MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 1829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009092	TTGG	2	8	17284	17291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009092	TACT	2	8	19719	19726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009092	TTCC	2	8	21025	21032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009092	CCAC	2	8	23218	23225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009092	ATTA	2	8	27932	27939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009092	CAGC	2	8	27980	27987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009092	CTTG	2	8	28769	28776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009092	TTAT	2	8	31109	31116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009092	ATGG	2	8	31971	31978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009092	TTAT	2	8	37748	37755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009092	AAGG	2	8	40695	40702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009092	CGCC	2	8	43319	43326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009092	GTAA	2	8	43348	43355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009092	AAAC	2	8	47043	47050	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009092	TCTA	2	8	51349	51356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009092	TACT	2	8	58200	58207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009092	CTCG	2	8	58284	58291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009092	TTGT	2	8	59170	59177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009092	TATT	2	8	86529	86536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009092	TGCT	2	8	86557	86564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009092	TTAT	2	8	86769	86776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009092	CTGC	2	8	88386	88393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009092	GAAT	2	8	96953	96960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009092	TCTG	2	8	99560	99567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009092	GAAA	2	8	101548	101555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009092	TTAA	2	8	110907	110914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009092	ATGA	2	8	111302	111309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009092	ATTT	2	8	111996	112003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009092	CCCA	2	8	112128	112135	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_009092	GAGT	2	8	127728	127735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009092	TGCT	2	8	140951	140958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009092	TAGC	2	8	147812	147819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009092	AGTC	2	8	150773	150780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009092	GCCT	2	8	152853	152860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009092	GCGA	2	8	153394	153401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009092	AACT	2	8	153487	153494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009092	CTGA	2	8	153573	153580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009092	CGTC	2	8	154098	154105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009092	AAAG	2	8	154221	154228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009092	GTAG	2	8	154613	154620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009092	ATTG	2	8	154990	154997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009092	TTGA	2	8	156098	156105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009092	TGCA	2	8	156373	156380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009092	CATT	2	8	156817	156824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009092	CATC	2	8	156893	156900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009092	TCCT	2	8	157061	157068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009092	GACA	2	8	157173	157180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009092	ATCT	2	8	159219	159226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009092	TTAG	2	8	160631	160638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009092	AGCC	2	8	160746	160753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009092	TTAA	2	8	160816	160823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009092	TGTA	2	8	160861	160868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009092	TGCT	2	8	162251	162258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009092	TAAA	2	8	163299	163306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009092	AGAT	2	8	164718	164725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009092	GTAA	2	8	164750	164757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009092	TAAA	2	8	165338	165345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009092	TAAG	2	8	174888	174895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009092	CTAT	2	8	184222	184229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009092	CAGA	2	8	199134	199141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009092	AGTA	2	8	203034	203041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009092	GCTT	2	8	203481	203488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009092	GCGA	2	8	205440	205447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009092	AACT	2	8	205533	205540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009092	CTGA	2	8	205619	205626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009092	CGTC	2	8	206144	206151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009092	AAAG	2	8	206267	206274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009092	GTAG	2	8	206659	206666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009092	ATTG	2	8	207036	207043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009092	TTGA	2	8	208145	208152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009092	TACC	2	8	209192	209199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009092	GGAT	2	8	209231	209238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009092	AATC	2	8	213769	213776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009092	AATC	2	8	220791	220798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009092	GCTG	2	8	241476	241483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009092	GGCA	2	8	242398	242405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009092	GTTT	2	8	242830	242837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009092	TGAA	2	8	247101	247108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009092	GGAG	2	8	254398	254405	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009092	ACGA	2	8	261421	261428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009092	ATAA	2	8	261604	261611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009092	GGAT	2	8	267692	267699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009092	CTAT	2	8	267767	267774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009092	GTAG	2	8	269922	269929	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009092	TTAT	2	8	269957	269964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009092	TCAG	2	8	274538	274545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009092	TAGC	2	8	279243	279250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009092	GAAA	2	8	280537	280544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009092	CTTG	2	8	284857	284864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009092	GCGT	2	8	285849	285856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009092	AGTT	2	8	287560	287567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009092	TTGA	2	8	291050	291057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009092	GAGC	2	8	291170	291177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009092	TGTT	2	8	294465	294472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009092	CAGG	2	8	297266	297273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009092	AGTG	2	8	297342	297349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009092	AGGG	2	8	297384	297391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009092	GAAA	2	8	301869	301876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009092	AGGT	2	8	304508	304515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009092	CAAA	2	8	308303	308310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009092	ACAG	2	8	310491	310498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009092	GTAA	2	8	315066	315073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009092	CAAC	2	8	317347	317354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009092	GGCT	2	8	321823	321830	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009092	GACC	2	8	321908	321915	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009092	ATGG	2	8	326539	326546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009092	AGGC	2	8	331977	331984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009092	AGTG	2	8	332347	332354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009092	TAAT	2	8	360455	360462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009092	TAAA	2	8	360511	360518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009092	CGCC	2	8	367672	367679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_009092	CAGA	2	8	367801	367808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009092	GTCA	2	8	372644	372651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009092	CAGT	2	8	372680	372687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009092	GATA	2	8	373368	373375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009092	GATT	2	8	374303	374310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009092	TTGT	2	8	376858	376865	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009092	TTGT	2	8	376951	376958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009092	ATCT	2	8	377855	377862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009092	TTTG	2	8	393192	393199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009092	CGGG	2	8	393249	393256	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009092	GTCT	2	8	396398	396405	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009092	AATT	2	8	396726	396733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009092	TGAG	2	8	406428	406435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009092	ATTT	2	8	408667	408674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009092	GCTA	2	8	413224	413231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009092	CTTT	2	8	413638	413645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009092	GCTT	2	8	420143	420150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009092	TGCC	2	8	423328	423335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009092	TAAA	2	8	427777	427784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009092	GGAA	2	8	431137	431144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009092	TGAT	2	8	436094	436101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009092	ATCC	2	8	436178	436185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009092	TGAG	2	8	456219	456226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009092	GCTT	2	8	464409	464416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009092	AGCG	2	8	481807	481814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009092	TTTG	2	8	481847	481854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009092	GGCT	2	8	484035	484042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009092	CTTG	2	8	485504	485511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009092	TTAA	2	8	493085	493092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009092	TTAT	2	8	493170	493177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009092	TGGT	2	8	494889	494896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009092	ATAG	2	8	494910	494917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009092	GGGC	2	8	497115	497122	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009092	TAAT	2	8	497939	497946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009092	CCCG	2	8	501006	501013	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_009092	CTTG	2	8	504463	504470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009092	GGCT	2	8	512184	512191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009092	GCCA	2	8	519258	519265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009092	GTGA	2	8	521394	521401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009092	GTGA	2	8	531346	531353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_009092	AAAT	2	8	1366277	1366284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_009092	TTCG	2	8	1383618	1383625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_009092	CGGT	2	8	1407844	1407851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_009092	TGTC	2	8	1410640	1410647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_009092	GAAT	2	8	1410668	1410675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_009092	CCTG	2	8	1410719	1410726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_009092	CTTT	2	8	1412649	1412656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_009092	ATTG	2	8	1415452	1415459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_009092	ACTG	2	8	1415509	1415516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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