MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 3014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009481	GT	3	6	1198686	1198691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_009481	GGAA	2	8	1198705	1198712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_009481	CGA	2	6	1198777	1198782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_009481	AGAA	2	8	1198819	1198826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009481	AC	3	6	1198857	1198862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_009481	TAA	2	6	1199645	1199650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_009481	T	6	6	1199678	1199683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009481	TGC	2	6	1199730	1199735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_009481	CAT	2	6	1203380	1203385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_009481	CTTT	2	8	1203386	1203393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_009481	TTG	2	6	1203398	1203403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009481	GTG	2	6	1204289	1204294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009481	TTG	2	6	1204329	1204334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009481	TGAA	2	8	1204338	1204345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009481	TTCA	2	8	1204359	1204366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_009481	GA	3	6	1204374	1204379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009481	AAGC	2	8	1204388	1204395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_009481	CCGTCT	2	12	1205329	1205340	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_009481	T	6	6	1205408	1205413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009481	GCG	2	6	1205431	1205436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_009481	C	6	6	1207342	1207347	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1522	NC_009481	CAGGG	2	10	1207805	1207814	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_009481	TGA	2	6	1207854	1207859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_009481	G	6	6	1210052	1210057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009481	CTT	2	6	1213440	1213445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_009481	GTT	2	6	1213451	1213456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009481	G	7	7	1213467	1213473	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009481	CAA	2	6	1213520	1213525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_009481	AGC	2	6	1214926	1214931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_009481	ATG	2	6	1214941	1214946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009481	AAG	2	6	1217145	1217150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009481	TGC	2	6	1217215	1217220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_009481	AGTC	2	8	1217236	1217243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_009481	CT	3	6	1222299	1222304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_009481	GCT	2	6	1222308	1222313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_009481	CAC	2	6	1222338	1222343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_009481	GAT	2	6	1223366	1223371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_009481	TTG	2	6	1223372	1223377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_009481	ATTG	2	8	1223420	1223427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009481	GGT	2	6	1223965	1223970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009481	TGA	2	6	1224398	1224403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_009481	AGGAGA	2	12	1226249	1226260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_009481	GCC	2	6	1226279	1226284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_009481	GCG	2	6	1226305	1226310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_009481	ACAG	2	8	1227134	1227141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_009481	A	7	7	1228161	1228167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_009481	G	6	6	1228168	1228173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009481	C	7	7	1228178	1228184	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1549	NC_009481	ATCCG	2	10	1231938	1231947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1550	NC_009481	CCTC	2	8	1234752	1234759	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1551	NC_009481	CAG	2	6	1234763	1234768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_009481	GAC	2	6	1234782	1234787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_009481	TGC	2	6	1239686	1239691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_009481	TGG	2	6	1241163	1241168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_009481	GTG	2	6	1242866	1242871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009481	A	6	6	1243616	1243621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009481	T	6	6	1245443	1245448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009481	TTC	2	6	1245453	1245458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_009481	GCCACG	2	12	1245483	1245494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_009481	CCG	2	6	1246677	1246682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_009481	CCA	2	6	1247017	1247022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_009481	CTG	2	6	1247128	1247133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_009481	GCT	3	9	1247145	1247153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_009481	CCG	2	6	1247155	1247160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_009481	CCCA	2	8	1247212	1247219	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1566	NC_009481	TGG	2	6	1247222	1247227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_009481	TGA	2	6	1247237	1247242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_009481	CGT	2	6	1247263	1247268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_009481	GTC	2	6	1248787	1248792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_009481	CGAT	2	8	1249900	1249907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_009481	TGC	2	6	1252399	1252404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_009481	TCTG	2	8	1252972	1252979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_009481	ACC	2	6	1252982	1252987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_009481	TTCA	2	8	1253058	1253065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_009481	T	6	6	1253691	1253696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_009481	CG	3	6	1253709	1253714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_009481	GTGAG	2	10	1253715	1253724	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009481	TGC	2	6	1257428	1257433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_009481	CAG	2	6	1257509	1257514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_009481	AAGC	2	8	1257527	1257534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_009481	CAG	3	9	1257542	1257550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_009481	CCATC	2	10	1259731	1259740	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1583	NC_009481	CAG	2	6	1259750	1259755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_009481	GTG	2	6	1260461	1260466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009481	CTG	2	6	1260473	1260478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_009481	GCC	2	6	1260546	1260551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_009481	GGA	2	6	1260609	1260614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009481	GTGCG	2	10	1260648	1260657	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_009481	ACC	2	6	1260742	1260747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_009481	TCGCTT	2	12	1260750	1260761	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_009481	CTGCC	2	10	1262618	1262627	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1592	NC_009481	GAT	2	6	1262669	1262674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009481	CAG	2	6	1262695	1262700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_009481	CAA	2	6	1262706	1262711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_009481	CAT	2	6	1263986	1263991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_009481	TGT	3	9	1263992	1264000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009481	AGC	2	6	1266550	1266555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_009481	A	6	6	1266559	1266564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009481	AGG	2	6	1270650	1270655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009481	AG	3	6	1270685	1270690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_009481	TCC	2	6	1271280	1271285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_009481	GTT	2	6	1271509	1271514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_009481	CAA	2	6	1273458	1273463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_009481	CAA	2	6	1273481	1273486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_009481	TTG	2	6	1273581	1273586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009481	TCCT	2	8	1273686	1273693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_009481	TCG	3	9	1273707	1273715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_009481	GTG	2	6	1273812	1273817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_009481	ACG	2	6	1273823	1273828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_009481	GGCC	2	8	1274213	1274220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_009481	AGC	2	6	1275295	1275300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_009481	ACT	2	6	1276439	1276444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_009481	ATG	2	6	1277416	1277421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_009481	GCTT	2	8	1277440	1277447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_009481	CTGA	2	8	1278679	1278686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_009481	CAT	2	6	1279504	1279509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_009481	GTC	2	6	1281637	1281642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_009481	CAG	2	6	1281679	1281684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_009481	TGC	2	6	1287147	1287152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_009481	GCA	2	6	1291972	1291977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_009481	CAG	2	6	1292005	1292010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_009481	GGC	2	6	1294813	1294818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_009481	AGC	2	6	1296314	1296319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_009481	AACC	2	8	1296345	1296352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_009481	CTTG	2	8	1296388	1296395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_009481	CGA	2	6	1298339	1298344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_009481	GAC	3	9	1298369	1298377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_009481	GAGCCA	2	12	1300871	1300882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_009481	GT	3	6	1300883	1300888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_009481	CA	3	6	1300898	1300903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1872	NC_009481	CGAT	2	8	1516261	1516268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1890	NC_009481	AGC	2	6	1527441	1527446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1891	NC_009481	CGA	3	9	1527453	1527461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1892	NC_009481	CTC	2	6	1527500	1527505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1893	NC_009481	GCA	2	6	1527506	1527511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1894	NC_009481	TATCA	2	10	1527568	1527577	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1895	NC_009481	CAT	2	6	1527602	1527607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1896	NC_009481	GTT	2	6	1527650	1527655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1897	NC_009481	AAG	2	6	1528422	1528427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1898	NC_009481	AGA	2	6	1530365	1530370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1899	NC_009481	GGT	2	6	1530419	1530424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1900	NC_009481	TGG	2	6	1530427	1530432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1901	NC_009481	AGCG	2	8	1530434	1530441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1902	NC_009481	TGG	2	6	1530442	1530447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1903	NC_009481	CAG	2	6	1530473	1530478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1904	NC_009481	GTG	2	6	1530492	1530497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1905	NC_009481	AGC	2	6	1530797	1530802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1911	NC_009481	CAG	2	6	1531261	1531266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1913	NC_009481	GCC	2	6	1531304	1531309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1914	NC_009481	CTG	2	6	1531338	1531343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1917	NC_009481	TGA	2	6	1531528	1531533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_009481	TC	3	6	1531560	1531565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1919	NC_009481	CAA	4	12	1531633	1531644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1921	NC_009481	TGA	2	6	1532731	1532736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1922	NC_009481	CAC	2	6	1533537	1533542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1925	NC_009481	A	7	7	1533945	1533951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1926	NC_009481	GCT	2	6	1534293	1534298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1928	NC_009481	AGC	2	6	1535170	1535175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1929	NC_009481	CTG	2	6	1535192	1535197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1931	NC_009481	TC	3	6	1535316	1535321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1932	NC_009481	CAT	2	6	1535358	1535363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1933	NC_009481	ATT	2	6	1535457	1535462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_009481	CTATGA	2	12	1535472	1535483	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1935	NC_009481	GC	3	6	1535504	1535509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1936	NC_009481	TCA	2	6	1535558	1535563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1939	NC_009481	ACA	2	6	1535618	1535623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1952	NC_009481	TCG	2	6	1540779	1540784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1955	NC_009481	TGA	2	6	1542112	1542117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1957	NC_009481	AGCA	2	8	1542169	1542176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1958	NC_009481	ATA	2	6	1542198	1542203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_009481	GCCTT	2	10	1542369	1542378	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1960	NC_009481	ACC	2	6	1542404	1542409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1961	NC_009481	TAG	2	6	1542411	1542416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1981	NC_009481	TGC	2	6	1558029	1558034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1982	NC_009481	ATC	2	6	1558999	1559004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1987	NC_009481	CGTC	2	8	1561386	1561393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1988	NC_009481	CCG	2	6	1562752	1562757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1989	NC_009481	AAC	2	6	1562772	1562777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1993	NC_009481	GA	3	6	1566754	1566759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1997	NC_009481	CCA	2	6	1569283	1569288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1998	NC_009481	ACC	2	6	1569289	1569294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1999	NC_009481	AC	3	6	1570264	1570269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_009481	TCC	2	6	1570274	1570279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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