MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 3014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009481	CTC	2	6	852694	852699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_009481	CAG	2	6	852706	852711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_009481	ATTTG	2	10	852756	852765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009481	TG	3	6	852771	852776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009481	ACA	3	9	852802	852810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009481	CCT	2	6	853312	853317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_009481	CAG	2	6	853440	853445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009481	CCT	2	6	853453	853458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_009481	ACTG	2	8	853497	853504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_009481	TGGC	2	8	853518	853525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_009481	ACT	2	6	854145	854150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009481	CCG	2	6	854201	854206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_009481	TAC	2	6	854239	854244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_009481	AGA	2	6	854249	854254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009481	ATT	2	6	854361	854366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009481	GAAA	2	8	854725	854732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009481	AGC	2	6	854801	854806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009481	CAG	2	6	854808	854813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009481	TC	3	6	856471	856476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_009481	CGA	2	6	856519	856524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_009481	TCC	2	6	856562	856567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_009481	AAG	2	6	856642	856647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009481	TCTA	2	8	856676	856683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_009481	ACC	2	6	856699	856704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_009481	GCAG	2	8	856802	856809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_009481	TGG	2	6	856825	856830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009481	AGG	2	6	856844	856849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009481	CTG	2	6	856921	856926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_009481	GAA	2	6	856960	856965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009481	ACTTG	2	10	857173	857182	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_009481	GGC	2	6	857209	857214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009481	ATC	2	6	857308	857313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_009481	GTC	2	6	857331	857336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_009481	CAG	2	6	857366	857371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_009481	CAGGT	2	10	857413	857422	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_009481	GCT	2	6	857437	857442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009481	GTT	2	6	857483	857488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009481	TTC	2	6	857500	857505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009481	AG	3	6	857507	857512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009481	CCG	2	6	857518	857523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_009481	CAA	2	6	857589	857594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009481	A	6	6	857593	857598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009481	ACT	2	6	857718	857723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_009481	TGAT	2	8	857785	857792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009481	TGG	2	6	857813	857818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009481	CAC	2	6	858558	858563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_009481	G	6	6	858601	858606	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009481	TCCCA	2	10	858610	858619	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1049	NC_009481	GTCT	2	8	858629	858636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_009481	CTG	2	6	858881	858886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009481	TCC	2	6	858987	858992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_009481	C	6	6	859000	859005	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1053	NC_009481	GTCG	2	8	859076	859083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_009481	GTT	2	6	859165	859170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009481	CGG	2	6	859178	859183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_009481	CAGG	2	8	859870	859877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_009481	ACG	2	6	859948	859953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_009481	T	7	7	859963	859969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009481	CAA	2	6	859987	859992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009481	CTTT	2	8	859998	860005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_009481	A	6	6	862664	862669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009481	GCA	2	6	862778	862783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_009481	GCT	2	6	862790	862795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009481	ACGA	2	8	862807	862814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_009481	TGT	2	6	862815	862820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009481	CTC	2	6	862864	862869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_009481	GCTC	2	8	862932	862939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_009481	GT	3	6	863000	863005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009481	CAG	2	6	863047	863052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_009481	TCC	2	6	863096	863101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_009481	GCC	2	6	863177	863182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_009481	CGC	2	6	863184	863189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_009481	GCC	2	6	864633	864638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_009481	GCA	2	6	866576	866581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_009481	AGC	2	6	866685	866690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_009481	GTGCA	2	10	867482	867491	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_009481	GTC	2	6	868164	868169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_009481	TGG	2	6	868197	868202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009481	CGT	2	6	868249	868254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_009481	GGC	2	6	868269	868274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_009481	GTT	2	6	868328	868333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009481	GAAA	2	8	868354	868361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009481	TGCC	2	8	868479	868486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_009481	CT	3	6	868499	868504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_009481	CTT	2	6	868548	868553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_009481	CA	3	6	868605	868610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_009481	GCA	2	6	868715	868720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009481	TGC	2	6	868724	868729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_009481	TC	3	6	868733	868738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_009481	GCGTT	2	10	870158	870167	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_009481	GATG	2	8	870175	870182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009481	TGGT	2	8	870266	870273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009481	TGT	2	6	870479	870484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009481	G	6	6	870729	870734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009481	TTG	2	6	870926	870931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009481	TC	3	6	871017	871022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_009481	A	6	6	873172	873177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009481	GTG	2	6	873186	873191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009481	TC	3	6	873903	873908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_009481	GCG	2	6	873915	873920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_009481	GTT	2	6	874156	874161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009481	CCT	2	6	874188	874193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_009481	CA	4	8	874202	874209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_009481	TGT	2	6	874224	874229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009481	AGTG	2	8	874277	874284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009481	CG	3	6	874285	874290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_009481	TCT	2	6	874313	874318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009481	AAC	2	6	874572	874577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009481	ATTC	2	8	874640	874647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_009481	CGA	2	6	874694	874699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009481	CTTG	2	8	874770	874777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_009481	TGA	2	6	874779	874784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009481	AG	3	6	875372	875377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009481	GCT	2	6	875693	875698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_009481	TCA	2	6	875730	875735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_009481	TTG	2	6	875804	875809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009481	TGCC	2	8	875843	875850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_009481	CCTTC	2	10	878805	878814	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1119	NC_009481	ATC	2	6	879119	879124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009481	GAG	2	6	881562	881567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009481	CCCG	2	8	881622	881629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1122	NC_009481	ACC	2	6	881637	881642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_009481	CGT	2	6	881669	881674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009481	GCT	2	6	881678	881683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_009481	ACG	2	6	881712	881717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_009481	TGT	2	6	882074	882079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009481	TGA	2	6	882086	882091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009481	T	8	8	882117	882124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009481	ATA	2	6	882127	882132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009481	GTGC	2	8	887517	887524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_009481	CAG	2	6	887567	887572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_009481	TGG	2	6	887609	887614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009481	TGTT	2	8	887647	887654	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009481	CT	4	8	887660	887667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1136	NC_009481	GCT	2	6	887691	887696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_009481	CTT	2	6	1094042	1094047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_009481	TTC	2	6	1094049	1094054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_009481	CGT	2	6	1097992	1097997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_009481	CTT	2	6	1100230	1100235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_009481	CT	3	6	1100253	1100258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_009481	GGT	2	6	1100377	1100382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_009481	ATC	2	6	1120392	1120397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_009481	T	6	6	1120414	1120419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_009481	TCT	2	6	1122344	1122349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_009481	CCA	2	6	1127808	1127813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1439	NC_009481	TCCC	2	8	1130643	1130650	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1440	NC_009481	TGGG	2	8	1130661	1130668	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_009481	TCG	2	6	1132154	1132159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_009481	T	9	9	1133583	1133591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_009481	TGG	2	6	1133597	1133602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_009481	TGATG	2	10	1143887	1143896	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_009481	AG	3	6	1149518	1149523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_009481	GTGC	2	8	1149544	1149551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1455	NC_009481	G	6	6	1153821	1153826	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1492	NC_009481	CAG	2	6	1196404	1196409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1497	NC_009481	GCTT	2	8	1197440	1197447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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