MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 1898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	CCAT	2	8	2751	2758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008750	TGAT	2	8	6380	6387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008750	TAGG	2	8	14808	14815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008750	TGAT	2	8	15799	15806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008750	AATT	2	8	15862	15869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008750	TCAC	2	8	24128	24135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008750	AGTT	2	8	30614	30621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008750	ACTA	2	8	37584	37591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008750	TAAT	2	8	40450	40457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008750	ATTA	2	8	40477	40484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008750	GCGA	2	8	40890	40897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008750	CTGA	2	8	41069	41076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008750	CGTC	2	8	41594	41601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008750	AAAG	2	8	41717	41724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008750	GGTG	2	8	42112	42119	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008750	ATTG	2	8	42487	42494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008750	GAAC	2	8	43306	43313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008750	ATTA	2	8	43958	43965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008750	CCGC	2	8	49519	49526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_008750	TGTC	2	8	52176	52183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008750	CTAT	2	8	53430	53437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008750	CGGT	2	8	54292	54299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008750	CCAT	2	8	54452	54459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008750	CCAG	2	8	54494	54501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008750	ATTT	2	8	54773	54780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008750	ATTA	2	8	55680	55687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008750	AATG	2	8	56934	56941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008750	CTTA	2	8	57046	57053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008750	TTTG	2	8	60299	60306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008750	TTAA	2	8	66933	66940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008750	GGAT	2	8	72320	72327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008750	ATCA	2	8	72484	72491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008750	TCAA	2	8	73673	73680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008750	AATT	2	8	76443	76450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008750	TTTG	2	8	78655	78662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008750	TTTA	2	8	79695	79702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008750	TTCT	2	8	85122	85129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008750	TTAT	2	8	95323	95330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008750	CTAT	2	8	96792	96799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008750	TTTG	2	8	99278	99285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008750	TCCC	2	8	101027	101034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008750	AACT	2	8	103526	103533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008750	ATTA	2	8	104577	104584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008750	ATGG	2	8	109808	109815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008750	TTAT	2	8	109891	109898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008750	TGAA	2	8	118016	118023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008750	TTAA	2	8	118066	118073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008750	GTTG	2	8	118164	118171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008750	TTGG	2	8	121967	121974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008750	AGTC	2	8	126727	126734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008750	TTTA	2	8	133087	133094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008750	ATTG	2	8	136338	136345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008750	TTGT	2	8	140741	140748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008750	TTTG	2	8	140772	140779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008750	TAAA	2	8	143554	143561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008750	ATTA	2	8	146299	146306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008750	GAGT	2	8	146397	146404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008750	CGCC	2	8	147707	147714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_008750	TCGT	2	8	149675	149682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008750	GTTA	2	8	149939	149946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008750	AATA	2	8	150043	150050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008750	TTAT	2	8	156618	156625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008750	TTGT	2	8	162920	162927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008750	TATT	2	8	163067	163074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008750	AAAT	2	8	168295	168302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008750	TGGC	2	8	171474	171481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008750	TAAA	2	8	174455	174462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008750	GCTG	2	8	176489	176496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008750	TAAG	2	8	186042	186049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008750	GTTT	2	8	195340	195347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008750	AACA	2	8	202525	202532	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008750	ACTG	2	8	204328	204335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008750	GGAA	2	8	207442	207449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008750	CATT	2	8	209449	209456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008750	AAGC	2	8	213481	213488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008750	GTTT	2	8	213791	213798	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008750	GCGA	2	8	216146	216153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008750	CTGA	2	8	216325	216332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008750	CGTC	2	8	216850	216857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008750	AAAG	2	8	216973	216980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008750	GGTG	2	8	217368	217375	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008750	ATTG	2	8	217743	217750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008750	GAAC	2	8	218562	218569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008750	CTTT	2	8	219404	219411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008750	TGTT	2	8	220400	220407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008750	TTAA	2	8	220447	220454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008750	CAAA	2	8	220986	220993	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008750	AAAT	2	8	221116	221123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008750	CGGG	2	8	222553	222560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008750	TAAA	2	8	222590	222597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008750	ACGG	2	8	230040	230047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008750	TAGG	2	8	230050	230057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008750	TCAA	2	8	230094	230101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008750	ATTT	2	8	230135	230142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008750	TTAT	2	8	230219	230226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008750	TGAG	2	8	230879	230886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008750	AATT	2	8	233742	233749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008750	TAGG	2	8	235622	235629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008750	GATT	2	8	240030	240037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008750	TATC	2	8	242336	242343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008750	GGTA	2	8	245785	245792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008750	GCCT	2	8	248672	248679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008750	AAAT	2	8	250715	250722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008750	GATA	2	8	251526	251533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008750	ATAA	2	8	251538	251545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008750	ATTA	2	8	251656	251663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008750	TTTA	2	8	252180	252187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008750	TAAA	2	8	256738	256745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008750	TTCC	2	8	259363	259370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008750	TTAT	2	8	259461	259468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008750	AGTT	2	8	260019	260026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008750	TTTA	2	8	260057	260064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008750	GATG	2	8	264244	264251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008750	GCAA	2	8	266457	266464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008750	CTTC	2	8	268203	268210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008750	AATA	2	8	268389	268396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008750	CCTA	2	8	268464	268471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008750	TATT	2	8	277296	277303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008750	TAAA	2	8	281923	281930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008750	TTAT	2	8	284469	284476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008750	TGAA	2	8	285293	285300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008750	GTTT	2	8	285335	285342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008750	ATGG	2	8	285506	285513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008750	CTTT	2	8	286448	286455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008750	ATCT	2	8	288658	288665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008750	TAAT	2	8	290414	290421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008750	ATTT	2	8	291101	291108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008750	TTTG	2	8	291300	291307	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008750	ACTC	2	8	294252	294259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008750	TTCG	2	8	294629	294636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008750	ACAA	2	8	296865	296872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008750	TGGA	2	8	298175	298182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008750	ATTT	2	8	298326	298333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008750	ATTG	2	8	298504	298511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008750	TTTG	2	8	298555	298562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008750	GATT	2	8	302790	302797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008750	AAAT	2	8	303572	303579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008750	TTTG	2	8	303612	303619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008750	AACG	2	8	306462	306469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008750	ATGG	2	8	306581	306588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008750	TTTC	2	8	308265	308272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008750	AGTG	2	8	308285	308292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008750	ATTA	2	8	309066	309073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008750	CTAA	2	8	327450	327457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008750	TAAT	2	8	327478	327485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008750	CTAC	2	8	327492	327499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008750	ACAT	2	8	328784	328791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008750	ATTT	2	8	328793	328800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008750	TTTA	2	8	331121	331128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008750	GTTT	2	8	333518	333525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008750	ATTT	2	8	334042	334049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008750	CAAT	2	8	335123	335130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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