MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	AGA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009035	TGT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009035	AAG	2	6	170	175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009035	GCA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009035	TCT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009035	TTA	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009035	ATA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009035	CAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009035	CTA	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009035	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009035	CTT	2	6	5544	5549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009035	TAA	2	6	5710	5715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009035	TGC	2	6	13758	13763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009035	GCA	2	6	13777	13782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009035	ATG	2	6	13963	13968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009035	AAT	2	6	14969	14974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009035	AAG	2	6	16009	16014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009035	ATT	2	6	16141	16146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009035	CCA	2	6	17688	17693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009035	CAG	2	6	17838	17843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009035	TGA	2	6	18110	18115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009035	TAA	2	6	19208	19213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009035	CTT	2	6	20497	20502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009035	CTG	2	6	20622	20627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009035	CCA	2	6	20901	20906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009035	ACG	2	6	20929	20934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009035	GCA	2	6	21010	21015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009035	TTA	2	6	21050	21055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009035	TCA	2	6	21306	21311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009035	GAT	2	6	21350	21355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009035	TGA	2	6	21500	21505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009035	AAT	2	6	23022	23027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009035	TTG	2	6	23089	23094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009035	TTA	2	6	23126	23131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009035	TAC	2	6	24218	24223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009035	TTA	2	6	25322	25327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009035	AAG	2	6	25395	25400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009035	CGA	2	6	30476	30481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009035	ATC	2	6	31802	31807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009035	GCG	2	6	31808	31813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009035	CAT	2	6	31840	31845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009035	ACT	2	6	32455	32460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009035	CTG	2	6	32535	32540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009035	ATT	2	6	34941	34946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009035	CGC	2	6	35018	35023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009035	CAG	2	6	35897	35902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009035	GCC	2	6	35928	35933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009035	TAA	2	6	36523	36528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009035	CGC	2	6	37115	37120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009035	GAA	2	6	38975	38980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009035	CGA	2	6	40515	40520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009035	GCT	2	6	42198	42203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009035	ATG	2	6	42206	42211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009035	AAT	2	6	42331	42336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009035	CAT	2	6	42366	42371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009035	TAA	2	6	42427	42432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009035	CTA	2	6	42551	42556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009035	ATT	2	6	42626	42631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009035	TTC	2	6	42632	42637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009035	TGC	2	6	42801	42806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009035	TCC	2	6	44174	44179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009035	TTA	2	6	44296	44301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009035	GGT	2	6	46425	46430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009035	TTC	2	6	47111	47116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009035	GAA	2	6	51184	51189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009035	TGT	2	6	51201	51206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009035	AAC	2	6	51212	51217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009035	GTA	2	6	51320	51325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009035	TAC	2	6	51356	51361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009035	GCC	2	6	51379	51384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009035	TAC	2	6	52426	52431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009035	CTT	2	6	53944	53949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009035	GGT	2	6	54000	54005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009035	CAC	2	6	57174	57179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009035	ACA	2	6	57327	57332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009035	TCA	2	6	60709	60714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009035	GCG	2	6	61297	61302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009035	GCT	2	6	61503	61508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009035	ATT	2	6	63787	63792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009035	GCA	2	6	63829	63834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009035	TTA	2	6	63849	63854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009035	GCA	2	6	63872	63877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009035	TGC	2	6	63939	63944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009035	GTT	2	6	64964	64969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009035	ACT	2	6	65042	65047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009035	GGC	2	6	65050	65055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009035	GAG	2	6	65063	65068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009035	CCA	2	6	65144	65149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009035	GTT	2	6	65172	65177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009035	ATG	2	6	65183	65188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009035	CCA	2	6	65300	65305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009035	CCA	2	6	65469	65474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009035	CTT	2	6	65498	65503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009035	CGA	2	6	66886	66891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009035	GGC	2	6	67694	67699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009035	GCA	2	6	69187	69192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009035	GTC	2	6	71314	71319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009035	GAA	2	6	71360	71365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009035	ATA	2	6	71534	71539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009035	ACC	2	6	71555	71560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009035	TTG	2	6	71648	71653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009035	CTA	2	6	71836	71841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009035	AGC	2	6	71883	71888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009035	TCA	3	9	71983	71991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009035	TCT	2	6	72087	72092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009035	CAA	2	6	72249	72254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009035	CCG	2	6	72284	72289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_009035	TGC	2	6	72307	72312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009035	GGC	2	6	72409	72414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009035	CGT	2	6	72535	72540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009035	AGT	2	6	72565	72570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009035	CAC	2	6	72596	72601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009035	CGG	2	6	72753	72758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009035	CGG	2	6	72888	72893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009035	CGG	2	6	72996	73001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009035	CGG	2	6	73115	73120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009035	TTC	2	6	73171	73176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009035	TTA	2	6	73270	73275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009035	TCA	2	6	73293	73298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009035	TGT	2	6	75344	75349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009035	ATA	2	6	75370	75375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009035	CAT	2	6	80328	80333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009035	ATA	2	6	81792	81797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009035	CAG	2	6	81829	81834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009035	ATC	2	6	81857	81862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009035	ACT	2	6	81884	81889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009035	CAA	2	6	81896	81901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009035	TAT	2	6	82857	82862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009035	ATT	2	6	82907	82912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009035	GCA	2	6	83864	83869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009035	GCC	2	6	84458	84463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009035	TCA	2	6	84708	84713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009035	CTC	2	6	84946	84951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009035	GGC	2	6	87498	87503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009035	TAA	2	6	89127	89132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009035	TGC	2	6	91203	91208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009035	AAT	2	6	91298	91303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009035	AAT	2	6	91314	91319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009035	AAT	2	6	91379	91384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009035	CGC	2	6	92130	92135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009035	CCA	2	6	92150	92155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009035	AGC	2	6	96717	96722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009035	TAA	2	6	107288	107293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009035	GTA	2	6	107335	107340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009035	CGA	2	6	108340	108345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009035	CAC	2	6	108447	108452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009035	GAT	2	6	108527	108532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009035	ATC	2	6	108555	108560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009035	TCA	2	6	109605	109610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009035	TAA	2	6	109659	109664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009035	GCC	2	6	109776	109781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_009035	GGA	2	6	113464	113469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009035	AGG	2	6	113474	113479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009035	TAT	2	6	114874	114879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009035	GGC	2	6	114919	114924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.