MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009442	AT	3	6	17680	17685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009442	CT	3	6	17711	17716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009442	AC	3	6	18201	18206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009442	AC	3	6	18370	18375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009442	AG	3	6	19275	19280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009442	CT	3	6	19389	19394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009442	TC	3	6	19767	19772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009442	TG	3	6	20158	20163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009442	GA	3	6	20309	20314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009442	GA	3	6	20604	20609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009442	CT	3	6	20720	20725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009442	GA	3	6	20927	20932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009442	GA	3	6	21742	21747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009442	TA	3	6	22946	22951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009442	AT	3	6	23037	23042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009442	AT	3	6	23563	23568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009442	TA	3	6	26319	26324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009442	AT	3	6	26337	26342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009442	TG	3	6	30661	30666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009442	AC	3	6	46565	46570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009442	TA	3	6	52717	52722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009442	TC	3	6	55203	55208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009442	AT	3	6	55371	55376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009442	CT	3	6	56689	56694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009442	CA	3	6	58381	58386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009442	CA	3	6	65419	65424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009442	GT	3	6	68883	68888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009442	GA	3	6	71653	71658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009442	GA	3	6	78744	78749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009442	AC	3	6	78815	78820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009442	CA	3	6	79138	79143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009442	CA	3	6	79220	79225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009442	AG	3	6	84569	84574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009442	TA	3	6	87405	87410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009442	AT	3	6	88469	88474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009442	CT	3	6	88500	88505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009442	AC	3	6	88990	88995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009442	AC	3	6	89159	89164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009442	AG	3	6	90064	90069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009442	CT	3	6	90178	90183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009442	TC	3	6	90556	90561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009442	TG	3	6	90947	90952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009442	GA	3	6	91098	91103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009442	GA	3	6	91394	91399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009442	CT	3	6	91510	91515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009442	GA	3	6	91717	91722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009442	GA	3	6	92532	92537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009442	GA	3	6	93446	93451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009442	CT	4	8	93515	93522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009442	GT	3	6	110348	110353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009442	TA	3	6	110525	110530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009442	TG	3	6	110551	110556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009442	TC	4	8	118163	118170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009442	AT	4	8	118207	118214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009442	AT	3	6	118987	118992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009442	AT	3	6	125707	125712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009442	GT	3	6	125714	125719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009442	AG	3	6	126531	126536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009442	AG	3	6	129060	129065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009442	TC	3	6	135826	135831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009442	AC	3	6	135871	135876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009442	TA	3	6	135920	135925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009442	CA	3	6	139532	139537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009442	TA	3	6	139927	139932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009442	TA	3	6	142704	142709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009442	GA	3	6	146688	146693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009442	GT	3	6	150813	150818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009442	AG	3	6	150983	150988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009442	GA	3	6	159896	159901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009442	TA	3	6	162176	162181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009442	TA	3	6	162294	162299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009442	AG	3	6	172615	172620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009442	GA	3	6	177398	177403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009442	TC	3	6	177693	177698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009442	AT	3	6	178306	178311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009442	AT	3	6	182172	182177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009442	TA	4	8	186514	186521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009442	TA	3	6	188394	188399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009442	AT	4	8	205128	205135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009442	AT	3	6	208733	208738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009442	GA	3	6	208771	208776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009442	TC	3	6	208781	208786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009442	TG	3	6	216548	216553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009442	AT	3	6	217990	217995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009442	CT	4	8	219751	219758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009442	TC	3	6	221876	221881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009442	GA	3	6	222769	222774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009442	TA	3	6	230234	230239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009442	GA	3	6	236174	236179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009442	AT	3	6	242115	242120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009442	TA	3	6	244365	244370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009442	TA	3	6	252407	252412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009442	TA	3	6	255574	255579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009442	TA	3	6	257995	258000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009442	TA	3	6	262940	262945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009442	AT	3	6	266641	266646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009442	TA	3	6	278718	278723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009442	GT	3	6	278806	278811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009442	AG	3	6	283008	283013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009442	AT	3	6	286810	286815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009442	GA	3	6	287107	287112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009442	TG	3	6	301745	301750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009442	AG	3	6	305867	305872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009442	TA	3	6	324055	324060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009442	TA	3	6	324064	324069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009442	TA	4	8	324158	324165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009442	AT	3	6	324433	324438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009442	AT	3	6	325862	325867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009442	TA	3	6	326197	326202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009442	GA	3	6	326327	326332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009442	AG	3	6	326379	326384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009442	TA	3	6	326429	326434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009442	AT	3	6	327404	327409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009442	CT	3	6	327435	327440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009442	AC	3	6	327925	327930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009442	AC	3	6	328094	328099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009442	AG	3	6	328993	328998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009442	CT	3	6	329107	329112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009442	TC	3	6	329485	329490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009442	TG	3	6	329876	329881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009442	GA	3	6	330026	330031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009442	GA	3	6	330322	330327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009442	CT	3	6	330438	330443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009442	GA	3	6	330645	330650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009442	GT	3	6	331403	331408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009442	GA	3	6	331459	331464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009442	AC	3	6	334071	334076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009442	TC	3	6	334533	334538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009442	GA	3	6	337056	337061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009442	TA	3	6	339563	339568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009442	TG	3	6	340262	340267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009442	TA	3	6	340814	340819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009442	AT	3	6	352029	352034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009442	GT	3	6	356576	356581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009442	AG	3	6	357901	357906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009442	TA	3	6	365057	365062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009442	TA	3	6	378853	378858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009442	AG	4	8	379848	379855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009442	GT	3	6	383132	383137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009442	AG	4	8	383353	383360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009442	AT	3	6	383917	383922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009442	TA	3	6	383923	383928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009442	AT	3	6	386588	386593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009442	TA	3	6	400425	400430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009442	GA	3	6	403494	403499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009442	TA	3	6	411878	411883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009442	TA	3	6	420476	420481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009442	AT	3	6	421451	421456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009442	CT	3	6	421482	421487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009442	AC	3	6	421972	421977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_009442	AC	3	6	422141	422146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009442	AG	3	6	423046	423051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009442	CT	3	6	423160	423165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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