MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 12701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008750	T	6	6	1123019	1123024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_008750	ATA	2	6	1126237	1126242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008750	TTTTAA	2	12	1126259	1126270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008750	GCA	2	6	1126276	1126281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_008750	TAAG	2	8	1127775	1127782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008750	AGC	2	6	1129419	1129424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_008750	GAAGA	2	10	1129430	1129439	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008750	GT	3	6	1130071	1130076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008750	GGC	2	6	1130126	1130131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_008750	GCC	2	6	1130135	1130140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_008750	AT	3	6	1130283	1130288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008750	TAAC	2	8	1130351	1130358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_008750	GCT	2	6	1130365	1130370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_008750	CTG	2	6	1130439	1130444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_008750	TACA	2	8	1130612	1130619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_008750	TAA	2	6	1130675	1130680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008750	AGG	2	6	1130759	1130764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008750	CCCT	2	8	1132733	1132740	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3019	NC_008750	AGC	2	6	1132768	1132773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008750	AAT	2	6	1132856	1132861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008750	A	6	6	1132931	1132936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008750	A	6	6	1132947	1132952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008750	CAT	2	6	1132967	1132972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_008750	CAA	2	6	1133010	1133015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_008750	CAGCG	2	10	1133035	1133044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3026	NC_008750	ATG	2	6	1133070	1133075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008750	GGCC	2	8	1133203	1133210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_008750	GAG	2	6	1133226	1133231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008750	AGT	2	6	1133300	1133305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008750	ATA	2	6	1133313	1133318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008750	AGTG	2	8	1133364	1133371	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008750	TAG	2	6	1133467	1133472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008750	A	7	7	1133512	1133518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008750	TAT	2	6	1133527	1133532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008750	AGC	2	6	1133538	1133543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_008750	T	6	6	1133590	1133595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008750	TTC	2	6	1133616	1133621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_008750	A	7	7	1133649	1133655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_008750	ATA	2	6	1133685	1133690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008750	CTA	2	6	1133693	1133698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_008750	CGC	2	6	1133715	1133720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_008750	ACG	2	6	1133763	1133768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_008750	GGA	2	6	1133886	1133891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008750	GTT	2	6	1134332	1134337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008750	GGCG	2	8	1134376	1134383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_008750	GAGTTA	2	12	1134416	1134427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008750	GAC	2	6	1134526	1134531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008750	AAC	2	6	1134578	1134583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_008750	CGA	2	6	1134662	1134667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_008750	ATGGC	2	10	1134672	1134681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3051	NC_008750	GCA	2	6	1134776	1134781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_008750	GTC	2	6	1134837	1134842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008750	TAA	2	6	1134884	1134889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008750	CTC	2	6	1134936	1134941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_008750	T	6	6	1135036	1135041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008750	GAT	2	6	1135192	1135197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008750	AAT	2	6	1136249	1136254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008750	ATT	2	6	1137099	1137104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008750	TTGT	2	8	1138603	1138610	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008750	GCA	2	6	1138674	1138679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_008750	AGT	2	6	1138691	1138696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008750	ATTA	2	8	1138697	1138704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008750	CTAC	2	8	1138722	1138729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_008750	CCT	2	6	1139877	1139882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_008750	TAT	2	6	1140100	1140105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008750	TTTA	2	8	1140106	1140113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008750	GTGAGA	2	12	1140170	1140181	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008750	TTA	2	6	1140194	1140199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008750	AAT	2	6	1140212	1140217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008750	A	6	6	1140227	1140232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008750	TAT	2	6	1140306	1140311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008750	TCATT	2	10	1141692	1141701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3073	NC_008750	AAT	2	6	1142568	1142573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008750	CAGT	2	8	1142615	1142622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_008750	GC	3	6	1142657	1142662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_008750	GAG	2	6	1143373	1143378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_008750	A	6	6	1144206	1144211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008750	T	9	9	1144225	1144233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008750	TGGCT	2	10	1144357	1144366	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3080	NC_008750	AG	3	6	1145548	1145553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008750	TAA	2	6	1148804	1148809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008750	TAA	2	6	1150472	1150477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008750	CTGC	2	8	1150511	1150518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_008750	AG	3	6	1150533	1150538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008750	T	6	6	1150547	1150552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008750	TTG	2	6	1150645	1150650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008750	GCT	2	6	1150656	1150661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_008750	GTT	2	6	1151782	1151787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008750	ATG	2	6	1151929	1151934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008750	GTT	2	6	1151980	1151985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008750	CTC	2	6	1154113	1154118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_008750	A	6	6	1154171	1154176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008750	AATA	2	8	1154192	1154199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008750	TGAT	2	8	1154269	1154276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008750	GAA	2	6	1154296	1154301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008750	ACT	2	6	1154310	1154315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_008750	AGC	2	6	1154332	1154337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_008750	TG	4	8	1154403	1154410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008750	TTA	2	6	1154484	1154489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008750	TTTG	2	8	1154498	1154505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008750	TTG	2	6	1154561	1154566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008750	TGG	2	6	1154574	1154579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008750	TTG	2	6	1154596	1154601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008750	TTGT	2	8	1154607	1154614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_008750	T	6	6	1154614	1154619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_008750	TGT	2	6	1154640	1154645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_008750	AG	3	6	1154841	1154846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_008750	GTT	2	6	1157911	1157916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008750	CAT	2	6	1157933	1157938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_008750	GAT	2	6	1157997	1158002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008750	GCG	2	6	1158017	1158022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_008750	ATC	2	6	1158057	1158062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_008750	CAG	2	6	1158080	1158085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_008750	T	6	6	1158089	1158094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008750	GGC	2	6	1158098	1158103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_008750	TTAG	2	8	1159351	1159358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008750	A	7	7	1159386	1159392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008750	TGGC	2	8	1159412	1159419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_008750	CAG	2	6	1159444	1159449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_008750	A	6	6	1160173	1160178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008750	AAT	2	6	1160268	1160273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008750	CTAA	2	8	1160326	1160333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_008750	TTA	2	6	1160360	1160365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_008750	TGG	2	6	1161319	1161324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008750	TGT	2	6	1162404	1162409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_008750	TTA	2	6	1162412	1162417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_008750	GCA	2	6	1163491	1163496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_008750	T	6	6	1163949	1163954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008750	GAC	2	6	1163971	1163976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_008750	GT	3	6	1164081	1164086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008750	ACAT	2	8	1164113	1164120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3264	NC_008750	ATG	2	6	1225669	1225674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_008750	GT	3	6	1225695	1225700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_008750	ATG	2	6	1225832	1225837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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