MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 3014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009481	CTG	2	6	484370	484375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_009481	TGC	2	6	484415	484420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009481	TGGG	2	8	484469	484476	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009481	GTT	2	6	484506	484511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009481	CG	3	6	484517	484522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_009481	ATTT	2	8	484564	484571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009481	A	6	6	489166	489171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009481	TGA	2	6	489189	489194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009481	TAAT	2	8	492843	492850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009481	CTG	3	9	492910	492918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_009481	GTC	2	6	492920	492925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_009481	CAG	2	6	493055	493060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009481	TCA	2	6	493070	493075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009481	CCA	2	6	493094	493099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_009481	T	6	6	494295	494300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009481	CAT	2	6	494315	494320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009481	T	7	7	494344	494350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009481	A	8	8	494400	494407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009481	AAG	2	6	494472	494477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009481	TCT	2	6	495437	495442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_009481	T	6	6	495456	495461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009481	A	6	6	495464	495469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009481	CCCT	2	8	495494	495501	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
524	NC_009481	TCT	2	6	495552	495557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009481	ATC	2	6	495559	495564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009481	GGA	2	6	495588	495593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009481	ACC	2	6	496305	496310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_009481	TTG	2	6	497853	497858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009481	CTG	2	6	498083	498088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009481	A	8	8	499508	499515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009481	TGA	2	6	499539	499544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009481	GA	3	6	500675	500680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009481	A	6	6	500766	500771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_009481	GAAA	2	8	500772	500779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009481	AGG	2	6	502014	502019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009481	GGA	2	6	502063	502068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009481	TC	3	6	503932	503937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_009481	GGT	2	6	504693	504698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009481	TTCG	2	8	504730	504737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_009481	GAGGG	2	10	505509	505518	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009481	GAG	2	6	505526	505531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009481	TGGTG	2	10	505574	505583	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009481	GTG	2	6	507264	507269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009481	TCAA	2	8	508309	508316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_009481	CGTGA	2	10	508333	508342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
546	NC_009481	GCT	2	6	509830	509835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_009481	TCC	2	6	510906	510911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_009481	TGT	2	6	510934	510939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009481	ACA	2	6	511012	511017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009481	CGAT	2	8	511024	511031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_009481	ACTTC	2	10	511054	511063	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
552	NC_009481	GT	3	6	512894	512899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009481	AGC	3	9	512918	512926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009481	TCAA	2	8	513027	513034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_009481	TCG	2	6	515599	515604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009481	CCG	2	6	517594	517599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_009481	A	7	7	518206	518212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009481	CCG	2	6	518215	518220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_009481	GGCT	2	8	520020	520027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_009481	TGC	2	6	520038	520043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009481	G	6	6	520100	520105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009481	CCT	2	6	520828	520833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_009481	GCA	2	6	521715	521720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_009481	TCG	2	6	525024	525029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_009481	GCT	2	6	525076	525081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_009481	GTCT	2	8	530543	530550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_009481	T	7	7	531107	531113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009481	ATCTTG	2	12	531175	531186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
569	NC_009481	TCT	2	6	531188	531193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009481	TCC	2	6	533873	533878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_009481	TGA	2	6	533898	533903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009481	GTTATG	2	12	533980	533991	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009481	G	6	6	534000	534005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009481	GAGAGC	2	12	534036	534047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_009481	TTG	2	6	534209	534214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009481	AGTTG	2	10	534233	534242	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009481	TGA	2	6	534247	534252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009481	CAA	2	6	534284	534289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009481	CAA	2	6	534371	534376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009481	AGG	2	6	534455	534460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009481	GGC	2	6	534580	534585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009481	CGAA	2	8	534605	534612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_009481	AGG	2	6	534662	534667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009481	GAT	2	6	534809	534814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009481	GCA	2	6	534858	534863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_009481	CGC	2	6	534905	534910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_009481	GAA	2	6	534954	534959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009481	CAG	2	6	535003	535008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_009481	ATT	2	6	535044	535049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009481	GGC	2	6	535068	535073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_009481	CTG	2	6	535083	535088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_009481	CAT	2	6	535110	535115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009481	GAA	2	6	535195	535200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009481	CTG	2	6	535220	535225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_009481	ACGC	2	8	535377	535384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
596	NC_009481	GAA	2	6	535458	535463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009481	GGT	2	6	535532	535537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009481	GTC	2	6	535546	535551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_009481	TCGTG	2	10	535555	535564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
600	NC_009481	AG	3	6	535635	535640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009481	CCG	2	6	535642	535647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_009481	GGA	2	6	535658	535663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009481	TCA	2	6	535683	535688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_009481	AC	3	6	535709	535714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_009481	TAC	2	6	535716	535721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_009481	AGC	2	6	535738	535743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_009481	AGG	2	6	535817	535822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009481	AC	3	6	535878	535883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_009481	GAG	2	6	535939	535944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009481	TGA	2	6	535962	535967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009481	CCT	2	6	536019	536024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_009481	ACAA	2	8	536034	536041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_009481	TGG	2	6	536150	536155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009481	GGT	2	6	536226	536231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009481	TTG	2	6	536489	536494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009481	GAT	2	6	536617	536622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009481	GAT	2	6	536625	536630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009481	GAT	2	6	536651	536656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009481	CGG	2	6	536829	536834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009481	CA	3	6	536844	536849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_009481	TAG	2	6	536997	537002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009481	GGA	2	6	537005	537010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009481	GCG	2	6	537039	537044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_009481	ACTGA	2	10	537173	537182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
625	NC_009481	ACC	2	6	537239	537244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_009481	TG	3	6	537264	537269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009481	GGGAG	2	10	537315	537324	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009481	GAA	2	6	537396	537401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009481	TGG	2	6	537443	537448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009481	AGCT	2	8	537627	537634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_009481	CAG	2	6	537676	537681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_009481	G	6	6	537681	537686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009481	CCA	2	6	537692	537697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_009481	TG	3	6	537751	537756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009481	AGG	2	6	537854	537859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009481	AGG	2	6	537879	537884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009481	AGC	2	6	537895	537900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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639	NC_009481	AGCCA	2	10	538246	538255	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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772	NC_009481	CA	3	6	655908	655913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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