MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus sanguinis SK36 chromosome

Total Repeats: 6466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009009	CAG	2	6	2206855	2206860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_009009	TCT	2	6	2206873	2206878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_009009	CAAG	2	8	2206889	2206896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_009009	AGA	2	6	2206913	2206918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_009009	AGC	2	6	2206931	2206936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_009009	A	7	7	2207410	2207416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_009009	T	6	6	2207493	2207498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_009009	TA	3	6	2207515	2207520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_009009	A	6	6	2207553	2207558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_009009	AAC	2	6	2207571	2207576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_009009	A	6	6	2207613	2207618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_009009	T	6	6	2207696	2207701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_009009	TAGAA	2	10	2207722	2207731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_009009	AAT	2	6	2207781	2207786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_009009	TGT	2	6	2207792	2207797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_009009	T	6	6	2207802	2207807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009009	TTA	2	6	2208062	2208067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_009009	AGT	2	6	2208111	2208116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_009009	T	7	7	2208151	2208157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_009009	TCTT	2	8	2208176	2208183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_009009	GCA	2	6	2210577	2210582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_009009	TAT	2	6	2212583	2212588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_009009	TCA	2	6	2212595	2212600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_009009	A	6	6	2212622	2212627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_009009	TGA	2	6	2212637	2212642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_009009	AGA	2	6	2214046	2214051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_009009	GACAA	2	10	2214074	2214083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6028	NC_009009	TAT	2	6	2214100	2214105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_009009	T	7	7	2214105	2214111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_009009	CCA	2	6	2214116	2214121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_009009	TCCT	2	8	2219143	2219150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_009009	CTGT	2	8	2219198	2219205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_009009	C	6	6	2220039	2220044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6034	NC_009009	ATC	2	6	2220046	2220051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_009009	TC	3	6	2224090	2224095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_009009	TAT	2	6	2227040	2227045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_009009	T	6	6	2227092	2227097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_009009	A	6	6	2227113	2227118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009009	TTCT	2	8	2227146	2227153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_009009	ACA	2	6	2227190	2227195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_009009	CCT	2	6	2228863	2228868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_009009	AG	3	6	2228876	2228881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_009009	CAG	2	6	2231336	2231341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_009009	TAAAAA	2	12	2231399	2231410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_009009	TGT	2	6	2231417	2231422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_009009	A	6	6	2231426	2231431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_009009	T	6	6	2231436	2231441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_009009	ACA	2	6	2231452	2231457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_009009	T	6	6	2231464	2231469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_009009	A	6	6	2233204	2233209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_009009	T	6	6	2233218	2233223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_009009	ATCC	2	8	2233247	2233254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_009009	TA	3	6	2233256	2233261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_009009	AT	3	6	2234887	2234892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_009009	AAC	2	6	2234920	2234925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_009009	TCT	2	6	2235555	2235560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_009009	A	6	6	2236841	2236846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_009009	AGC	2	6	2236848	2236853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_009009	CTC	2	6	2236885	2236890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_009009	TATGA	2	10	2236902	2236911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_009009	CTTT	2	8	2238045	2238052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_009009	TAT	2	6	2238063	2238068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_009009	CT	3	6	2238182	2238187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_009009	TGGA	2	8	2238197	2238204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_009009	TATCA	2	10	2238784	2238793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_009009	CGC	2	6	2238803	2238808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_009009	TAA	2	6	2238842	2238847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_009009	A	6	6	2238846	2238851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_009009	AGC	2	6	2238853	2238858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_009009	TCC	2	6	2239438	2239443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_009009	ATCC	2	8	2239479	2239486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_009009	AGA	2	6	2239520	2239525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_009009	TAT	2	6	2240006	2240011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_009009	T	6	6	2241212	2241217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_009009	ATT	2	6	2242716	2242721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_009009	TAA	2	6	2242726	2242731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_009009	A	6	6	2242737	2242742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_009009	ATC	2	6	2242747	2242752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_009009	AAT	2	6	2242755	2242760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_009009	GAA	2	6	2242768	2242773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_009009	ATC	2	6	2242779	2242784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_009009	T	6	6	2243229	2243234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_009009	TAT	2	6	2243261	2243266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_009009	AGATT	2	10	2243339	2243348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_009009	TAT	2	6	2246515	2246520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_009009	ATT	2	6	2246536	2246541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_009009	AGT	2	6	2246580	2246585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_009009	CAT	2	6	2246607	2246612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_009009	TTG	2	6	2246622	2246627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_009009	CCAT	2	8	2246641	2246648	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_009009	ATT	2	6	2246713	2246718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_009009	TCA	2	6	2246777	2246782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6096	NC_009009	TAA	2	6	2246869	2246874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_009009	TAGCT	2	10	2246969	2246978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_009009	CTATT	2	10	2247016	2247025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6099	NC_009009	ACC	2	6	2247032	2247037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_009009	ACC	3	9	2247041	2247049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_009009	GTA	2	6	2247064	2247069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_009009	AAATT	2	10	2247092	2247101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_009009	T	7	7	2247110	2247116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_009009	CCT	2	6	2247126	2247131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_009009	T	7	7	2247162	2247168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_009009	TGA	2	6	2248117	2248122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_009009	TTA	2	6	2248210	2248215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_009009	CT	3	6	2248258	2248263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_009009	CTT	3	9	2248767	2248775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_009009	GCT	2	6	2248793	2248798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_009009	TTC	2	6	2248806	2248811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_009009	ATAA	2	8	2248834	2248841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_009009	GAG	2	6	2248932	2248937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_009009	CTTC	2	8	2250118	2250125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_009009	GGT	2	6	2250195	2250200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_009009	A	6	6	2253452	2253457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_009009	T	6	6	2255534	2255539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_009009	TAT	2	6	2255561	2255566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_009009	ATTA	2	8	2255637	2255644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_009009	AAAC	2	8	2258256	2258263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_009009	A	6	6	2258304	2258309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_009009	ATT	2	6	2258766	2258771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_009009	GAA	2	6	2258795	2258800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_009009	AATA	2	8	2258864	2258871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_009009	A	6	6	2258871	2258876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_009009	GAAG	2	8	2258897	2258904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.