MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 17877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008554	TCA	2	6	1318381	1318386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_008554	ATA	2	6	1318391	1318396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_008554	CAG	2	6	1318410	1318415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_008554	TAA	3	9	1318416	1318424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008554	AT	3	6	1318441	1318446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008554	GAA	2	6	1318489	1318494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008554	GGA	2	6	1319609	1319614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008554	CCAAT	2	10	1320081	1320090	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5009	NC_008554	GCC	2	6	1320117	1320122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_008554	GAT	2	6	1320139	1320144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008554	CGC	2	6	1320147	1320152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_008554	CAC	2	6	1320155	1320160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_008554	CGC	2	6	1321759	1321764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_008554	GCG	2	6	1321849	1321854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_008554	AAAT	2	8	1321875	1321882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008554	CCG	2	6	1321970	1321975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_008554	GGGGGA	2	12	1322018	1322029	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008554	CCA	2	6	1322095	1322100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_008554	CTGCC	2	10	1322133	1322142	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5020	NC_008554	GCT	2	6	1322149	1322154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_008554	ACC	3	9	1322215	1322223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_008554	GCCG	2	8	1323542	1323549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_008554	TC	3	6	1323551	1323556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_008554	CCA	2	6	1326822	1326827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_008554	ATT	2	6	1331545	1331550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008554	CT	3	6	1331578	1331583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_008554	ATA	2	6	1331676	1331681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008554	ATG	2	6	1331727	1331732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008554	CAGGC	2	10	1331808	1331817	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5030	NC_008554	CGATG	2	10	1331828	1331837	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5031	NC_008554	GCA	2	6	1331870	1331875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_008554	CGA	2	6	1331911	1331916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_008554	GGC	2	6	1332010	1332015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_008554	GAG	2	6	1332020	1332025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_008554	GCCG	2	8	1332995	1333002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_008554	GCAAC	2	10	1333010	1333019	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5037	NC_008554	CAC	2	6	1333108	1333113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_008554	A	6	6	1333143	1333148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008554	GTTT	2	8	1333184	1333191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_008554	A	6	6	1333264	1333269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008554	GTT	2	6	1333433	1333438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008554	ATC	2	6	1333488	1333493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_008554	CGG	2	6	1340383	1340388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_008554	CGT	2	6	1341880	1341885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_008554	GCT	2	6	1341886	1341891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008554	TCC	2	6	1342577	1342582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_008554	CGG	2	6	1342697	1342702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_008554	GCT	2	6	1342838	1342843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_008554	GCG	2	6	1342849	1342854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_008554	GCG	2	6	1342879	1342884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008554	CCG	2	6	1342937	1342942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_008554	ACG	2	6	1342959	1342964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_008554	CGG	2	6	1342970	1342975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008554	CGC	2	6	1343012	1343017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_008554	CCA	2	6	1344906	1344911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_008554	GAA	2	6	1344936	1344941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_008554	GCC	2	6	1344944	1344949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_008554	CCCGG	2	10	1345007	1345016	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5059	NC_008554	CCGG	2	8	1345045	1345052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_008554	TCT	2	6	1345207	1345212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_008554	ACA	2	6	1345254	1345259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_008554	A	6	6	1345336	1345341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_008554	GCTT	2	8	1345501	1345508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_008554	CAATG	2	10	1345521	1345530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5065	NC_008554	ACGA	2	8	1345531	1345538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_008554	TAT	2	6	1345578	1345583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008554	AT	4	8	1345582	1345589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_008554	ACA	2	6	1352650	1352655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_008554	CCCG	2	8	1352656	1352663	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5070	NC_008554	CGGG	2	8	1352726	1352733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_008554	TCC	2	6	1352776	1352781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_008554	T	6	6	1353993	1353998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008554	TG	3	6	1354047	1354052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_008554	GCC	3	9	1354095	1354103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_008554	GGC	3	9	1354120	1354128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_008554	GACAT	2	10	1354175	1354184	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_008554	GGCGTT	2	12	1354258	1354269	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5078	NC_008554	CCG	2	6	1354275	1354280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_008554	TTCCG	2	10	1354295	1354304	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5080	NC_008554	GAT	2	6	1354367	1354372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_008554	ACGG	2	8	1354411	1354418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_008554	AGGC	2	8	1354442	1354449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_008554	C	6	6	1354449	1354454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5084	NC_008554	CTC	2	6	1354489	1354494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_008554	GC	4	8	1354518	1354525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_008554	GGC	2	6	1365191	1365196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_008554	CGGG	2	8	1365205	1365212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_008554	CGGG	2	8	1365275	1365282	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_008554	GGT	2	6	1365302	1365307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_008554	GCC	2	6	1365892	1365897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_008554	CCCG	2	8	1365935	1365942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5092	NC_008554	TG	3	6	1365958	1365963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008554	TCC	2	6	1366504	1366509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_008554	CGA	2	6	1366524	1366529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008554	CGCC	2	8	1366530	1366537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5096	NC_008554	TCC	2	6	1366547	1366552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_008554	GCCG	2	8	1366675	1366682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_008554	G	6	6	1366712	1366717	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008554	GCC	2	6	1366749	1366754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_008554	CGAT	2	8	1366808	1366815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_008554	CAG	2	6	1366887	1366892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_008554	GAG	2	6	1366911	1366916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008554	CGG	2	6	1368821	1368826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_008554	TCCT	2	8	1369722	1369729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_008554	CGC	2	6	1369756	1369761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_008554	CGT	2	6	1369766	1369771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_008554	CG	3	6	1369822	1369827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_008554	GCG	2	6	1369872	1369877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_008554	GCC	2	6	1369977	1369982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_008554	GCG	2	6	1369992	1369997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_008554	CGC	2	6	1370074	1370079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_008554	ACG	2	6	1370096	1370101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_008554	A	6	6	1370109	1370114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008554	GGT	2	6	1370139	1370144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008554	TGA	2	6	1370153	1370158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008554	GAG	2	6	1370166	1370171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008554	TTC	2	6	1370178	1370183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_008554	A	9	9	1370217	1370225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008554	CAGG	2	8	1370318	1370325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_008554	CGC	2	6	1370351	1370356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_008554	CGG	2	6	1370382	1370387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_008554	GCG	2	6	1370406	1370411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_008554	AGCG	2	8	1370500	1370507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_008554	TGT	2	6	1370508	1370513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_008554	GGA	2	6	1370562	1370567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_008554	TCA	2	6	1370705	1370710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_008554	TTC	2	6	1370852	1370857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_008554	TTGCGT	2	12	1370876	1370887	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5129	NC_008554	GGCCG	2	10	1370915	1370924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5131	NC_008554	ATT	2	6	1372715	1372720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5244	NC_008554	CCTG	2	8	1404001	1404008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5263	NC_008554	GCC	2	6	1407440	1407445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_008554	TCC	2	6	1407454	1407459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5265	NC_008554	GCC	2	6	1407502	1407507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5266	NC_008554	AGC	2	6	1407659	1407664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5267	NC_008554	GCAA	2	8	1407691	1407698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5268	NC_008554	CG	3	6	1410414	1410419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5269	NC_008554	TCAA	2	8	1410447	1410454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5270	NC_008554	GTCT	2	8	1410510	1410517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5271	NC_008554	CACG	2	8	1410558	1410565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5280	NC_008554	ATGC	2	8	1412945	1412952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5284	NC_008554	CGG	2	6	1413209	1413214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5289	NC_008554	AGCCC	2	10	1414887	1414896	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5290	NC_008554	ACC	2	6	1414926	1414931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5294	NC_008554	TCT	2	6	1416002	1416007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5296	NC_008554	GA	3	6	1417617	1417622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5298	NC_008554	CCGTC	2	10	1418390	1418399	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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5311	NC_008554	GATAG	2	10	1421337	1421346	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5333	NC_008554	TGTCG	2	10	1430179	1430188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5380	NC_008554	CGG	2	6	1439306	1439311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_008554	ATG	2	6	1441681	1441686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_008554	CTTC	2	8	1441702	1441709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5393	NC_008554	GACT	2	8	1441734	1441741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5394	NC_008554	C	6	6	1441849	1441854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5500	NC_008554	CGCTC	2	10	1471362	1471371	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

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