MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 17877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008554	TTC	2	6	1103281	1103286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_008554	TTC	2	6	1103337	1103342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008554	A	7	7	1103366	1103372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008554	CCG	2	6	1103388	1103393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_008554	G	6	6	1103420	1103425	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008554	A	6	6	1104368	1104373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008554	AAC	2	6	1104436	1104441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_008554	GATT	2	8	1104458	1104465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008554	AGG	2	6	1104976	1104981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008554	AGA	2	6	1104982	1104987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_008554	CGG	2	6	1105506	1105511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_008554	T	7	7	1105527	1105533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008554	GAA	2	6	1105557	1105562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_008554	CGT	2	6	1105628	1105633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_008554	CCT	2	6	1105636	1105641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_008554	T	7	7	1105662	1105668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_008554	A	7	7	1105692	1105698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008554	A	6	6	1105735	1105740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008554	TGT	2	6	1105762	1105767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008554	AAC	2	6	1105781	1105786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008554	GTT	2	6	1105794	1105799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008554	CGGT	2	8	1105853	1105860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_008554	GAG	2	6	1107615	1107620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_008554	GAA	2	6	1107694	1107699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008554	TCG	2	6	1107713	1107718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_008554	AAG	2	6	1107731	1107736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008554	GCT	2	6	1107751	1107756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_008554	GCCG	2	8	1107807	1107814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_008554	CGG	2	6	1107839	1107844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008554	GCA	2	6	1108897	1108902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_008554	CG	3	6	1108961	1108966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_008554	GCTC	2	8	1109043	1109050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_008554	CGG	2	6	1109097	1109102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_008554	CGGG	2	8	1109135	1109142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_008554	GCG	2	6	1109180	1109185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_008554	CCG	2	6	1109217	1109222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_008554	CGG	2	6	1109235	1109240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4040	NC_008554	T	6	6	1111873	1111878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_008554	GGGC	3	12	1111935	1111946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_008554	CCG	2	6	1112025	1112030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_008554	C	6	6	1112092	1112097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4044	NC_008554	TCCA	2	8	1112101	1112108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_008554	TAAT	2	8	1112127	1112134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008554	TAT	2	6	1112177	1112182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_008554	ACGA	2	8	1112264	1112271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_008554	GAGT	2	8	1112282	1112289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_008554	GCC	2	6	1112304	1112309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4052	NC_008554	GTT	2	6	1112469	1112474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_008554	GGGA	2	8	1114099	1114106	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008554	C	6	6	1114115	1114120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4055	NC_008554	GAAAC	2	10	1114155	1114164	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4056	NC_008554	AAT	2	6	1114285	1114290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008554	GTC	2	6	1114314	1114319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008554	GC	3	6	1114330	1114335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_008554	CTG	2	6	1114342	1114347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4061	NC_008554	GTC	2	6	1114393	1114398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_008554	ACG	2	6	1115290	1115295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4064	NC_008554	GC	3	6	1115317	1115322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_008554	GCCC	2	8	1115324	1115331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4066	NC_008554	GCC	2	6	1115341	1115346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_008554	CGC	2	6	1115431	1115436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4069	NC_008554	TG	3	6	1115525	1115530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_008554	GGCGG	2	10	1117595	1117604	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4079	NC_008554	CG	3	6	1117633	1117638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_008554	ATG	2	6	1117699	1117704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4084	NC_008554	CGGCG	2	10	1117890	1117899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4085	NC_008554	GCAA	2	8	1117911	1117918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_008554	GTT	2	6	1117945	1117950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_008554	GCG	2	6	1118005	1118010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_008554	ATT	2	6	1118100	1118105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_008554	GCC	2	6	1119773	1119778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4092	NC_008554	AG	3	6	1119878	1119883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008554	CCT	2	6	1119895	1119900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_008554	CT	3	6	1119908	1119913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_008554	TCTT	2	8	1119915	1119922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4097	NC_008554	GCC	2	6	1121134	1121139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_008554	ATCC	2	8	1121197	1121204	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_008554	CTTCC	2	10	1121228	1121237	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4101	NC_008554	CAA	2	6	1121261	1121266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_008554	GAC	2	6	1121287	1121292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008554	CCG	2	6	1121334	1121339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_008554	CCG	2	6	1121352	1121357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_008554	GAA	2	6	1123461	1123466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008554	GGT	2	6	1123467	1123472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008554	GGC	2	6	1123476	1123481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_008554	GT	3	6	1123483	1123488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_008554	CCG	2	6	1124614	1124619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_008554	CG	3	6	1124618	1124623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_008554	GCG	2	6	1124626	1124631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_008554	TC	3	6	1125805	1125810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_008554	GAA	2	6	1125859	1125864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_008554	ACG	2	6	1126741	1126746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4121	NC_008554	GAAC	2	8	1127653	1127660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_008554	GCAA	2	8	1127675	1127682	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_008554	GATTTG	2	12	1127736	1127747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_008554	GTG	2	6	1127792	1127797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008554	GGCGT	2	10	1127834	1127843	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4127	NC_008554	CGG	2	6	1127856	1127861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_008554	CGG	2	6	1127908	1127913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_008554	GCC	2	6	1127959	1127964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_008554	CCGG	2	8	1127969	1127976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_008554	GCCG	2	8	1127992	1127999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_008554	GAT	2	6	1128775	1128780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_008554	CGCC	2	8	1128805	1128812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4134	NC_008554	GGA	2	6	1128817	1128822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008554	AAG	2	6	1129699	1129704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_008554	TCC	2	6	1130204	1130209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4137	NC_008554	CCCG	2	8	1130229	1130236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4138	NC_008554	CGC	2	6	1130248	1130253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_008554	TCC	2	6	1130289	1130294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4140	NC_008554	TCA	2	6	1131190	1131195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_008554	CGTC	2	8	1131219	1131226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4142	NC_008554	GGC	2	6	1131282	1131287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_008554	AGC	2	6	1131344	1131349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4145	NC_008554	CGGAC	2	10	1131414	1131423	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4146	NC_008554	CCT	2	6	1131433	1131438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4147	NC_008554	GGA	2	6	1131446	1131451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_008554	CGG	2	6	1131596	1131601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4150	NC_008554	GCG	2	6	1131677	1131682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_008554	CG	4	8	1131706	1131713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4152	NC_008554	GAGC	2	8	1131780	1131787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4153	NC_008554	GC	3	6	1132639	1132644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4154	NC_008554	GCC	2	6	1132652	1132657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4155	NC_008554	GCC	2	6	1132744	1132749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4156	NC_008554	CCA	2	6	1132796	1132801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4157	NC_008554	CGG	2	6	1133908	1133913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4160	NC_008554	GCCC	2	8	1134044	1134051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4162	NC_008554	CCGC	2	8	1134090	1134097	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4163	NC_008554	CCG	2	6	1134106	1134111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4164	NC_008554	A	7	7	1134148	1134154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_008554	CCG	2	6	1134170	1134175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4166	NC_008554	TCG	2	6	1134186	1134191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4168	NC_008554	TCCA	2	8	1134202	1134209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4169	NC_008554	GCC	2	6	1134265	1134270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4172	NC_008554	TGA	2	6	1134409	1134414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4176	NC_008554	CGTG	2	8	1134663	1134670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4195	NC_008554	GCCG	2	8	1136037	1136044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4196	NC_008554	TAT	2	6	1136086	1136091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4203	NC_008554	TGG	2	6	1136895	1136900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_008554	CG	3	6	1152031	1152036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_008554	GTT	2	6	1152048	1152053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_008554	TCC	2	6	1182217	1182222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4399	NC_008554	GTT	2	6	1182228	1182233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_008554	CGA	2	6	1182269	1182274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4401	NC_008554	CGG	2	6	1182275	1182280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_008554	GCC	2	6	1182283	1182288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4403	NC_008554	C	6	6	1182315	1182320	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4404	NC_008554	GAC	2	6	1182321	1182326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4432	NC_008554	TCT	2	6	1193955	1193960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4500	NC_008554	CAGGA	2	10	1216921	1216930	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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