MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009092	A	6	6	2460661	2460666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_009092	ATA	2	6	2460677	2460682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_009092	CAG	2	6	2462319	2462324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_009092	TCC	2	6	2464293	2464298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_009092	TCC	2	6	2464305	2464310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_009092	TCC	2	6	2464317	2464322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_009092	CTG	2	6	2464328	2464333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_009092	TTAG	2	8	2464335	2464342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_009092	C	6	6	2464444	2464449	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6010	NC_009092	ATA	2	6	2464451	2464456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_009092	A	6	6	2464520	2464525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_009092	TCA	3	9	2464563	2464571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_009092	TTA	2	6	2465546	2465551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_009092	GTT	2	6	2468645	2468650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_009092	TG	3	6	2468686	2468691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_009092	TTA	2	6	2468733	2468738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009092	AAC	2	6	2468787	2468792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_009092	GGC	2	6	2478969	2478974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_009092	CTTT	2	8	2479019	2479026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_009092	AGC	2	6	2479028	2479033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_009092	A	7	7	2479049	2479055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_009092	A	6	6	2480140	2480145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_009092	T	6	6	2480162	2480167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_009092	AAT	2	6	2480690	2480695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_009092	GCGCC	2	10	2480721	2480730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6026	NC_009092	GAA	2	6	2480856	2480861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_009092	A	7	7	2480866	2480872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_009092	TGA	2	6	2480909	2480914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_009092	A	6	6	2481002	2481007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_009092	T	6	6	2482772	2482777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_009092	CAT	2	6	2482784	2482789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_009092	T	6	6	2482791	2482796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_009092	CGC	2	6	2482817	2482822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_009092	ATA	2	6	2482828	2482833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_009092	AACA	2	8	2482868	2482875	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_009092	TCA	3	9	2482921	2482929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_009092	TTA	2	6	2483003	2483008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_009092	A	6	6	2483026	2483031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009092	AAAC	2	8	2483048	2483055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_009092	ATTG	2	8	2483231	2483238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009092	A	6	6	2483269	2483274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_009092	TAA	2	6	2483305	2483310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_009092	CAGG	2	8	2483324	2483331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_009092	CAGG	2	8	2483335	2483342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_009092	TTA	2	6	2484040	2484045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_009092	GCCC	2	8	2484108	2484115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6047	NC_009092	A	6	6	2484137	2484142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_009092	T	6	6	2484157	2484162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_009092	GCA	2	6	2485253	2485258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_009092	TGA	2	6	2485261	2485266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_009092	AATC	2	8	2485273	2485280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_009092	CTAT	2	8	2485570	2485577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_009092	TTAG	2	8	2486099	2486106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_009092	TC	3	6	2486107	2486112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_009092	GTAA	2	8	2487074	2487081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_009092	T	6	6	2487127	2487132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_009092	ATT	2	6	2487141	2487146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_009092	ATA	2	6	2487159	2487164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_009092	TAC	2	6	2487209	2487214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_009092	A	7	7	2488532	2488538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_009092	ATTA	2	8	2488628	2488635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_009092	ATG	2	6	2490902	2490907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_009092	ATTA	2	8	2490926	2490933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_009092	CGC	2	6	2492750	2492755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_009092	ATC	2	6	2492832	2492837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_009092	CAA	2	6	2492853	2492858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_009092	TGA	2	6	2492893	2492898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_009092	GCAA	2	8	2492939	2492946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_009092	ATT	2	6	2492972	2492977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_009092	TAT	2	6	2493038	2493043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_009092	TAA	2	6	2493078	2493083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_009092	CCT	2	6	2493290	2493295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_009092	CAA	2	6	2493322	2493327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_009092	CAG	2	6	2493356	2493361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_009092	TGAA	2	8	2494357	2494364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_009092	AAT	2	6	2494458	2494463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_009092	CATGG	2	10	2494486	2494495	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6078	NC_009092	TAG	2	6	2494511	2494516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_009092	AAC	2	6	2494540	2494545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_009092	CAA	2	6	2494559	2494564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_009092	CGC	2	6	2495957	2495962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_009092	GAT	2	6	2496021	2496026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_009092	GA	3	6	2496042	2496047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_009092	CCA	2	6	2496308	2496313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_009092	ATG	2	6	2496353	2496358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_009092	CAA	2	6	2496400	2496405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_009092	AGG	2	6	2496973	2496978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_009092	TAT	2	6	2497488	2497493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_009092	A	6	6	2497544	2497549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_009092	TATT	2	8	2498554	2498561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_009092	T	8	8	2498566	2498573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_009092	AC	3	6	2499824	2499829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_009092	T	9	9	2500997	2501005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_009092	CACTA	2	10	2501028	2501037	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6095	NC_009092	GCCT	2	8	2501038	2501045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_009092	TCAT	2	8	2501052	2501059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_009092	CAC	2	6	2501062	2501067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_009092	GCTAG	2	10	2501689	2501698	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6099	NC_009092	CTTA	2	8	2501720	2501727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_009092	CTT	2	6	2503150	2503155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_009092	CG	3	6	2503164	2503169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_009092	TTA	2	6	2503187	2503192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_009092	A	6	6	2504971	2504976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_009092	AAGCT	2	10	2504980	2504989	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6105	NC_009092	T	8	8	2504994	2505001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_009092	ATT	2	6	2506601	2506606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_009092	TTC	2	6	2506608	2506613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_009092	CAA	2	6	2506673	2506678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_009092	TTA	2	6	2508461	2508466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_009092	ACAA	2	8	2508549	2508556	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_009092	CGC	2	6	2508612	2508617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_009092	ATC	2	6	2508702	2508707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_009092	AAG	2	6	2510921	2510926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_009092	T	7	7	2510942	2510948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_009092	TC	3	6	2511072	2511077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_009092	GGC	2	6	2511090	2511095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_009092	AAT	2	6	2511189	2511194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_009092	T	6	6	2513343	2513348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_009092	A	6	6	2514043	2514048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_009092	CTT	2	6	2514062	2514067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_009092	CGAAT	2	10	2514115	2514124	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6122	NC_009092	CTT	2	6	2515930	2515935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_009092	GCTC	2	8	2515979	2515986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_009092	TAC	2	6	2516092	2516097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_009092	TCA	2	6	2516127	2516132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_009092	GAG	2	6	2516161	2516166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_009092	TC	3	6	2517100	2517105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_009092	AAT	2	6	2517202	2517207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_009092	GCT	2	6	2521876	2521881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_009092	ATG	2	6	2521897	2521902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_009092	ACC	2	6	2521976	2521981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_009092	ATA	2	6	2523046	2523051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_009092	ATT	2	6	2523058	2523063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_009092	ATC	2	6	2523147	2523152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6252	NC_009092	TA	3	6	2572778	2572783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6255	NC_009092	TCA	2	6	2572911	2572916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6258	NC_009092	CCTT	2	8	2576484	2576491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6259	NC_009092	T	7	7	2576490	2576496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_009092	ATCTAA	2	12	2576499	2576510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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6262	NC_009092	GCC	2	6	2577843	2577848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6399	NC_009092	G	7	7	2629866	2629872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_009092	TA	3	6	2629880	2629885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_009092	CAA	2	6	2629891	2629896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_009092	GAC	2	6	2629930	2629935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6441	NC_009092	A	6	6	2648930	2648935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6492	NC_009092	G	6	6	2665895	2665900	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6495	NC_009092	GAG	2	6	2667589	2667594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6496	NC_009092	T	7	7	2668812	2668818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_009092	CT	4	8	2668843	2668850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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