MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009332	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009332	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009332	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009332	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009332	ACTA	2	8	15028	15035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009332	TACT	2	8	16546	16553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009332	AAAT	2	8	16990	16997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009332	ACCT	2	8	17164	17171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009332	GTGA	2	8	17445	17452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009332	TAAC	2	8	17528	17535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009332	AGCG	2	8	17616	17623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009332	TGGT	2	8	18281	18288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009332	AGCC	2	8	18498	18505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009332	AGCG	2	8	18844	18851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009332	GTAA	2	8	19094	19101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009332	ACTA	2	8	19136	19143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009332	GAAG	2	8	19176	19183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009332	GCGA	2	8	19250	19257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009332	ATTC	2	8	20116	20123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009332	CTAA	2	8	20472	20479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009332	TAGG	2	8	21127	21134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009332	TTGG	2	8	21310	21317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009332	AATC	2	8	21319	21326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009332	AAAT	2	8	22991	22998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009332	ACCT	2	8	23165	23172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009332	GTGA	2	8	23446	23453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009332	TAAC	2	8	23529	23536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009332	AGCG	2	8	23617	23624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009332	TGGT	2	8	24282	24289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009332	AGCC	2	8	24499	24506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009332	AGCG	2	8	24845	24852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009332	GTAA	2	8	25095	25102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009332	ACTA	2	8	25137	25144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009332	GAAG	2	8	25177	25184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009332	GCGA	2	8	25251	25258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009332	ATTC	2	8	26117	26124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009332	CTAA	2	8	26473	26480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009332	TAGG	2	8	27128	27135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009332	TTGG	2	8	27311	27318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009332	AATC	2	8	27320	27327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009332	GCGT	2	8	29167	29174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009332	GTTA	2	8	29851	29858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009332	ATTC	2	8	30650	30657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009332	ATTA	2	8	33424	33431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009332	AGAA	2	8	35770	35777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009332	TTAT	2	8	35805	35812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009332	GGTT	2	8	36279	36286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009332	TTGA	2	8	36306	36313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009332	GGAA	2	8	36506	36513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009332	TAGT	2	8	43114	43121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009332	AAAG	2	8	43868	43875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009332	TCCA	2	8	44186	44193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009332	GCTA	2	8	45003	45010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009332	CCAA	2	8	45177	45184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009332	AACC	2	8	45297	45304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009332	AAAC	2	8	45483	45490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009332	TAAT	2	8	46899	46906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009332	AGAA	2	8	48294	48301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009332	TTTA	2	8	53870	53877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009332	GATT	2	8	55140	55147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009332	AAAG	2	8	57930	57937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009332	ATTT	2	8	60983	60990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009332	ATCA	2	8	64713	64720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009332	TATT	2	8	68031	68038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009332	TAAA	2	8	71693	71700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009332	TTAA	2	8	71933	71940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009332	TATT	2	8	76445	76452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009332	AAAT	2	8	81615	81622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009332	ACCT	2	8	81789	81796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009332	GTGA	2	8	82070	82077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009332	TAAC	2	8	82153	82160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009332	AGCG	2	8	82241	82248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009332	TGGT	2	8	82906	82913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009332	AGCC	2	8	83123	83130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009332	AGCG	2	8	83469	83476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009332	GTAA	2	8	83719	83726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009332	ACTA	2	8	83761	83768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009332	GAAG	2	8	83801	83808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009332	GCGA	2	8	83875	83882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009332	ATTC	2	8	84741	84748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009332	CTAA	2	8	85097	85104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009332	TAGG	2	8	85752	85759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009332	TTGG	2	8	85935	85942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009332	AATC	2	8	85944	85951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009332	GCGT	2	8	87173	87180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009332	TGAT	2	8	88521	88528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009332	GTTC	2	8	88533	88540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009332	AAAT	2	8	88560	88567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009332	TGGT	2	8	88581	88588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009332	CAAT	2	8	88695	88702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009332	TTGC	2	8	89104	89111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009332	AAAC	2	8	89468	89475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009332	ATTT	2	8	91606	91613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009332	CATC	2	8	91728	91735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009332	CAAT	2	8	99537	99544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009332	GTTA	2	8	109870	109877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009332	TAAG	2	8	112332	112339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009332	ATTA	2	8	119154	119161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009332	CTTG	2	8	123934	123941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009332	TGAT	2	8	123993	124000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009332	AAAG	2	8	125431	125438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009332	AAAT	2	8	125479	125486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009332	ATCG	2	8	127761	127768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009332	CTTT	2	8	128642	128649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009332	TAAA	2	8	128897	128904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009332	GTCA	2	8	134043	134050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009332	TATC	2	8	134810	134817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009332	TTAG	2	8	141779	141786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009332	GCTT	2	8	145763	145770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009332	GAAA	2	8	148034	148041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009332	CCTG	2	8	148254	148261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009332	TAGT	2	8	149748	149755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009332	ACAA	2	8	151834	151841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009332	AAAG	2	8	156196	156203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009332	TAGC	2	8	156309	156316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009332	AAAT	2	8	157139	157146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009332	AAAT	2	8	157209	157216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009332	GGAT	2	8	166776	166783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009332	AGTC	2	8	168595	168602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009332	ATAG	2	8	176159	176166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009332	CGTG	2	8	176640	176647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009332	TAAA	2	8	177160	177167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009332	ATGG	2	8	177235	177242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009332	AAGA	2	8	180670	180677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009332	TTTA	2	8	184182	184189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009332	CATA	2	8	185486	185493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009332	AAAT	2	8	185672	185679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009332	GAAA	2	8	185714	185721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009332	ATTT	2	8	185896	185903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009332	AGTA	2	8	186078	186085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009332	TAGA	2	8	186417	186424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009332	GATT	2	8	189817	189824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009332	AGGG	2	8	189945	189952	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009332	AGTG	2	8	191043	191050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009332	CTTT	2	8	197374	197381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009332	CAAG	2	8	197400	197407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009332	GGGA	2	8	198824	198831	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009332	ACCG	2	8	200283	200290	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009332	ACAA	2	8	200998	201005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009332	TTGA	2	8	205250	205257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009332	TCTT	2	8	205376	205383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009332	TTTA	3	12	205660	205671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009332	CAAT	2	8	205779	205786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009332	TAAA	2	8	207209	207216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009332	CAAT	2	8	207244	207251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009332	TCAA	2	8	207259	207266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009332	TTTG	2	8	207348	207355	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009332	TAGT	2	8	209756	209763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009332	GTTT	2	8	209801	209808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009332	AAAT	2	8	209937	209944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009332	TAAA	2	8	214368	214375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009332	CATA	2	8	214421	214428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009332	TTTG	2	8	214484	214491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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