MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	CATT	2	8	49	56	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009035	AGTG	2	8	12937	12944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009035	TCAG	2	8	17998	18005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009035	AGGA	2	8	18143	18150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009035	TTAT	2	8	20452	20459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009035	TTAT	2	8	20594	20601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009035	TCAA	2	8	21223	21230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009035	TCAA	2	8	25293	25300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009035	CATC	2	8	26487	26494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009035	GCTT	2	8	31886	31893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009035	ACAA	2	8	32477	32484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009035	GTTT	2	8	32507	32514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009035	TAAA	2	8	42125	42132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009035	TTGC	2	8	42239	42246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009035	TTGA	2	8	42322	42329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009035	CAAA	2	8	42348	42355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009035	ACTC	2	8	42389	42396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009035	AATA	2	8	42439	42446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009035	ATCA	2	8	42514	42521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009035	ACAA	2	8	42568	42575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009035	TTTA	2	8	42666	42673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009035	ATAA	2	8	51413	51420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009035	CATA	2	8	52392	52399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009035	GCGG	2	8	59983	59990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009035	CTAT	2	8	63814	63821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009035	ATTT	2	8	64299	64306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009035	AAAG	2	8	65377	65384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009035	TTTC	2	8	65475	65482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009035	ATCA	2	8	65637	65644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009035	GACA	2	8	69166	69173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009035	TCCT	2	8	71306	71313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009035	TTCG	2	8	71463	71470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009035	TAAA	2	8	71500	71507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009035	TTAT	2	8	71873	71880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009035	AAAC	2	8	71918	71925	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009035	AGAA	2	8	72215	72222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009035	CTAA	2	8	73210	73217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009035	GCAG	2	8	83894	83901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009035	ACAA	2	8	84556	84563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009035	CGTC	2	8	84837	84844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009035	AGCC	2	8	84868	84875	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009035	ATTG	2	8	89164	89171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009035	AAGC	2	8	93285	93292	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009035	GTCA	2	8	108462	108469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009035	ATGA	2	8	113449	113456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.