MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 17877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008554	CGGG	2	8	129081	129088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
502	NC_008554	CGG	2	6	129098	129103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008554	TCT	2	6	129189	129194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008554	GTCC	2	8	129271	129278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008554	G	6	6	129303	129308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008554	CCA	2	6	131122	131127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_008554	GTG	2	6	131177	131182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008554	TCC	2	6	132929	132934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_008554	CCGAG	2	10	132940	132949	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
510	NC_008554	GCCC	2	8	133683	133690	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
511	NC_008554	TGC	2	6	133753	133758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008554	A	7	7	133806	133812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008554	CGG	2	6	133822	133827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_008554	CGG	2	6	133865	133870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008554	TTTC	2	8	135256	135263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_008554	GGC	2	6	135282	135287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008554	TCG	2	6	137847	137852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008554	CG	3	6	137871	137876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_008554	GGT	2	6	137888	137893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008554	ATG	2	6	137911	137916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008554	CGGG	2	8	137947	137954	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
522	NC_008554	GGGC	2	8	138006	138013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
523	NC_008554	GCCC	2	8	138019	138026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
524	NC_008554	ATG	2	6	138071	138076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008554	CGC	2	6	138079	138084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_008554	TCG	2	6	138136	138141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008554	CAC	2	6	138173	138178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_008554	CGT	2	6	139100	139105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008554	CG	3	6	140407	140412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_008554	A	7	7	140443	140449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008554	GAA	2	6	140491	140496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008554	CAAA	2	8	140499	140506	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_008554	GGCG	2	8	140578	140585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
534	NC_008554	GAG	2	6	140616	140621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008554	GGA	2	6	140642	140647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008554	G	6	6	140655	140660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008554	CGTC	2	8	140666	140673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
538	NC_008554	GAAA	2	8	140722	140729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008554	AAT	2	6	141105	141110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008554	T	6	6	141169	141174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008554	GCT	2	6	141278	141283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008554	CCGG	2	8	141293	141300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_008554	ACC	2	6	141307	141312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_008554	A	6	6	141335	141340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008554	GA	3	6	143161	143166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008554	TGA	2	6	143172	143177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008554	TTAGG	2	10	143205	143214	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008554	CACT	2	8	146194	146201	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_008554	TAA	2	6	146214	146219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008554	TTC	2	6	146233	146238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_008554	GGA	2	6	146631	146636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008554	GCC	2	6	148284	148289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_008554	GCGCG	2	10	148304	148313	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
554	NC_008554	T	6	6	148360	148365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008554	TTTTC	2	10	148367	148376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
556	NC_008554	GCCGT	2	10	148432	148441	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
557	NC_008554	GTG	2	6	148462	148467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008554	GCG	2	6	148500	148505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008554	CCGG	2	8	148590	148597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_008554	G	6	6	148628	148633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008554	ACA	2	6	151493	151498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008554	CGGG	2	8	151521	151528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
563	NC_008554	CGC	2	6	151535	151540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_008554	CGG	2	6	151554	151559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_008554	CACG	2	8	151580	151587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_008554	GCG	2	6	152091	152096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008554	GGAA	2	8	152123	152130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008554	GCG	2	6	152131	152136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008554	ACG	2	6	153061	153066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_008554	TGT	2	6	153096	153101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008554	ATT	2	6	155568	155573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008554	GTT	2	6	155585	155590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008554	ATT	2	6	155602	155607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008554	ATA	2	6	155610	155615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008554	CTA	2	6	155619	155624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008554	GAA	2	6	155647	155652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008554	A	8	8	155656	155663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008554	TCC	2	6	156207	156212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_008554	A	6	6	156217	156222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008554	ATT	2	6	156240	156245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008554	TGAA	2	8	156262	156269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008554	C	6	6	156275	156280	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
583	NC_008554	A	6	6	156380	156385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008554	GAT	2	6	156423	156428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008554	AAG	2	6	156432	156437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008554	TCG	2	6	156442	156447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008554	CAT	2	6	156541	156546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008554	GGA	2	6	156575	156580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008554	CCCG	2	8	156628	156635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
590	NC_008554	TG	3	6	156662	156667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008554	GGA	2	6	156701	156706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008554	G	6	6	156714	156719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008554	CTG	2	6	156722	156727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008554	GCC	2	6	158220	158225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_008554	CGGG	2	8	159474	159481	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
596	NC_008554	CAA	2	6	161542	161547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008554	GC	3	6	161606	161611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_008554	TCCTG	2	10	161851	161860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
599	NC_008554	GAA	2	6	161876	161881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008554	CGGT	2	8	161937	161944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_008554	TCC	2	6	163811	163816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_008554	CTT	3	9	163830	163838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008554	GTT	2	6	163855	163860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008554	GCC	2	6	163995	164000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_008554	GAC	2	6	164018	164023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008554	CTTT	2	8	164030	164037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_008554	CAGG	2	8	164074	164081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
608	NC_008554	T	6	6	164171	164176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008554	ACC	2	6	164214	164219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_008554	GAC	2	6	164251	164256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008554	GTT	2	6	164286	164291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008554	GTT	2	6	164306	164311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008554	TTAT	2	8	164477	164484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008554	ACG	2	6	164534	164539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_008554	G	6	6	164658	164663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008554	TGT	2	6	164750	164755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008554	TG	3	6	164863	164868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008554	CGC	2	6	164890	164895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_008554	GAG	2	6	164927	164932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008554	CAT	2	6	165436	165441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008554	GACGGA	2	12	165446	165457	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
622	NC_008554	GGT	2	6	165464	165469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008554	GGA	2	6	166816	166821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008554	CGAT	2	8	166838	166845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_008554	GCA	3	9	166851	166859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008554	GCC	2	6	166864	166869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_008554	GCCG	2	8	166885	166892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_008554	AG	3	6	166933	166938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008554	GTCAA	2	10	166994	167003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
630	NC_008554	C	6	6	168197	168202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
631	NC_008554	GCTGC	2	10	170358	170367	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
632	NC_008554	CGT	2	6	170368	170373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008554	AGG	2	6	170401	170406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008554	CGC	3	9	170427	170435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_008554	GCTCC	2	10	170476	170485	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
636	NC_008554	AGTC	2	8	170528	170535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_008554	G	8	8	170547	170554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008554	AATTC	2	10	170559	170568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
639	NC_008554	TAA	2	6	171021	171026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008554	TA	3	6	171030	171035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008554	TAA	2	6	171148	171153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008554	CCG	2	6	172887	172892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_008554	CGA	2	6	172897	172902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_008554	CGC	2	6	177051	177056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
648	NC_008554	CCT	2	6	177107	177112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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650	NC_008554	TCC	2	6	177159	177164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_008554	GGCC	2	8	177166	177173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
652	NC_008554	CCGGC	2	10	177196	177205	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
653	NC_008554	CGG	2	6	178400	178405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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656	NC_008554	GAG	2	6	179537	179542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
657	NC_008554	GCCC	3	12	179565	179576	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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659	NC_008554	CG	3	6	179711	179716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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664	NC_008554	CTTT	2	8	189032	189039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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673	NC_008554	GACG	2	8	194850	194857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
674	NC_008554	CCG	2	6	197950	197955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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690	NC_008554	GCG	2	6	203330	203335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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776	NC_008554	A	6	6	222514	222519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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