MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 2537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009482	CGC	2	6	447976	447981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_009482	GC	3	6	447993	447998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_009482	A	6	6	456207	456212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009482	T	6	6	456240	456245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009482	GTT	2	6	456882	456887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009482	A	6	6	458121	458126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009482	TGA	2	6	458133	458138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009482	CA	3	6	458158	458163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_009482	TCA	2	6	458992	458997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_009482	CAG	2	6	459026	459031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_009482	TGA	2	6	459057	459062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009482	GACT	2	8	459707	459714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_009482	GCCT	2	8	460447	460454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
514	NC_009482	TGA	2	6	461067	461072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009482	TGC	2	6	461849	461854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_009482	CGT	2	6	462564	462569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009482	ATCAAC	2	12	462596	462607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009482	GCT	3	9	462617	462625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009482	GGC	2	6	462628	462633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009482	TGGT	2	8	462735	462742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009482	TGG	2	6	462874	462879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009482	T	6	6	463134	463139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009482	GTT	2	6	463151	463156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009482	GCG	3	9	463158	463166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009482	TC	3	6	463852	463857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_009482	TGGC	2	8	463926	463933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
527	NC_009482	GCT	2	6	464647	464652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_009482	GGT	2	6	465038	465043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009482	CAT	2	6	465055	465060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009482	TCC	2	6	465358	465363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_009482	TG	3	6	466278	466283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009482	GCT	2	6	466560	466565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009482	GC	3	6	466568	466573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_009482	CAGG	2	8	466596	466603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_009482	GGC	2	6	466856	466861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_009482	ATGG	2	8	466866	466873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009482	TCA	2	6	466917	466922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009482	TTG	2	6	466945	466950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009482	ACT	2	6	466990	466995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_009482	TGCC	2	8	467057	467064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_009482	CAA	2	6	467088	467093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_009482	CTGG	2	8	467147	467154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_009482	ATC	2	6	467179	467184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009482	CTG	2	6	467205	467210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009482	GTT	2	6	468280	468285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009482	AGAT	2	8	468340	468347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009482	CAG	2	6	468404	468409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009482	ACCC	2	8	468443	468450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
549	NC_009482	GAC	2	6	468507	468512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009482	TCCT	2	8	468518	468525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_009482	CTTG	2	8	468540	468547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_009482	AAGC	2	8	468552	468559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_009482	ACG	2	6	468561	468566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009482	GTT	2	6	468632	468637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009482	CAG	2	6	468737	468742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009482	TGGC	2	8	468749	468756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
557	NC_009482	TCT	2	6	468766	468771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_009482	GGGC	2	8	469301	469308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
559	NC_009482	AGT	2	6	469356	469361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009482	AGA	2	6	469381	469386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009482	TTAT	2	8	469428	469435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009482	CAA	2	6	469441	469446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009482	CATT	2	8	469465	469472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_009482	AAC	2	6	469535	469540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_009482	TTG	2	6	469959	469964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009482	GGT	2	6	470118	470123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009482	T	7	7	470135	470141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009482	CAAGC	2	10	470431	470440	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
569	NC_009482	CTG	3	9	471411	471419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009482	A	6	6	471772	471777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009482	GCT	2	6	471822	471827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009482	GGC	2	6	471873	471878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_009482	AGC	2	6	471911	471916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009482	TGC	2	6	472206	472211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_009482	CTTT	2	8	472272	472279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_009482	TGGG	2	8	472588	472595	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009482	GCC	2	6	472607	472612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_009482	GGT	2	6	472619	472624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009482	GCG	2	6	472662	472667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009482	GCT	2	6	472755	472760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_009482	GATGCG	2	12	472857	472868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
582	NC_009482	GCG	2	6	472894	472899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009482	CGA	2	6	472920	472925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009482	ACCA	2	8	472961	472968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_009482	T	6	6	472994	472999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009482	CACCAG	2	12	473114	473125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
587	NC_009482	TGGTG	2	10	473211	473220	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009482	TTGAT	2	10	473264	473273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009482	AAGC	2	8	473605	473612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_009482	ACT	2	6	473629	473634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_009482	TGATG	2	10	473649	473658	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009482	CGA	2	6	473686	473691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009482	A	6	6	473779	473784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009482	GCT	2	6	473802	473807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_009482	GTG	2	6	473890	473895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009482	AG	3	6	473989	473994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009482	T	6	6	474408	474413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009482	T	7	7	474440	474446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009482	GCT	2	6	474458	474463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_009482	CAC	2	6	474476	474481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_009482	T	6	6	474764	474769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009482	T	6	6	475005	475010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009482	AATTG	2	10	475030	475039	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009482	ACA	2	6	475052	475057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_009482	TCAA	3	12	475133	475144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_009482	AGA	2	6	475182	475187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009482	ACA	2	6	475212	475217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_009482	GACT	2	8	475225	475232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_009482	CCG	2	6	475240	475245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_009482	TGC	2	6	475252	475257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009482	ATC	2	6	475396	475401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009482	CAC	2	6	476318	476323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_009482	TCG	2	6	476355	476360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_009482	CAG	2	6	476369	476374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009482	GCC	2	6	476391	476396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_009482	GCT	2	6	476480	476485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_009482	GCT	2	6	476495	476500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009482	GCT	2	6	476548	476553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009482	TGG	2	6	477576	477581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009482	AAG	2	6	483600	483605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009482	GCA	2	6	485196	485201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009482	CAG	2	6	486676	486681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009482	TGA	2	6	488437	488442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009482	GCG	2	6	489589	489594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_009482	AGC	2	6	489615	489620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_009482	CTG	2	6	489648	489653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_009482	CAG	2	6	491483	491488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_009482	GCTT	2	8	494394	494401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_009482	AAG	2	6	494404	494409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009482	TGT	2	6	494417	494422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009482	GAT	2	6	494488	494493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_009482	TGA	2	6	495130	495135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009482	AATT	2	8	495230	495237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009482	T	6	6	495273	495278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009482	ATTT	2	8	495650	495657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009482	T	6	6	495675	495680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009482	TCTG	2	8	495717	495724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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