MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 9189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008700	GTA	2	6	1869788	1869793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008700	TCA	2	6	1869847	1869852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008700	GCG	2	6	1869945	1869950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_008700	GGC	2	6	1870067	1870072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_008700	TGT	2	6	1870083	1870088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008700	G	6	6	1870097	1870102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008700	TCC	2	6	1870107	1870112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_008700	CTGA	2	8	1870127	1870134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_008700	GGA	2	6	1870417	1870422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008700	CGG	2	6	1870639	1870644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_008700	CGTC	2	8	1870652	1870659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_008700	AAC	2	6	1870671	1870676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_008700	AGC	2	6	1870761	1870766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008700	CAT	2	6	1870767	1870772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_008700	AAAG	2	8	1870775	1870782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008700	AGTCG	2	10	1870797	1870806	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_008700	TGAAGG	2	12	1870902	1870913	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008700	GA	3	6	1871114	1871119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008700	GTTG	2	8	1871144	1871151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008700	GGT	2	6	1871163	1871168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008700	CA	3	6	1871195	1871200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_008700	TGA	2	6	1871213	1871218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_008700	TCT	2	6	1871266	1871271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_008700	GGT	2	6	1871312	1871317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008700	GA	3	6	1871342	1871347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008700	GCT	2	6	1871400	1871405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_008700	ATTG	2	8	1871545	1871552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008700	CGG	2	6	1871593	1871598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_008700	ATG	2	6	1871669	1871674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_008700	ACC	2	6	1871864	1871869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_008700	TGG	2	6	1871925	1871930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008700	TCC	2	6	1871951	1871956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_008700	GGA	2	6	1871968	1871973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008700	GACA	2	8	1872045	1872052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_008700	GGT	2	6	1872088	1872093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008700	CGG	2	6	1872175	1872180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_008700	TCA	2	6	1872203	1872208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_008700	CGT	2	6	1872283	1872288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_008700	G	6	6	1872332	1872337	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_008700	GAAC	2	8	1872365	1872372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_008700	GT	3	6	1872536	1872541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008700	TTGA	2	8	1872647	1872654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008700	AGT	2	6	1872834	1872839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008700	AGC	2	6	1872847	1872852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_008700	A	6	6	1872915	1872920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008700	T	6	6	1872940	1872945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_008700	CCAT	2	8	1873088	1873095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_008700	ATA	2	6	1873797	1873802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_008700	AAGG	2	8	1873868	1873875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008700	GGGC	2	8	1875190	1875197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_008700	GAA	2	6	1879384	1879389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008700	AGGGG	2	10	1882612	1882621	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_008700	CCT	2	6	1882693	1882698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_008700	TG	3	6	1884053	1884058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008700	TA	3	6	1884179	1884184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008700	TTG	2	6	1884244	1884249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008700	TGA	2	6	1887193	1887198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008700	TTCGG	2	10	1887250	1887259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4059	NC_008700	AGC	2	6	1887290	1887295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_008700	CG	3	6	1888870	1888875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_008700	GA	3	6	1888920	1888925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008700	A	6	6	1889762	1889767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008700	T	8	8	1889784	1889791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008700	CAG	2	6	1891385	1891390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_008700	TAT	2	6	1893607	1893612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008700	CTTTA	2	10	1893616	1893625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4067	NC_008700	GA	3	6	1893716	1893721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008700	TGC	2	6	1893748	1893753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_008700	T	6	6	1893759	1893764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_008700	ATG	2	6	1893848	1893853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_008700	TGC	2	6	1893888	1893893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_008700	T	6	6	1893899	1893904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008700	AGC	2	6	1893999	1894004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4080	NC_008700	TGC	2	6	1894168	1894173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_008700	T	6	6	1894179	1894184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_008700	CAT	2	6	1894281	1894286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008700	A	6	6	1894293	1894298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008700	TGC	2	6	1894308	1894313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4088	NC_008700	T	6	6	1894459	1894464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4093	NC_008700	A	6	6	1894713	1894718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_008700	TGC	2	6	1894728	1894733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008700	T	6	6	1894739	1894744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008700	GCC	2	6	1894889	1894894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_008700	TGA	2	6	1894910	1894915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008700	TCA	2	6	1894964	1894969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_008700	A	6	6	1897075	1897080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008700	ATA	2	6	1897110	1897115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008700	CTATCA	2	12	1897130	1897141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_008700	AAAG	2	8	1898192	1898199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008700	TGC	2	6	1898252	1898257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_008700	TTG	2	6	1898258	1898263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008700	CTG	2	6	1898316	1898321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_008700	TGC	2	6	1899161	1899166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_008700	GCG	2	6	1899188	1899193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_008700	CGGCC	2	10	1899301	1899310	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4109	NC_008700	A	7	7	1901133	1901139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008700	CGC	2	6	1901140	1901145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_008700	GCG	2	6	1901155	1901160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_008700	T	6	6	1901161	1901166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008700	ACC	2	6	1901181	1901186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_008700	GGT	2	6	1901196	1901201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008700	AGTA	2	8	1901277	1901284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008700	GGC	2	6	1901809	1901814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_008700	CTG	2	6	1901826	1901831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008700	ACA	2	6	1901910	1901915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_008700	TCA	2	6	1901986	1901991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_008700	GCT	2	6	1902053	1902058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_008700	GAT	2	6	1902629	1902634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_008700	GATG	2	8	1902760	1902767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008700	GCT	2	6	1903005	1903010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008700	A	7	7	1903027	1903033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008700	G	6	6	1903040	1903045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008700	TGTCT	2	10	1905289	1905298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4127	NC_008700	A	6	6	1905356	1905361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008700	AAC	2	6	1905395	1905400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_008700	GT	4	8	1907618	1907625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4131	NC_008700	GGC	2	6	1907687	1907692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4264	NC_008700	TTTA	2	8	1967892	1967899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_008700	TCAG	2	8	1968025	1968032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4266	NC_008700	TTGA	2	8	1968057	1968064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_008700	TCC	2	6	1968163	1968168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4269	NC_008700	GTG	2	6	1968307	1968312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_008700	CGT	2	6	1968354	1968359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4272	NC_008700	CATG	2	8	1968555	1968562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4277	NC_008700	AGTC	2	8	1970177	1970184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4279	NC_008700	ATA	2	6	1971808	1971813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4280	NC_008700	TC	3	6	1971837	1971842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4281	NC_008700	GCAG	2	8	1971849	1971856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4284	NC_008700	CT	3	6	1972461	1972466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4285	NC_008700	CTGC	2	8	1972537	1972544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4286	NC_008700	ACG	2	6	1972548	1972553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4294	NC_008700	TG	3	6	1973396	1973401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4295	NC_008700	AAGAG	2	10	1973412	1973421	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4296	NC_008700	G	7	7	1973433	1973439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_008700	GTT	2	6	1979257	1979262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4299	NC_008700	AC	3	6	1979345	1979350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4302	NC_008700	T	6	6	1980453	1980458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4303	NC_008700	AAC	2	6	1980475	1980480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4305	NC_008700	CTT	2	6	1980978	1980983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4334	NC_008700	GAAT	2	8	1995800	1995807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4361	NC_008700	CAAT	2	8	2002178	2002185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4362	NC_008700	CAAT	2	8	2002191	2002198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4383	NC_008700	GC	3	6	2008287	2008292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4388	NC_008700	CAG	2	6	2010798	2010803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4389	NC_008700	CGG	2	6	2012324	2012329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_008700	AAAGG	2	10	2013853	2013862	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_008700	TGAA	2	8	2013914	2013921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_008700	CAT	2	6	2014484	2014489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4394	NC_008700	TG	3	6	2016991	2016996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4396	NC_008700	GGCA	2	8	2018726	2018733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4397	NC_008700	CAT	2	6	2018851	2018856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4398	NC_008700	GTTT	2	8	2018936	2018943	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_008700	TCAA	2	8	2018986	2018993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4400	NC_008700	CTG	2	6	2020864	2020869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4402	NC_008700	T	6	6	2020938	2020943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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