MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 9189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008700	TTTA	2	8	1623335	1623342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_008700	TAT	2	6	1623358	1623363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008700	AAAT	2	8	1623375	1623382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008700	CAG	2	6	1623404	1623409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_008700	AAT	2	6	1624661	1624666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_008700	GA	4	8	1624701	1624708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_008700	A	7	7	1626683	1626689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008700	T	6	6	1626707	1626712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008700	T	7	7	1632794	1632800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_008700	GCC	2	6	1632992	1632997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_008700	GGC	2	6	1634292	1634297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_008700	A	6	6	1634321	1634326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_008700	GCA	2	6	1634570	1634575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_008700	AACT	2	8	1635208	1635215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_008700	GCG	2	6	1635236	1635241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_008700	ACT	2	6	1635403	1635408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_008700	ACTTT	2	10	1635415	1635424	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3518	NC_008700	AAC	2	6	1635449	1635454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_008700	ATAA	2	8	1635458	1635465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008700	AAC	2	6	1635475	1635480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_008700	CGCC	2	8	1635660	1635667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3522	NC_008700	TTG	2	6	1635683	1635688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008700	GCA	2	6	1636175	1636180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_008700	TTG	2	6	1636193	1636198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008700	CGCC	2	8	1636655	1636662	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3526	NC_008700	TCT	2	6	1637765	1637770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_008700	TCC	2	6	1638364	1638369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_008700	CGCC	2	8	1638381	1638388	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3529	NC_008700	TGA	2	6	1638437	1638442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_008700	GAC	2	6	1639025	1639030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_008700	TGC	2	6	1639070	1639075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_008700	GCC	2	6	1639850	1639855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_008700	CCT	2	6	1640207	1640212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_008700	T	6	6	1640212	1640217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_008700	AAATT	2	10	1641395	1641404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008700	ACA	2	6	1641827	1641832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_008700	ACA	2	6	1642931	1642936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_008700	GAT	2	6	1643532	1643537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_008700	TTTG	2	8	1643579	1643586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008700	TTA	2	6	1643626	1643631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008700	TAA	2	6	1643639	1643644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008700	CAAT	2	8	1643674	1643681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_008700	TA	3	6	1643729	1643734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_008700	GTT	2	6	1643737	1643742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_008700	T	7	7	1643741	1643747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_008700	ATG	2	6	1644846	1644851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008700	GA	3	6	1644898	1644903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008700	T	7	7	1644952	1644958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008700	GTT	2	6	1644977	1644982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008700	TTA	2	6	1645043	1645048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_008700	ATAA	2	8	1645062	1645069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008700	GAT	2	6	1645088	1645093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_008700	AGC	2	6	1645117	1645122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_008700	CTG	2	6	1646584	1646589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_008700	GGT	2	6	1646598	1646603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_008700	GTGCT	2	10	1646604	1646613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3557	NC_008700	TCC	2	6	1652048	1652053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_008700	TGCC	2	8	1652069	1652076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_008700	TTG	2	6	1653349	1653354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008700	AT	3	6	1653854	1653859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008700	GTAAAG	2	12	1653869	1653880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008700	TG	3	6	1653889	1653894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008700	GCTTA	2	10	1653926	1653935	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3564	NC_008700	ATC	2	6	1654004	1654009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_008700	ACCTA	2	10	1654015	1654024	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3566	NC_008700	TG	3	6	1654054	1654059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008700	GCC	2	6	1654072	1654077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_008700	G	6	6	1654095	1654100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008700	AAT	2	6	1654117	1654122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008700	AAGG	2	8	1654132	1654139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008700	GGA	2	6	1654174	1654179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_008700	T	6	6	1656163	1656168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008700	CCG	2	6	1656261	1656266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_008700	TAAA	2	8	1657933	1657940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008700	TTTA	2	8	1657963	1657970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_008700	CA	3	6	1658977	1658982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_008700	TTTA	2	8	1659044	1659051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_008700	CT	3	6	1660014	1660019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_008700	AG	3	6	1660039	1660044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008700	AGC	2	6	1661921	1661926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_008700	CTGCG	2	10	1661969	1661978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3582	NC_008700	GGCGC	2	10	1662000	1662009	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3583	NC_008700	CTG	2	6	1662221	1662226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_008700	ACA	2	6	1662235	1662240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_008700	GTG	2	6	1662324	1662329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_008700	GTT	2	6	1663078	1663083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_008700	A	6	6	1663106	1663111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008700	TATG	2	8	1663999	1664006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_008700	CAA	2	6	1666923	1666928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_008700	GCTGC	2	10	1666975	1666984	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3591	NC_008700	AAACCA	2	12	1668538	1668549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_008700	GCCTT	2	10	1670601	1670610	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3593	NC_008700	GACAT	2	10	1670612	1670621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3594	NC_008700	GAGC	2	8	1670630	1670637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_008700	T	6	6	1677401	1677406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_008700	CTG	2	6	1677407	1677412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_008700	T	6	6	1679206	1679211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008700	GCA	2	6	1679218	1679223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008700	GT	3	6	1679727	1679732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008700	CTGGT	2	10	1679748	1679757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3601	NC_008700	TGG	2	6	1679808	1679813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008700	AAT	2	6	1680724	1680729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008700	AAT	2	6	1680734	1680739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_008700	T	6	6	1680758	1680763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_008700	TCAA	2	8	1680792	1680799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_008700	C	6	6	1682004	1682009	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3607	NC_008700	TC	3	6	1682047	1682052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_008700	TCA	2	6	1682072	1682077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_008700	TCA	2	6	1682150	1682155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008700	GGT	2	6	1685300	1685305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_008700	TGG	2	6	1685310	1685315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_008700	CTG	2	6	1685352	1685357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_008700	A	6	6	1685371	1685376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008700	CGG	2	6	1685383	1685388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_008700	T	6	6	1685393	1685398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_008700	TGATAA	2	12	1687609	1687620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_008700	ATT	2	6	1687643	1687648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_008700	GCG	2	6	1687675	1687680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_008700	CCG	2	6	1687690	1687695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_008700	TCT	2	6	1687723	1687728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008700	AGG	2	6	1687816	1687821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_008700	CTGG	2	8	1688342	1688349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_008700	TCA	2	6	1688370	1688375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_008700	GT	3	6	1688378	1688383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_008700	CTT	2	6	1688468	1688473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_008700	TTCTG	2	10	1688497	1688506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3627	NC_008700	GGCT	2	8	1688533	1688540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_008700	CTG	2	6	1688561	1688566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_008700	CT	3	6	1688597	1688602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_008700	TAAA	2	8	1688638	1688645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_008700	AGT	2	6	1688728	1688733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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