MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009092	ACT	2	6	2249655	2249660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_009092	CCG	2	6	2249680	2249685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_009092	T	6	6	2249706	2249711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_009092	TGG	2	6	2249739	2249744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_009092	CGG	2	6	2249851	2249856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_009092	CGA	2	6	2249957	2249962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_009092	TCA	2	6	2251584	2251589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_009092	GGT	2	6	2251637	2251642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_009092	ATA	2	6	2254494	2254499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_009092	AGA	2	6	2254541	2254546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_009092	A	6	6	2255689	2255694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_009092	CAAAAA	2	12	2255714	2255725	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5513	NC_009092	T	7	7	2255744	2255750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_009092	AAACTT	2	12	2257071	2257082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5515	NC_009092	G	6	6	2257102	2257107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_009092	AAGA	2	8	2257153	2257160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_009092	A	6	6	2257189	2257194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_009092	AAT	2	6	2257303	2257308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_009092	AAG	2	6	2257337	2257342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_009092	TC	3	6	2258636	2258641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_009092	ATA	2	6	2258669	2258674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_009092	GC	4	8	2258737	2258744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_009092	T	6	6	2258747	2258752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_009092	GAC	2	6	2258757	2258762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_009092	AGAT	2	8	2258781	2258788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_009092	TTA	2	6	2259576	2259581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_009092	AGG	2	6	2261652	2261657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_009092	T	7	7	2261658	2261664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_009092	GCTA	2	8	2261685	2261692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_009092	CAC	3	9	2261721	2261729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_009092	CCT	2	6	2263978	2263983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_009092	TTA	2	6	2264002	2264007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_009092	TGAG	2	8	2264861	2264868	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_009092	AAG	2	6	2265448	2265453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_009092	T	6	6	2265474	2265479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_009092	GA	3	6	2265569	2265574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_009092	TAA	2	6	2267343	2267348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_009092	ACA	3	9	2269437	2269445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_009092	AGG	2	6	2269846	2269851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_009092	GTC	2	6	2271190	2271195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_009092	CAT	2	6	2271232	2271237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_009092	T	6	6	2271246	2271251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_009092	ATGA	2	8	2271252	2271259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_009092	TTC	2	6	2272203	2272208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_009092	CAAA	2	8	2272241	2272248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_009092	ACTC	2	8	2272326	2272333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_009092	TTTCTC	2	12	2272340	2272351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_009092	GCCAA	2	10	2272369	2272378	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5549	NC_009092	ACA	2	6	2272425	2272430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_009092	GTTA	2	8	2272533	2272540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_009092	GCTTGA	2	12	2273996	2274007	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5552	NC_009092	ACC	2	6	2274025	2274030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_009092	ATC	2	6	2274099	2274104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_009092	CAT	2	6	2274120	2274125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_009092	TTA	2	6	2274141	2274146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_009092	TAG	2	6	2275399	2275404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_009092	ACTA	2	8	2275472	2275479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_009092	G	7	7	2278052	2278058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_009092	AGC	2	6	2278059	2278064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_009092	CCTTAA	2	12	2278097	2278108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_009092	GC	3	6	2278116	2278121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_009092	TAGCT	2	10	2278142	2278151	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5563	NC_009092	CT	3	6	2278207	2278212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_009092	ATG	2	6	2278274	2278279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_009092	AT	3	6	2278333	2278338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_009092	AAT	2	6	2278377	2278382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_009092	GCC	2	6	2278388	2278393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_009092	TCT	2	6	2278458	2278463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_009092	AAT	2	6	2279678	2279683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_009092	GAT	2	6	2279687	2279692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_009092	TGTT	2	8	2279731	2279738	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_009092	AACA	2	8	2279759	2279766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_009092	GTT	2	6	2279795	2279800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_009092	C	6	6	2282297	2282302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5575	NC_009092	AAT	2	6	2282418	2282423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_009092	AGCT	2	8	2283008	2283015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_009092	TTTA	2	8	2283098	2283105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_009092	A	7	7	2284179	2284185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_009092	T	6	6	2284203	2284208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_009092	T	6	6	2286721	2286726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_009092	GC	3	6	2286747	2286752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_009092	ATT	2	6	2286820	2286825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_009092	AAG	2	6	2286949	2286954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_009092	TTGG	2	8	2287911	2287918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_009092	ACG	2	6	2288006	2288011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_009092	TTA	2	6	2288114	2288119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_009092	ATA	2	6	2288124	2288129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_009092	CAAT	2	8	2288198	2288205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_009092	CTG	2	6	2288230	2288235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_009092	T	6	6	2288284	2288289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_009092	CTT	2	6	2290255	2290260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_009092	GCA	2	6	2290317	2290322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_009092	GTG	2	6	2291950	2291955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_009092	GCG	2	6	2291965	2291970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_009092	T	6	6	2292078	2292083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_009092	AGC	3	9	2292092	2292100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_009092	GTG	2	6	2292159	2292164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_009092	ATT	2	6	2292166	2292171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_009092	ATT	2	6	2292235	2292240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_009092	CAC	2	6	2292246	2292251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_009092	TTTAA	2	10	2292253	2292262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_009092	ATA	2	6	2292264	2292269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_009092	TGG	2	6	2292303	2292308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_009092	CTTTCT	2	12	2292455	2292466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_009092	CAA	2	6	2292584	2292589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_009092	TATC	2	8	2292677	2292684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_009092	TTCT	2	8	2292696	2292703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5608	NC_009092	TAA	2	6	2292868	2292873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_009092	ACT	2	6	2292890	2292895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_009092	AGCA	2	8	2292924	2292931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_009092	AGTT	2	8	2292945	2292952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_009092	GTTA	2	8	2292976	2292983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_009092	AACC	2	8	2292986	2292993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_009092	TAAC	2	8	2293122	2293129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_009092	AGC	2	6	2293178	2293183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_009092	TCA	2	6	2293426	2293431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_009092	TAT	2	6	2293522	2293527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_009092	TTG	2	6	2293567	2293572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_009092	T	6	6	2293632	2293637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_009092	A	6	6	2294926	2294931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_009092	CAA	2	6	2294960	2294965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_009092	TAA	2	6	2294981	2294986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_009092	CAA	2	6	2295102	2295107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_009092	CAATTT	2	12	2295135	2295146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5625	NC_009092	TAC	2	6	2295185	2295190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_009092	TAA	2	6	2295193	2295198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_009092	TTAAGC	2	12	2296815	2296826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5628	NC_009092	AGCT	2	8	2296932	2296939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5629	NC_009092	AGCTTG	2	12	2296968	2296979	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5630	NC_009092	ATT	2	6	2297497	2297502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_009092	T	6	6	2297582	2297587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_009092	TTGT	2	8	2297660	2297667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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