MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 9189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008700	TTAA	2	8	553373	553380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008700	TTTG	2	8	553391	553398	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008700	GGTT	2	8	553467	553474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008700	CGT	2	6	553573	553578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_008700	AGAC	2	8	554860	554867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_008700	CCG	2	6	554935	554940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_008700	ATA	2	6	556964	556969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008700	TTA	2	6	556971	556976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008700	CGC	2	6	557000	557005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_008700	TA	3	6	566739	566744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008700	GCT	2	6	566768	566773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008700	GTT	2	6	568042	568047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008700	CTG	2	6	570356	570361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_008700	GCTG	2	8	570375	570382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_008700	ACC	2	6	570427	570432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_008700	AAT	2	6	570443	570448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008700	AAT	2	6	572977	572982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008700	GTTTG	2	10	573014	573023	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008700	TCA	2	6	573041	573046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_008700	A	8	8	573062	573069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008700	TTTTC	2	10	573140	573149	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1522	NC_008700	CTC	2	6	573155	573160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_008700	CCT	2	6	574264	574269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_008700	TTA	2	6	583161	583166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008700	TAG	2	6	584664	584669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008700	T	6	6	584725	584730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008700	GTT	2	6	584898	584903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008700	GTG	2	6	584904	584909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008700	GCT	2	6	585011	585016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_008700	CTGA	2	8	585017	585024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_008700	A	6	6	585090	585095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008700	T	6	6	585115	585120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008700	GTC	2	6	586280	586285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_008700	A	6	6	586299	586304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008700	ATA	2	6	586960	586965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008700	GTC	2	6	586981	586986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_008700	T	6	6	586990	586995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008700	CGC	2	6	587008	587013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_008700	ATG	2	6	587186	587191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008700	CCT	2	6	587196	587201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_008700	GCA	2	6	587205	587210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008700	A	6	6	587238	587243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008700	CAC	2	6	587347	587352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_008700	TCTG	2	8	592248	592255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_008700	CT	3	6	592831	592836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_008700	CTG	2	6	592875	592880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008700	AAG	2	6	594420	594425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_008700	CT	3	6	595337	595342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_008700	CGG	2	6	595435	595440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_008700	A	6	6	597235	597240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008700	GC	3	6	597243	597248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_008700	GT	3	6	597280	597285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008700	T	7	7	597318	597324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008700	CAGA	2	8	597367	597374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_008700	AG	3	6	598143	598148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008700	CT	3	6	598159	598164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_008700	GAC	2	6	598705	598710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_008700	TGA	2	6	598766	598771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008700	CAT	2	6	598866	598871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_008700	CGT	2	6	598895	598900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_008700	T	6	6	599918	599923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008700	CCT	2	6	600403	600408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_008700	T	6	6	600448	600453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008700	A	7	7	600514	600520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008700	GAAA	2	8	600542	600549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008700	GC	3	6	600640	600645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_008700	ATG	2	6	602595	602600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008700	GCT	2	6	602608	602613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_008700	TGT	2	6	602679	602684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008700	A	6	6	602723	602728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008700	GC	3	6	602764	602769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_008700	TG	3	6	603912	603917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008700	GGT	2	6	604114	604119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008700	TG	3	6	604183	604188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_008700	AT	3	6	605749	605754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008700	GA	3	6	605760	605765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008700	GTA	2	6	605820	605825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008700	ACT	2	6	605888	605893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_008700	A	6	6	605909	605914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008700	TGT	2	6	605947	605952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008700	T	6	6	605954	605959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008700	GAAT	2	8	605967	605974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008700	TAT	2	6	605985	605990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008700	ATT	2	6	606064	606069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_008700	CAA	2	6	606087	606092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_008700	T	6	6	606108	606113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008700	TAA	2	6	606135	606140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008700	GGA	2	6	606165	606170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_008700	TCA	2	6	606179	606184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_008700	TGATAC	2	12	606206	606217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1591	NC_008700	TG	3	6	606237	606242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008700	AT	3	6	606302	606307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008700	TGC	2	6	608952	608957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_008700	AGG	2	6	611349	611354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008700	TGCT	2	8	612837	612844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_008700	CAT	2	6	612846	612851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_008700	TCC	2	6	612860	612865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_008700	GCA	2	6	614772	614777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_008700	GGC	2	6	614802	614807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_008700	CAA	2	6	615439	615444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_008700	CAGC	2	8	615459	615466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_008700	TGA	2	6	615469	615474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008700	A	6	6	615482	615487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008700	GCC	2	6	615488	615493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_008700	GGC	2	6	615498	615503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_008700	T	6	6	615504	615509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_008700	TTAT	2	8	617313	617320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008700	GAC	2	6	617928	617933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_008700	TGA	2	6	619059	619064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008700	AGT	2	6	619100	619105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_008700	AGG	2	6	619126	619131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008700	ATT	2	6	620721	620726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_008700	ATC	2	6	620759	620764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008700	GCG	2	6	620892	620897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_008700	CGC	2	6	621969	621974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_008700	CAG	2	6	621999	622004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_008700	TCT	2	6	622037	622042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_008700	GCG	2	6	623950	623955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_008700	CTGA	2	8	623959	623966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_008700	A	7	7	623993	623999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008700	GCG	2	6	624004	624009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_008700	ATC	2	6	625054	625059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_008700	TC	3	6	625096	625101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_008700	CAAAA	2	10	626090	626099	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_008700	GCT	2	6	626123	626128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_008700	C	6	6	626175	626180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1627	NC_008700	GAC	2	6	626217	626222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008700	TTG	2	6	626246	626251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008700	CAA	2	6	626422	626427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_008700	GTT	2	6	628405	628410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_008700	A	6	6	628421	628426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008700	TGA	2	6	630405	630410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_008700	AGAC	2	8	630417	630424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_008700	AACC	2	8	630430	630437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_008700	TCCGAA	2	12	630455	630466	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_008700	AGC	2	6	630480	630485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1638	NC_008700	A	6	6	634461	634466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_008700	CTG	2	6	634517	634522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1655	NC_008700	TAC	2	6	640678	640683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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