MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 12701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008750	TTG	2	6	1523141	1523146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008750	A	6	6	1523206	1523211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008750	GCG	2	6	1523248	1523253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_008750	GTGTCA	2	12	1523286	1523297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4005	NC_008750	AAT	2	6	1523309	1523314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008750	TCCC	2	8	1524210	1524217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4007	NC_008750	CAAAA	2	10	1524313	1524322	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4008	NC_008750	TTA	2	6	1524668	1524673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008750	GTTTT	2	10	1524698	1524707	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008750	A	6	6	1524759	1524764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_008750	AAT	2	6	1524773	1524778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008750	A	7	7	1525978	1525984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008750	T	6	6	1526007	1526012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_008750	T	6	6	1527213	1527218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_008750	AAT	2	6	1527336	1527341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008750	CGG	2	6	1530043	1530048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_008750	TA	3	6	1530054	1530059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008750	C	6	6	1530068	1530073	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4019	NC_008750	TC	3	6	1530103	1530108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_008750	AAATG	2	10	1530154	1530163	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008750	GGT	2	6	1531262	1531267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008750	TAG	2	6	1531317	1531322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_008750	GCA	2	6	1534443	1534448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_008750	TTA	2	6	1535689	1535694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008750	GT	3	6	1538866	1538871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008750	T	6	6	1538895	1538900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008750	T	6	6	1540382	1540387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008750	CGC	2	6	1541879	1541884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_008750	GGC	2	6	1543412	1543417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008750	GCC	2	6	1543423	1543428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_008750	TG	3	6	1543441	1543446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008750	ATAAA	2	10	1543495	1543504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008750	ATT	2	6	1545095	1545100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008750	T	6	6	1545133	1545138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_008750	GTT	2	6	1545139	1545144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008750	AG	3	6	1545227	1545232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008750	CGA	2	6	1545822	1545827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_008750	ACG	3	9	1545848	1545856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_008750	ATG	2	6	1545869	1545874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_008750	T	8	8	1545880	1545887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_008750	ATT	2	6	1545909	1545914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008750	ATT	2	6	1545925	1545930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008750	AGC	2	6	1546011	1546016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_008750	TTAA	2	8	1546094	1546101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008750	AGTG	2	8	1546140	1546147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008750	CTTA	2	8	1546195	1546202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_008750	TAAA	2	8	1547657	1547664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008750	TG	3	6	1547741	1547746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_008750	A	7	7	1547755	1547761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008750	AGG	2	6	1547777	1547782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_008750	AAT	2	6	1547892	1547897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008750	ATA	2	6	1547900	1547905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_008750	CCT	2	6	1551803	1551808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_008750	AAG	2	6	1551816	1551821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008750	TCA	2	6	1551835	1551840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_008750	A	6	6	1551840	1551845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008750	T	6	6	1551854	1551859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008750	T	6	6	1551866	1551871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_008750	TTA	2	6	1551890	1551895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008750	AT	3	6	1551911	1551916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008750	AAT	2	6	1551931	1551936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008750	TCT	2	6	1552026	1552031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_008750	A	6	6	1552049	1552054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008750	GAAAA	2	10	1552065	1552074	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_008750	AAGGAG	2	12	1552087	1552098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008750	CAA	2	6	1552189	1552194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_008750	A	6	6	1552375	1552380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008750	AAT	2	6	1552385	1552390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008750	T	7	7	1552413	1552419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_008750	CATATG	2	12	1552449	1552460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4071	NC_008750	TATTT	2	10	1552466	1552475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008750	T	6	6	1552473	1552478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008750	TGT	2	6	1552521	1552526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008750	T	6	6	1552526	1552531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008750	TTG	2	6	1552541	1552546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008750	TAA	2	6	1552605	1552610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_008750	CT	3	6	1552617	1552622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_008750	T	6	6	1552628	1552633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008750	GT	3	6	1552664	1552669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_008750	TGAT	2	8	1552704	1552711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008750	GGT	2	6	1552726	1552731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_008750	TGC	2	6	1552892	1552897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008750	CAC	2	6	1553026	1553031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_008750	GAA	2	6	1555765	1555770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008750	A	6	6	1555919	1555924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008750	T	6	6	1555941	1555946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_008750	TTA	2	6	1555955	1555960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008750	TCAT	2	8	1556395	1556402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_008750	AG	3	6	1558503	1558508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008750	ATA	2	6	1558533	1558538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008750	TCA	2	6	1558573	1558578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008750	TAAA	2	8	1558612	1558619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008750	TCCA	2	8	1562835	1562842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_008750	GTCTA	2	10	1562906	1562915	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4095	NC_008750	AATGT	2	10	1563606	1563615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008750	TAT	2	6	1563669	1563674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_008750	AAT	2	6	1565785	1565790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008750	AAC	2	6	1568355	1568360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_008750	A	6	6	1568485	1568490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008750	T	6	6	1568491	1568496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008750	ATG	2	6	1568499	1568504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008750	A	6	6	1568535	1568540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008750	TATTT	2	10	1568541	1568550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008750	T	6	6	1568555	1568560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008750	ATA	2	6	1568561	1568566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008750	TTGT	2	8	1568574	1568581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008750	ATT	2	6	1568600	1568605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008750	GTATG	2	10	1568633	1568642	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008750	TAA	2	6	1580491	1580496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008750	ACT	2	6	1580536	1580541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_008750	ATT	2	6	1582189	1582194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008750	ACA	2	6	1582203	1582208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_008750	TC	3	6	1586841	1586846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_008750	AGG	2	6	1586877	1586882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008750	GCT	2	6	1586885	1586890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_008750	GACA	2	8	1588198	1588205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_008750	TGT	2	6	1588355	1588360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008750	GAG	2	6	1589609	1589614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008750	TGT	2	6	1589666	1589671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008750	T	6	6	1589791	1589796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_008750	ATT	2	6	1589818	1589823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_008750	GA	5	10	1589828	1589837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008750	CGT	2	6	1590618	1590623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008750	ATT	2	6	1590673	1590678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008750	AGA	2	6	1591477	1591482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008750	AAC	2	6	1591574	1591579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_008750	TTAA	2	8	1593471	1593478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008750	T	6	6	1593502	1593507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008750	CCA	2	6	1593525	1593530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_008750	TAT	2	6	1593542	1593547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_008750	CTT	2	6	1593548	1593553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_008750	AGG	2	6	1594442	1594447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_008750	GCC	2	6	1596668	1596673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4398	NC_008750	ATC	2	6	1684933	1684938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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