MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 7060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	TGA	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008750	CGC	2	6	2705	2710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008750	TAT	2	6	2804	2809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008750	TGT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008750	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008750	AGC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008750	TAT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008750	GTT	2	6	6462	6467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008750	CTT	2	6	10777	10782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008750	CAT	2	6	15393	15398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008750	ATT	2	6	15793	15798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008750	TAA	2	6	15893	15898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008750	CCA	2	6	19279	19284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008750	CAG	2	6	19319	19324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008750	CAT	2	6	19332	19337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008750	ACA	2	6	19380	19385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008750	ATT	2	6	19562	19567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008750	ATG	2	6	19578	19583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008750	AGC	2	6	19608	19613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008750	TGT	2	6	19658	19663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008750	ATA	2	6	19702	19707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008750	AAT	2	6	21762	21767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008750	ATT	2	6	24267	24272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008750	TTA	2	6	24894	24899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008750	AGT	2	6	26365	26370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008750	AAT	2	6	30668	30673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008750	CAA	2	6	31895	31900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008750	TTA	2	6	31901	31906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008750	TTG	2	6	33406	33411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008750	AGG	2	6	33434	33439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008750	CCT	2	6	33446	33451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008750	GGT	2	6	33511	33516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008750	AAT	2	6	34189	34194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008750	TTG	2	6	34199	34204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008750	AAT	2	6	34810	34815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008750	ACA	2	6	35759	35764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008750	TAG	2	6	36214	36219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008750	GCA	2	6	38384	38389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008750	CAA	2	6	38717	38722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008750	GGC	2	6	38765	38770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008750	GCA	2	6	38796	38801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008750	GCG	2	6	38829	38834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008750	AGG	2	6	38924	38929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008750	CGA	2	6	39004	39009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008750	GAT	2	6	39029	39034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008750	GCA	2	6	39078	39083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008750	GAA	2	6	39137	39142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008750	GGA	2	6	39173	39178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008750	AGA	2	6	39220	39225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008750	CAG	2	6	39246	39251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008750	GGA	2	6	39437	39442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008750	GGC	2	6	39457	39462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008750	GAA	2	6	39700	39705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008750	TGC	2	6	39776	39781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008750	GTC	2	6	39788	39793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008750	TGG	2	6	39866	39871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008750	GGA	2	6	39902	39907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008750	GAC	2	6	39915	39920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008750	TCA	2	6	39927	39932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008750	TCG	2	6	40020	40025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008750	AAG	2	6	40158	40163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008750	CAC	2	6	40192	40197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008750	CCT	2	6	40263	40268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008750	TTA	2	6	40531	40536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008750	CTT	2	6	40571	40576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008750	CAA	2	6	40612	40617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008750	GTA	2	6	40702	40707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008750	TCA	2	6	40789	40794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008750	TAG	2	6	40882	40887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008750	TCC	2	6	41049	41054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008750	GGA	2	6	41359	41364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008750	TAC	2	6	41563	41568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008750	CGG	2	6	41581	41586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008750	AAC	2	6	41613	41618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008750	AGC	2	6	41703	41708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008750	CAT	2	6	41709	41714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008750	ACC	2	6	41781	41786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008750	GCG	2	6	42081	42086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008750	GGT	2	6	42105	42110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008750	TGA	2	6	42155	42160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008750	AGT	2	6	42180	42185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008750	TCT	2	6	42208	42213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008750	GGT	2	6	42254	42259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008750	TGA	2	6	42353	42358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008750	CGG	2	6	42535	42540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008750	ATG	2	6	42611	42616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008750	GTC	2	6	42792	42797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008750	ACC	2	6	42806	42811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008750	TGG	2	6	42866	42871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008750	TCC	2	6	42892	42897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008750	GGA	2	6	42909	42914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008750	GGT	2	6	43029	43034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008750	CGG	2	6	43116	43121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008750	TCA	2	6	43144	43149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008750	CGT	2	6	43224	43229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008750	GAT	2	6	43264	43269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008750	AAG	2	6	43559	43564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008750	ATT	2	6	43625	43630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008750	AGC	2	6	43667	43672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008750	ACC	2	6	43735	43740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008750	TGA	2	6	43908	43913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008750	ATA	2	6	43917	43922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008750	ATT	2	6	43934	43939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008750	AGA	2	6	43968	43973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008750	AAT	2	6	44030	44035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008750	GTT	2	6	49385	49390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008750	TGA	2	6	49408	49413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008750	TAA	2	6	50587	50592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008750	GCA	2	6	50638	50643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008750	GCT	2	6	52034	52039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008750	TCC	2	6	52050	52055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008750	CAA	2	6	52069	52074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008750	AAT	2	6	52238	52243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008750	ATT	2	6	52818	52823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008750	ATT	2	6	53391	53396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008750	CTG	2	6	54115	54120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008750	TTA	2	6	54127	54132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008750	GGC	2	6	54206	54211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008750	GCC	2	6	54221	54226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008750	CTT	2	6	54303	54308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008750	AGC	2	6	54424	54429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008750	TCA	2	6	54431	54436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008750	TTA	3	9	54674	54682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008750	AGT	2	6	54686	54691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008750	ATT	2	6	55574	55579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008750	TTC	2	6	55674	55679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008750	GCA	2	6	55697	55702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008750	TTA	2	6	56386	56391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008750	CTT	2	6	56438	56443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008750	TCT	2	6	56448	56453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008750	ATA	2	6	56522	56527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008750	CAA	2	6	56555	56560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008750	TTA	2	6	56629	56634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008750	TGA	2	6	56656	56661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008750	TCA	2	6	56726	56731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008750	AAT	2	6	56792	56797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008750	TGA	2	6	57059	57064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008750	AAG	2	6	57089	57094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008750	AAT	2	6	60082	60087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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