2	6	1346671	1346676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009482	TGG	2	6	1346687	1346692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_009482	TTGC	2	8	1348560	1348567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_009482	CAAA	2	8	1348591	1348598	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_009482	TGC	2	6	1348635	1348640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_009482	GCT	2	6	1348660	1348665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_009482	TTC	2	6	1348697	1348702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_009482	GAC	2	6	1349328	1349333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_009482	AG	3	6	1349337	1349342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009482	TGA	2	6	1350632	1350637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_009482	CGA	2	6	1350793	1350798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_009482	TCA	3	9	1350826	1350834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_009482	CAAA	2	8	1352030	1352037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_009482	T	6	6	1352066	1352071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009482	GTT	2	6	1352073	1352078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009482	GGC	2	6	1353337	1353342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_009482	CTTT	2	8	1353446	1353453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_009482	GCC	2	6	1353492	1353497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_009482	CAG	2	6	1353767	1353772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_009482	GCC	2	6	1353854	1353859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_009482	GCG	2	6	1353962	1353967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_009482	ACTC	2	8	1354039	1354046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_009482	AGG	2	6	1354051	1354056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009482	CCA	2	6	1354103	1354108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_009482	AGC	2	6	1354144	1354149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_009482	CAA	2	6	1354167	1354172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_009482	CAG	2	6	1354176	1354181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_009482	GCG	3	9	1354488	1354496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_009482	TCT	2	6	1355511	1355516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_009482	A	6	6	1355779	1355784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009482	GCT	2	6	1355950	1355955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_009482	AAC	2	6	1355987	1355992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_009482	CCGG	2	8	1356023	1356030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_009482	AGG	2	6	1356036	1356041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_009482	AGCCA	2	10	1356075	1356084	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1620	NC_009482	AATTT	2	10	1356099	1356108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009482	AATT	2	8	1356151	1356158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_009482	CAC	2	6	1357428	1357433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_009482	TGC	2	6	1357957	1357962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_009482	ATT	2	6	1357993	1357998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_009482	TGC	2	6	1358021	1358026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_009482	C	6	6	1364531	1364536	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1627	NC_009482	CCTT	2	8	1366979	1366986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_009482	CAG	2	6	1367002	1367007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_009482	GA	3	6	1368114	1368119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_009482	GTT	2	6	1368237	1368242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_009482	TTA	2	6	1368296	1368301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1763	NC_009482	GCATG	2	10	1538219	1538228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1764	NC_009482	T	6	6	1538291	1538296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1765	NC_009482	CGA	2	6	1538400	1538405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1767	NC_009482	GCAA	2	8	1538458	1538465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1770	NC_009482	GCT	2	6	1539589	1539594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1771	NC_009482	CCAATC	2	12	1539846	1539857	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1775	NC_009482	T	6	6	1540099	1540104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1776	NC_009482	G	6	6	1540955	1540960	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1777	NC_009482	A	6	6	1540974	1540979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1780	NC_009482	CCG	2	6	1541447	1541452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1783	NC_009482	GTG	3	9	1541484	1541492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1784	NC_009482	GC	3	6	1541495	1541500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1785	NC_009482	TCAA	2	8	1541743	1541750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1793	NC_009482	CGG	2	6	1543213	1543218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1796	NC_009482	CGG	2	6	1544123	1544128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1880	NC_009482	A	6	6	1616072	1616077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1881	NC_009482	ACC	2	6	1616086	1616091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1882	NC_009482	CTC	2	6	1617925	1617930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1883	NC_009482	ACAA	2	8	1617934	1617941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1884	NC_009482	TTTG	2	8	1617965	1617972	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1885	NC_009482	G	6	6	1619653	1619658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1886	NC_009482	GCCCG	2	10	1620176	1620185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1887	NC_009482	CTTC	2	8	1621691	1621698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1888	NC_009482	T	7	7	1622180	1622186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1889	NC_009482	T	7	7	1622191	1622197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1890	NC_009482	GGA	2	6	1622199	1622204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1891	NC_009482	A	7	7	1622216	1622222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1892	NC_009482	ACA	2	6	1622253	1622258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1893	NC_009482	AAC	2	6	1622263	1622268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1894	NC_009482	GGCA	2	8	1622775	1622782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1895	NC_009482	CAC	2	6	1622809	1622814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1896	NC_009482	AACC	2	8	1630708	1630715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1897	NC_009482	GCT	2	6	1631876	1631881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1926	NC_009482	CT	3	6	1653755	1653760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1927	NC_009482	AGCCA	2	10	1653761	1653770	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1928	NC_009482	A	6	6	1653832	1653837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1933	NC_009482	GCTT	2	8	1654581	1654588	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1956	NC_009482	TGA	2	6	1658951	1658956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_009482	GCC	2	6	1705068	1705073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1999	NC_009482	GA	3	6	1705118	1705123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_009482	CCAG	2	8	1705184	1705191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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