MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 12701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008750	AGG	2	6	4646689	4646694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_008750	GTG	2	6	4646760	4646765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_008750	C	7	7	4646770	4646776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12504	NC_008750	CTT	2	6	4646794	4646799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_008750	GT	3	6	4646830	4646835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_008750	ACG	2	6	4646931	4646936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_008750	GT	3	6	4646999	4647004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_008750	ATG	2	6	4647024	4647029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_008750	CGT	2	6	4647036	4647041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_008750	TCC	2	6	4647050	4647055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_008750	CCA	2	6	4647086	4647091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12512	NC_008750	GAC	2	6	4647164	4647169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_008750	GCA	2	6	4647176	4647181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_008750	TTC	2	6	4647252	4647257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12516	NC_008750	TCC	2	6	4647515	4647520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_008750	C	6	6	4647559	4647564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12518	NC_008750	GCT	2	6	4647705	4647710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_008750	CTT	2	6	4647730	4647735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_008750	TCC	2	6	4647779	4647784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_008750	CTT	2	6	4647814	4647819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_008750	CA	3	6	4647820	4647825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_008750	CTG	2	6	4647873	4647878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12526	NC_008750	CCT	2	6	4648028	4648033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12530	NC_008750	TTG	2	6	4648235	4648240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_008750	A	6	6	4648296	4648301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_008750	ATT	2	6	4648340	4648345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_008750	CA	3	6	4648418	4648423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12534	NC_008750	CTTT	2	8	4648564	4648571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12537	NC_008750	GCT	2	6	4648615	4648620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_008750	TAAAA	2	10	4648687	4648696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_008750	CAA	2	6	4648700	4648705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_008750	CGAA	2	8	4648727	4648734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12541	NC_008750	A	6	6	4648741	4648746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_008750	TTA	2	6	4650301	4650306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_008750	TAAT	2	8	4650315	4650322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_008750	TTGA	2	8	4650758	4650765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_008750	GACA	2	8	4650798	4650805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12546	NC_008750	T	6	6	4651783	4651788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_008750	ATC	2	6	4651860	4651865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12549	NC_008750	A	7	7	4652173	4652179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_008750	GTT	2	6	4654073	4654078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12552	NC_008750	GAAAC	2	10	4654905	4654914	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12553	NC_008750	T	6	6	4654915	4654920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_008750	AC	3	6	4654935	4654940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_008750	T	6	6	4654960	4654965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_008750	CTAG	2	8	4654972	4654979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12557	NC_008750	A	6	6	4655001	4655006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12560	NC_008750	ATT	2	6	4657335	4657340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_008750	TAA	2	6	4657351	4657356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_008750	A	6	6	4658841	4658846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_008750	AAGCG	2	10	4658892	4658901	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12564	NC_008750	AATC	2	8	4658914	4658921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12565	NC_008750	T	6	6	4658986	4658991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12599	NC_008750	T	7	7	4679792	4679798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_008750	ATA	2	6	4679821	4679826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_008750	AGG	2	6	4679879	4679884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12607	NC_008750	AG	3	6	4680254	4680259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_008750	TATG	2	8	4680356	4680363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_008750	AAAAT	2	10	4680472	4680481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_008750	TGT	2	6	4680498	4680503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12613	NC_008750	AT	3	6	4681314	4681319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_008750	TA	3	6	4681325	4681330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_008750	ATTT	2	8	4681333	4681340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12619	NC_008750	AAT	2	6	4681447	4681452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_008750	A	6	6	4681471	4681476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_008750	TAAA	2	8	4681482	4681489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_008750	ATA	2	6	4684949	4684954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_008750	CTA	2	6	4685663	4685668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_008750	AT	3	6	4685861	4685866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_008750	TCC	2	6	4685965	4685970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12626	NC_008750	GGA	2	6	4685989	4685994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12628	NC_008750	TGC	3	9	4686032	4686040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.