MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009140	AGAT	2	8	178	185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009140	AGAT	2	8	271	278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009140	AAAG	2	8	2267	2274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009140	CAGG	2	8	2331	2338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009140	AATA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009140	ATCC	2	8	5204	5211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009140	TGGT	2	8	6845	6852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009140	GAAG	2	8	13300	13307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009140	TGGA	2	8	13468	13475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009140	AAAC	2	8	14049	14056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009140	CTTA	2	8	15413	15420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009140	AGTA	2	8	15493	15500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009140	TGGC	2	8	16259	16266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009140	TTCA	2	8	17919	17926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009140	CTTT	2	8	18964	18971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009140	CTGG	2	8	22800	22807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009140	GGCA	2	8	22822	22829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009140	TGTA	2	8	22871	22878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009140	CTGG	2	8	27084	27091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009140	GGCA	2	8	27106	27113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009140	TGTA	2	8	27155	27162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009140	GTTT	2	8	33064	33071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009140	CCTG	2	8	36243	36250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009140	TTAT	2	8	36469	36476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009140	AGAT	2	8	42132	42139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009140	GCGA	2	8	42166	42173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009140	TTCA	2	8	54154	54161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009140	GAAA	2	8	59051	59058	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009140	TTAA	2	8	59839	59846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009140	AAAG	2	8	60004	60011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009140	TGAT	2	8	60544	60551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009140	GGGA	2	8	67198	67205	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009140	CTGT	2	8	67344	67351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009140	GAAA	2	8	68778	68785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009140	ATAC	2	8	70384	70391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009140	CTGT	2	8	70415	70422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009140	GAAA	2	8	70683	70690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009140	TTCT	2	8	73545	73552	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009140	ACAG	2	8	74978	74985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009140	CTCC	2	8	75123	75130	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_009140	AAAC	2	8	92486	92493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009140	AGGG	2	8	93115	93122	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009140	AAAC	2	8	93530	93537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009140	AAAC	2	8	98365	98372	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009140	AAAC	2	8	102197	102204	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009140	CAAA	2	8	106610	106617	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009140	GCTG	2	8	110381	110388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009140	AAAC	2	8	110393	110400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009140	CAAA	2	8	113584	113591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009140	CCAA	2	8	113856	113863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009140	AAAC	2	8	116650	116657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009140	CAGC	2	8	116874	116881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009140	ATGA	2	8	119990	119997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009140	TAAA	2	8	121094	121101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009140	TTTC	2	8	124208	124215	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009140	TCAA	2	8	124696	124703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009140	CAAG	2	8	130196	130203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009140	ACCC	2	8	135942	135949	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_009140	CTGC	2	8	140886	140893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009140	TTTA	2	8	148288	148295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009140	CTCC	2	8	148308	148315	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009140	CAAG	2	8	149565	149572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009140	CATA	2	8	156284	156291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009140	CAAG	2	8	156342	156349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009140	TAAA	2	8	157409	157416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009140	ACCA	2	8	171440	171447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009140	CAAA	2	8	172034	172041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009140	GTAC	2	8	174426	174433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009140	AAGG	2	8	174486	174493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009140	TTGC	2	8	176335	176342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.