MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009092	T	6	6	446026	446031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009092	T	6	6	447809	447814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009092	GA	3	6	447824	447829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009092	TTA	2	6	447873	447878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009092	ATG	2	6	452880	452885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009092	ATA	2	6	452911	452916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009092	G	6	6	452931	452936	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009092	ATTTTT	2	12	452955	452966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009092	GCA	2	6	454062	454067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009092	ATG	2	6	454102	454107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009092	CGC	2	6	454111	454116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_009092	GTT	2	6	456170	456175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009092	TGAG	2	8	456219	456226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009092	AG	3	6	462827	462832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009092	CGT	2	6	464295	464300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009092	AG	3	6	464356	464361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009092	CAA	2	6	464402	464407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009092	GCTT	2	8	464409	464416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_009092	TGG	2	6	469203	469208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009092	A	6	6	469753	469758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009092	TGCTA	2	10	469857	469866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_009092	T	6	6	471298	471303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009092	TCA	2	6	471339	471344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_009092	TA	3	6	471352	471357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009092	AT	4	8	471367	471374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009092	AT	3	6	471383	471388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009092	GAG	2	6	471395	471400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009092	AT	3	6	475143	475148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009092	AGT	2	6	475561	475566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009092	TGT	2	6	476069	476074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009092	TTC	2	6	476601	476606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009092	CGC	2	6	476618	476623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_009092	TC	3	6	476635	476640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_009092	GCT	2	6	476664	476669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_009092	ACG	2	6	476748	476753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_009092	TTGAA	2	10	478160	478169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009092	T	7	7	478189	478195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009092	GAA	2	6	481303	481308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009092	CG	3	6	481478	481483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_009092	AGG	2	6	481485	481490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009092	AGCG	2	8	481807	481814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_009092	TTTG	2	8	481847	481854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009092	AAT	2	6	481961	481966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009092	CTT	2	6	482709	482714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009092	TGT	2	6	482740	482745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009092	TTTAT	2	10	482819	482828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009092	AGG	2	6	482881	482886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009092	A	7	7	482893	482899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009092	AGG	2	6	482909	482914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009092	T	6	6	482915	482920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009092	TCT	2	6	483223	483228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009092	GAG	2	6	483432	483437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009092	CTG	2	6	484022	484027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_009092	GGCT	2	8	484035	484042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_009092	GCAGG	2	10	484100	484109	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_009092	A	6	6	485126	485131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009092	CAAAT	2	10	485136	485145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_009092	GGC	2	6	485166	485171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_009092	TAG	2	6	485497	485502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009092	CTTG	2	8	485504	485511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_009092	ATG	2	6	485612	485617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009092	AGG	2	6	485723	485728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009092	GGCCA	2	10	488081	488090	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1064	NC_009092	TCTGC	2	10	489428	489437	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_009092	GA	3	6	489484	489489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009092	GCT	2	6	493021	493026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_009092	T	6	6	493040	493045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009092	TAA	2	6	493050	493055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009092	TTAA	2	8	493085	493092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009092	T	7	7	493158	493164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009092	TTAT	2	8	493170	493177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009092	TGGT	2	8	494889	494896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009092	CTT	2	6	494898	494903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_009092	ATAG	2	8	494910	494917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009092	T	6	6	494943	494948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009092	TGA	2	6	494951	494956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_009092	CTT	2	6	494988	494993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_009092	CGG	2	6	496725	496730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_009092	GGGC	2	8	497115	497122	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_009092	GAT	3	9	497138	497146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009092	TCA	2	6	497174	497179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_009092	TG	3	6	497191	497196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009092	CGA	2	6	497237	497242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_009092	A	6	6	497343	497348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_009092	AG	3	6	497358	497363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009092	GCC	2	6	497406	497411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_009092	TGA	2	6	497478	497483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009092	TCA	2	6	497573	497578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1098	NC_009092	T	6	6	501015	501020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009092	AGC	2	6	501024	501029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_009092	CTG	2	6	501145	501150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_009092	GA	3	6	501936	501941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009092	CAT	2	6	502384	502389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_009092	ATT	2	6	504438	504443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009092	AGA	2	6	504444	504449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009092	CTTG	2	8	504463	504470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_009092	TTA	2	6	504645	504650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_009092	A	6	6	504708	504713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009092	TCT	2	6	504762	504767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009092	GAG	2	6	504803	504808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_009092	AAG	2	6	506300	506305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009092	AAG	2	6	506314	506319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009092	AGA	2	6	507300	507305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009092	ATG	2	6	510330	510335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_009092	CCA	2	6	510443	510448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_009092	TTG	2	6	510538	510543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_009092	GGC	2	6	512036	512041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_009092	GAC	2	6	512135	512140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009092	GGCT	2	8	512184	512191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_009092	ATG	2	6	512213	512218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009092	CGC	2	6	512219	512224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_009092	T	6	6	516010	516015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009092	CAA	2	6	516036	516041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009092	ATG	2	6	516055	516060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009092	ATT	2	6	516069	516074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009092	ATA	2	6	516132	516137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009092	AAC	2	6	516142	516147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_009092	TC	3	6	516152	516157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_009092	T	6	6	518622	518627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009092	CGG	2	6	518649	518654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_009092	GCCA	2	8	519258	519265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1137	NC_009092	TGC	2	6	519378	519383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1413	NC_009092	T	6	6	648748	648753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_009092	T	7	7	649908	649914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_009092	A	6	6	663323	663328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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