MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. ANA-3 chromosome 1

Total Repeats: 12467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008577	CAT	2	6	1184512	1184517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008577	AGCAC	2	10	1184635	1184644	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3003	NC_008577	TTTG	2	8	1184744	1184751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008577	TC	3	6	1184840	1184845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_008577	TGA	2	6	1184878	1184883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008577	ACG	2	6	1184987	1184992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_008577	TCT	2	6	1185062	1185067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_008577	A	6	6	1185168	1185173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008577	GAT	2	6	1185916	1185921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008577	CGG	3	9	1185950	1185958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_008577	ATT	2	6	1186085	1186090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008577	GCT	2	6	1186103	1186108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_008577	ATA	2	6	1186199	1186204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008577	CT	3	6	1186216	1186221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_008577	TGG	2	6	1186263	1186268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008577	CTT	2	6	1186294	1186299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008577	AGTC	2	8	1186303	1186310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_008577	ATC	2	6	1186332	1186337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_008577	CTC	2	6	1188301	1188306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_008577	TAT	2	6	1188359	1188364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008577	CTGAGC	2	12	1188381	1188392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_008577	AAG	2	6	1188528	1188533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008577	A	6	6	1189046	1189051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008577	GCC	2	6	1189052	1189057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_008577	T	6	6	1189067	1189072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008577	TCA	2	6	1189191	1189196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008577	TCT	2	6	1189232	1189237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008577	TCA	2	6	1189247	1189252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_008577	CAC	2	6	1190069	1190074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_008577	TTA	2	6	1190157	1190162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008577	AAAAC	2	10	1192988	1192997	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3032	NC_008577	TA	3	6	1193388	1193393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008577	TTG	2	6	1193413	1193418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008577	ATC	2	6	1194072	1194077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_008577	GTT	2	6	1196064	1196069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008577	GC	3	6	1196185	1196190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_008577	TAA	2	6	1198612	1198617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008577	TAT	2	6	1198627	1198632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_008577	CGC	2	6	1198636	1198641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_008577	GGT	2	6	1199792	1199797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_008577	ATA	2	6	1199873	1199878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008577	GCAA	2	8	1199917	1199924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_008577	CA	3	6	1199946	1199951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_008577	AGC	2	6	1199967	1199972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_008577	TCG	2	6	1199981	1199986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_008577	GTC	2	6	1200003	1200008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_008577	TAA	2	6	1200088	1200093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008577	T	6	6	1200110	1200115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008577	T	6	6	1200178	1200183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008577	T	6	6	1200185	1200190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008577	GGC	2	6	1204894	1204899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_008577	GCC	2	6	1204904	1204909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_008577	TTA	2	6	1206354	1206359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008577	GC	4	8	1206376	1206383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_008577	GC	3	6	1206404	1206409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_008577	GA	3	6	1206457	1206462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008577	A	6	6	1206754	1206759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008577	CCT	2	6	1206770	1206775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_008577	T	6	6	1206775	1206780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008577	CT	4	8	1206806	1206813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_008577	TAT	2	6	1208886	1208891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008577	TCA	2	6	1208978	1208983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_008577	CG	3	6	1209026	1209031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_008577	ATTA	2	8	1209044	1209051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008577	TGTT	2	8	1211237	1211244	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008577	TAA	2	6	1211251	1211256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008577	TTC	2	6	1211316	1211321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_008577	GTAC	2	8	1212300	1212307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_008577	T	6	6	1212329	1212334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008577	GTAA	2	8	1213942	1213949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008577	T	6	6	1213979	1213984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008577	GCGTG	2	10	1214031	1214040	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3073	NC_008577	GTT	2	6	1214089	1214094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008577	GGA	2	6	1214108	1214113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3076	NC_008577	ACG	2	6	1215046	1215051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_008577	AAC	2	6	1215100	1215105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_008577	AGT	2	6	1216484	1216489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008577	GTTAA	2	10	1216566	1216575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_008577	ATT	2	6	1216644	1216649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008577	T	8	8	1216654	1216661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008577	CAAA	2	8	1216713	1216720	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_008577	GGC	2	6	1217605	1217610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_008577	TA	3	6	1217671	1217676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008577	ATT	2	6	1217735	1217740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008577	CT	3	6	1217747	1217752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_008577	TAA	2	6	1217843	1217848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_008577	AAT	2	6	1217916	1217921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_008577	TATT	2	8	1217958	1217965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008577	T	6	6	1217968	1217973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008577	TGTAAT	2	12	1218855	1218866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008577	TGT	2	6	1218912	1218917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008577	GAA	2	6	1220278	1220283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008577	GGC	2	6	1221524	1221529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3099	NC_008577	TAA	2	6	1221566	1221571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008577	A	7	7	1222323	1222329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008577	T	6	6	1222349	1222354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008577	GGC	2	6	1222423	1222428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_008577	TGAG	2	8	1223700	1223707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008577	T	6	6	1224773	1224778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_008577	C	6	6	1225818	1225823	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3106	NC_008577	TAA	2	6	1228294	1228299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_008577	CAAAA	2	10	1229672	1229681	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3108	NC_008577	A	6	6	1229678	1229683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008577	T	6	6	1229702	1229707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008577	CAAT	2	8	1230165	1230172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_008577	T	6	6	1230219	1230224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008577	AAT	2	6	1230290	1230295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008577	CTAA	2	8	1231039	1231046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_008577	ATC	2	6	1232163	1232168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_008577	GTC	2	6	1235305	1235310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3117	NC_008577	A	6	6	1235366	1235371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008577	CTG	2	6	1240132	1240137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_008577	AT	3	6	1240157	1240162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008577	AG	3	6	1240211	1240216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008577	T	7	7	1240268	1240274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008577	T	6	6	1240291	1240296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008577	ATT	2	6	1240302	1240307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3125	NC_008577	TAT	2	6	1240353	1240358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_008577	ATG	2	6	1240456	1240461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008577	TC	3	6	1240466	1240471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_008577	CAGC	2	8	1240507	1240514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_008577	TTTA	2	8	1242456	1242463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008577	ATG	2	6	1245500	1245505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_008577	CTG	2	6	1245662	1245667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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