MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 9189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008700	TGAC	2	8	379422	379429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_008700	TGA	2	6	379449	379454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008700	ATG	2	6	379541	379546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008700	TCC	2	6	379839	379844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_008700	GGC	2	6	379890	379895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008700	CCGT	2	8	379902	379909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_008700	AAG	2	6	379980	379985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008700	ACA	2	6	380135	380140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008700	ATA	2	6	380158	380163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008700	GCAA	2	8	380173	380180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_008700	TAA	2	6	380190	380195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008700	AAT	2	6	380201	380206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008700	T	7	7	380314	380320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008700	TGT	2	6	380990	380995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008700	AC	3	6	382024	382029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_008700	GAT	2	6	382043	382048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008700	A	6	6	382058	382063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008700	TCA	2	6	382064	382069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_008700	TGGA	2	8	382070	382077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008700	CAC	2	6	382097	382102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_008700	CAAGC	2	10	382164	382173	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_008700	TAT	2	6	382258	382263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008700	GTT	2	6	382307	382312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008700	CAG	2	6	382360	382365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008700	AGCC	2	8	382407	382414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_008700	AGG	2	6	382438	382443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008700	CTG	2	6	382485	382490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_008700	CTA	2	6	382534	382539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008700	TTGT	2	8	382573	382580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008700	ATCCCA	2	12	382599	382610	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_008700	GCA	2	6	382638	382643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008700	AAT	2	6	382655	382660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008700	CATT	2	8	382682	382689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_008700	TGC	2	6	382712	382717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_008700	TTC	2	6	382772	382777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_008700	GTTT	2	8	382811	382818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008700	GGTT	2	8	382904	382911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008700	CTT	2	6	382959	382964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008700	AGC	2	6	382972	382977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008700	GCG	2	6	383109	383114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_008700	AGC	2	6	383151	383156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_008700	GCT	2	6	383171	383176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_008700	TCC	2	6	384142	384147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_008700	CGG	2	6	384329	384334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_008700	CGC	2	6	384379	384384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_008700	CAT	2	6	384399	384404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008700	GC	3	6	384446	384451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_008700	TAC	2	6	384472	384477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008700	GTT	2	6	384577	384582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008700	CGC	3	9	384588	384596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_008700	GTA	2	6	384628	384633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008700	GC	3	6	384650	384655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_008700	CGG	2	6	384695	384700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_008700	T	6	6	384744	384749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008700	CA	3	6	384758	384763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_008700	A	6	6	386470	386475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008700	GTT	2	6	386496	386501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008700	GTG	2	6	386510	386515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008700	CG	3	6	387492	387497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_008700	ATT	2	6	387558	387563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008700	T	7	7	388318	388324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008700	ACC	2	6	388349	388354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_008700	AGC	2	6	388382	388387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008700	A	6	6	389107	389112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008700	CGC	2	6	389113	389118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_008700	GCG	2	6	389124	389129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008700	T	6	6	389130	389135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008700	CAT	2	6	389821	389826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008700	A	6	6	389937	389942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008700	GCC	2	6	389977	389982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_008700	TTG	2	6	391947	391952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008700	GTT	2	6	391956	391961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008700	A	6	6	392009	392014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008700	CGC	2	6	394388	394393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_008700	T	6	6	395726	395731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008700	AAAT	2	8	395860	395867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008700	GT	3	6	395923	395928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008700	AAC	2	6	397298	397303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_008700	GTT	2	6	397318	397323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008700	GCT	2	6	397335	397340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_008700	TGA	2	6	397404	397409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008700	ACC	2	6	398023	398028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_008700	AGATG	2	10	398038	398047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008700	CTT	2	6	398075	398080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008700	CTG	2	6	398088	398093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_008700	CTGG	2	8	399007	399014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_008700	TGGC	2	8	399044	399051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_008700	TTG	2	6	399053	399058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008700	AAT	2	6	399073	399078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008700	CCG	2	6	399151	399156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_008700	ATG	2	6	402906	402911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_008700	GAT	2	6	402986	402991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008700	CCT	2	6	403106	403111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_008700	GGA	2	6	403138	403143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008700	CGCT	2	8	403156	403163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_008700	T	6	6	403208	403213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008700	TAG	2	6	408095	408100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008700	T	6	6	408115	408120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008700	GTT	2	6	408231	408236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008700	GTTT	2	8	408247	408254	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008700	TGTT	2	8	408260	408267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008700	AAAT	2	8	408268	408275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008700	TTG	2	6	408302	408307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008700	ATG	2	6	408350	408355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008700	T	6	6	408357	408362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008700	CTG	2	6	408399	408404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008700	TCG	2	6	408505	408510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008700	CAG	2	6	408530	408535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008700	A	6	6	409909	409914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008700	TTGC	2	8	409935	409942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_008700	GT	3	6	409976	409981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008700	TGC	2	6	412325	412330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008700	TG	3	6	414237	414242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008700	T	6	6	414243	414248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008700	AAC	2	6	414287	414292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_008700	CG	3	6	414306	414311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_008700	GAC	2	6	414439	414444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_008700	AAG	2	6	414924	414929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008700	TCA	2	6	426934	426939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008700	GTT	2	6	426948	426953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008700	TA	3	6	426985	426990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008700	GAG	2	6	427019	427024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008700	A	7	7	430310	430316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008700	ACAG	2	8	430322	430329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_008700	T	6	6	430350	430355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008700	TTG	2	6	430436	430441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008700	ATA	2	6	431385	431390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008700	AAG	2	6	431857	431862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008700	TG	3	6	435696	435701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008700	A	6	6	435728	435733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008700	A	6	6	435738	435743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008700	ACA	2	6	435851	435856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_008700	TG	3	6	435967	435972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_008700	CAG	2	6	436041	436046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_008700	CCTC	2	8	458568	458575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1408	NC_008700	A	6	6	509530	509535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_008700	T	6	6	509552	509557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_008700	TGG	2	6	509560	509565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_008700	GCAGAT	2	12	510350	510361	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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