MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. ANA-3 chromosome 1

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008577	AGCGAA	2	12	50599	50610	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008577	TGAAGG	2	12	54004	54015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008577	TTTTGT	2	12	76903	76914	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008577	CGATAA	2	12	78639	78650	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008577	CAATTG	2	12	97445	97456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008577	GGAAAG	2	12	109145	109156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008577	GATCTC	2	12	115439	115450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008577	TGAAGG	2	12	219162	219173	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008577	TGAAGG	2	12	270360	270371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008577	AATTTG	2	12	294812	294823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008577	GGCTTT	4	24	331214	331237	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008577	GGCTTG	2	12	331238	331249	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008577	TGAATG	2	12	334176	334187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008577	TCGTCA	2	12	359238	359249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008577	AAGTGC	2	12	380654	380665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008577	ATTCGA	2	12	405591	405602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008577	TAAGCC	2	12	458925	458936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008577	ATGAAA	2	12	500835	500846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008577	ATGAAA	2	12	504594	504605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008577	ATTTAT	2	12	520722	520733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008577	CCCATA	2	12	536799	536810	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008577	AAATCA	2	12	539083	539094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008577	TTTCGA	2	12	540416	540427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008577	CTATGA	2	12	556121	556132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008577	AACGAT	2	12	576167	576178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008577	GTTAAA	2	12	610750	610761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008577	GCAGAA	2	12	622686	622697	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008577	AAGCAA	2	12	688933	688944	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008577	ATTAGC	2	12	693233	693244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008577	TAATGC	2	12	693504	693515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008577	ACTAAA	2	12	700803	700814	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008577	GGAGTT	2	12	704635	704646	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008577	TATTCA	2	12	714579	714590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008577	AAGATA	2	12	714807	714818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008577	CTAAAG	2	12	734003	734014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008577	GTGTAG	2	12	739208	739219	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008577	TCTTTA	2	12	741117	741128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008577	ACCTTT	2	12	763646	763657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008577	AAAGAT	2	12	764744	764755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008577	ATTTAT	2	12	786362	786373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008577	TATGGC	2	12	797122	797133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008577	CTGCTA	2	12	838035	838046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008577	CTGATC	2	12	857897	857908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008577	CAAAGG	2	12	859807	859818	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008577	ATAAAA	2	12	878163	878174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008577	TCCATA	2	12	928293	928304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008577	ATGGCA	2	12	962793	962804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008577	AATGCT	2	12	1016654	1016665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008577	GTCTTT	2	12	1017009	1017020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008577	AACTCG	2	12	1045238	1045249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008577	TTAAGC	2	12	1061506	1061517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008577	TGCGCC	2	12	1062854	1062865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008577	AAACCA	2	12	1068744	1068755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008577	TATTTC	2	12	1069587	1069598	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008577	TAATGA	2	12	1074812	1074823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008577	CGAGTG	2	12	1082568	1082579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008577	TGCGAA	2	12	1091975	1091986	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008577	CAAAGT	2	12	1127498	1127509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008577	CTGAGC	2	12	1188381	1188392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008577	TGTAAT	2	12	1218855	1218866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008577	CGCATG	2	12	1245979	1245990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008577	TTTTTA	2	12	1278241	1278252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008577	ACTTGC	2	12	1285234	1285245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008577	GGCACT	2	12	1292217	1292228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008577	ATTGGT	2	12	1315702	1315713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008577	ACTTTA	2	12	1321302	1321313	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008577	AGCTTT	2	12	1333224	1333235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008577	AGCTTG	2	12	1338251	1338262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008577	TTACGT	2	12	1342453	1342464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008577	TAACAA	2	12	1349361	1349372	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008577	CTTTTG	2	12	1367000	1367011	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008577	ATCATT	2	12	1407872	1407883	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008577	TTATGG	2	12	1438594	1438605	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008577	TTCCTA	2	12	1471358	1471369	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008577	ACCGGC	2	12	1490982	1490993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008577	GCCAAA	10	60	1503896	1503955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008577	ACGTTA	2	12	1622601	1622612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008577	GCAGGG	2	12	1656251	1656262	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008577	TGAACT	2	12	1661299	1661310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008577	GCATTG	2	12	1702518	1702529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008577	AAAACA	2	12	1705584	1705595	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008577	TTTTAG	2	12	1729717	1729728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008577	ATCCAA	2	12	1748391	1748402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008577	GGAACT	2	12	1813703	1813714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008577	ATCGGA	2	12	1824475	1824486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008577	TGAAGG	2	12	1856647	1856658	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008577	TATTTA	2	12	1861906	1861917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008577	TTCACC	3	18	1899287	1899304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008577	ATTGCA	2	12	1930628	1930639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008577	TATTGA	2	12	1934621	1934632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008577	AAGCAT	2	12	1941989	1942000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008577	GTAAAG	2	12	1966433	1966444	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008577	CTACTG	2	12	1995852	1995863	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008577	TGCGAG	2	12	1998813	1998824	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008577	ACGTAA	2	12	2056854	2056865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008577	ACTTCC	2	12	2066466	2066477	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008577	ACAAAG	2	12	2085192	2085203	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008577	GAATAA	2	12	2085207	2085218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008577	AAGGGC	2	12	2125352	2125363	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008577	AGGATG	2	12	2128349	2128360	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008577	GACAAT	2	12	2164532	2164543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008577	ACTTTC	2	12	2172202	2172213	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008577	AAAACA	2	12	2176189	2176200	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008577	TCAAGC	2	12	2177531	2177542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008577	ATTAAA	2	12	2301471	2301482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008577	AAAGTA	2	12	2341516	2341527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008577	CTTTTT	2	12	2363763	2363774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008577	CTATTT	2	12	2454531	2454542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008577	GAGTTA	2	12	2526547	2526558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008577	GGCACG	2	12	2527199	2527210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008577	TAAAAG	2	12	2531550	2531561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008577	AAAAAC	2	12	2580820	2580831	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008577	AGCTGC	2	12	2592841	2592852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008577	ATAAAC	2	12	2648705	2648716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008577	CCGAGT	2	12	2654085	2654096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008577	ATCCTT	2	12	2656470	2656481	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008577	CAAAAC	2	12	2715840	2715851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008577	CTTTAG	2	12	2746786	2746797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008577	AGATTA	2	12	2780260	2780271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008577	TTATGG	2	12	2820340	2820351	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008577	GATCAC	3	18	2828916	2828933	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008577	TATAAA	2	12	2838952	2838963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008577	GGTCAC	2	12	2842005	2842016	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008577	ATTTAT	2	12	2914506	2914517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008577	CATGCG	2	12	2980120	2980131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008577	TGAGGA	4	24	2995715	2995738	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008577	CAAAAA	2	12	3041690	3041701	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008577	AAAACA	2	12	3059939	3059950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008577	GTCCCA	2	12	3067812	3067823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008577	GCTTTA	2	12	3078585	3078596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008577	TTCACC	2	12	3092525	3092536	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008577	TAAGCC	2	12	3100591	3100602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.