MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009092	TTG	2	6	204964	204969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009092	CA	3	6	204976	204981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_009092	CTTGTT	2	12	204987	204998	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
504	NC_009092	CGA	2	6	205020	205025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_009092	TAA	2	6	205059	205064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009092	ATT	2	6	205072	205077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009092	AAT	2	6	205084	205089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009092	AC	3	6	205102	205107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_009092	TGCGA	2	10	205158	205167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
510	NC_009092	GTA	2	6	205252	205257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009092	TCA	2	6	205339	205344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_009092	TAG	2	6	205432	205437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009092	GCGA	2	8	205440	205447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
514	NC_009092	AACT	2	8	205533	205540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_009092	G	6	6	205589	205594	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009092	TCC	2	6	205599	205604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_009092	CTGA	2	8	205619	205626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_009092	GGA	2	6	205909	205914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009092	AC	3	6	205919	205924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_009092	TGA	2	6	205943	205948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009092	TAC	2	6	206113	206118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_009092	AC	3	6	206126	206131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_009092	CGTC	2	8	206144	206151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_009092	AAC	2	6	206163	206168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009092	AGC	2	6	206253	206258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009092	CAT	2	6	206259	206264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_009092	AAAG	2	8	206267	206274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009092	AGTCG	2	10	206289	206298	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
529	NC_009092	TGAAGG	2	12	206394	206405	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009092	CCT	2	6	206473	206478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_009092	GA	3	6	206606	206611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009092	AGGCT	2	10	206618	206627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
533	NC_009092	GCG	2	6	206631	206636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009092	GTAG	2	8	206659	206666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009092	TGA	2	6	206704	206709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009092	TGA	2	6	206723	206728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009092	AGT	2	6	206729	206734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009092	TCT	2	6	206757	206762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_009092	TAG	2	6	206774	206779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009092	GGT	2	6	206803	206808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009092	GA	3	6	206833	206838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009092	TGA	2	6	206902	206907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009092	CT	3	6	206914	206919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_009092	ATTG	2	8	207036	207043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009092	CGG	2	6	207084	207089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009092	ATG	2	6	207160	207165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009092	ACC	2	6	207355	207360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_009092	TGG	2	6	207416	207421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009092	TCC	2	6	207442	207447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_009092	GGA	2	6	207459	207464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009092	GGT	2	6	207579	207584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009092	CGG	2	6	207666	207671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_009092	TCA	2	6	207694	207699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009092	CGT	2	6	207774	207779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_009092	GAT	2	6	207814	207819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009092	GCT	2	6	207828	207833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_009092	GT	3	6	208027	208032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009092	TTGA	2	8	208145	208152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009092	AGC	2	6	208165	208170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_009092	ATCCC	2	10	208222	208231	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
561	NC_009092	TCCGC	2	10	208408	208417	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
562	NC_009092	AGC	2	6	208439	208444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009092	T	6	6	208456	208461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009092	TC	3	6	208510	208515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_009092	GCC	2	6	209157	209162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_009092	TACC	2	8	209192	209199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_009092	GGAT	2	8	209231	209238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009092	AATC	2	8	213769	213776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_009092	AATTT	2	10	215040	215049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009092	ATT	2	6	215067	215072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009092	TGT	2	6	215085	215090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009092	ATT	2	6	215122	215127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009092	A	6	6	215147	215152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_009092	TAA	2	6	219329	219334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_009092	AATC	2	8	220791	220798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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584	NC_009092	A	6	6	220853	220858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009092	GACTG	2	10	220905	220914	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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588	NC_009092	A	7	7	223606	223612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009092	CTAAT	2	10	223672	223681	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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592	NC_009092	T	6	6	228733	228738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_009092	GCC	2	6	233527	233532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_009092	AGGCT	2	10	233588	233597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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602	NC_009092	GCTG	2	8	241476	241483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
603	NC_009092	GGCA	2	8	242398	242405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
604	NC_009092	AT	3	6	242414	242419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009092	GGT	2	6	242420	242425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009092	GGA	2	6	242494	242499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_009092	GCA	2	6	242563	242568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009092	GA	3	6	242569	242574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009092	GTTT	2	8	242830	242837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009092	CTTTT	2	10	242851	242860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_009092	T	6	6	242857	242862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009092	CT	3	6	242884	242889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_009092	ATC	2	6	245490	245495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009092	TAA	2	6	245553	245558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_009092	TGAA	2	8	247101	247108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009092	ATT	2	6	247538	247543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009092	GCT	2	6	247544	247549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009092	T	6	6	247549	247554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009092	CCT	2	6	247590	247595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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627	NC_009092	CTC	2	6	251405	251410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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629	NC_009092	AGA	2	6	254372	254377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009092	GGAG	2	8	254398	254405	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009092	CCT	2	6	255550	255555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_009092	GGA	2	6	255570	255575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009092	A	6	6	255596	255601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009092	TCG	2	6	256684	256689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_009092	AT	3	6	261247	261252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009092	TTA	2	6	261257	261262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009092	TA	4	8	261268	261275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_009092	ATT	2	6	261319	261324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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