MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 17877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008554	CTCCG	2	10	1216944	1216953	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4502	NC_008554	TTTCAC	2	12	1216974	1216985	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_008554	GCT	2	6	1217065	1217070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_008554	CAA	2	6	1217115	1217120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_008554	TGCGCG	2	12	1217958	1217969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_008554	CGC	3	9	1217995	1218003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_008554	CG	3	6	1218049	1218054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_008554	CG	3	6	1219166	1219171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_008554	TGGCA	2	10	1220410	1220419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4510	NC_008554	GTC	3	9	1220425	1220433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_008554	TTC	2	6	1220463	1220468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_008554	CCCG	2	8	1220472	1220479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4513	NC_008554	TCC	2	6	1221304	1221309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_008554	CCA	2	6	1221352	1221357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_008554	CATG	2	8	1221392	1221399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_008554	TCC	2	6	1221407	1221412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_008554	TCCCG	2	10	1221453	1221462	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4518	NC_008554	GCG	2	6	1221475	1221480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_008554	CTT	2	6	1222167	1222172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_008554	TCGT	2	8	1222175	1222182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_008554	CCG	2	6	1222781	1222786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_008554	GAC	2	6	1222804	1222809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_008554	CTC	2	6	1224787	1224792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_008554	GGGC	2	8	1224807	1224814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4525	NC_008554	AT	3	6	1224896	1224901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_008554	TCC	2	6	1224932	1224937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_008554	CGA	2	6	1225058	1225063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008554	CAG	2	6	1225092	1225097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_008554	AGC	2	6	1225123	1225128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008554	GTT	2	6	1225167	1225172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008554	GAA	2	6	1225176	1225181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_008554	C	6	6	1225189	1225194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4533	NC_008554	CAG	2	6	1225242	1225247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008554	GAA	2	6	1225248	1225253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_008554	TCG	2	6	1225381	1225386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_008554	GCA	2	6	1225508	1225513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_008554	GCC	2	6	1225553	1225558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_008554	TCC	2	6	1225600	1225605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_008554	CTTTT	2	10	1225608	1225617	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4540	NC_008554	GCC	2	6	1225636	1225641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_008554	AGT	2	6	1225685	1225690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_008554	C	6	6	1225773	1225778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4543	NC_008554	TC	3	6	1225793	1225798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_008554	C	8	8	1225964	1225971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4545	NC_008554	CTT	2	6	1226157	1226162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008554	ATG	2	6	1226209	1226214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_008554	ACCG	2	8	1226259	1226266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_008554	CCG	2	6	1226275	1226280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_008554	TCT	2	6	1226321	1226326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_008554	GAT	2	6	1226400	1226405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_008554	TC	3	6	1226406	1226411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_008554	GAA	2	6	1226487	1226492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_008554	TTC	2	6	1226565	1226570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_008554	GAG	2	6	1226586	1226591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008554	CAC	2	6	1226592	1226597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_008554	CGGG	2	8	1226618	1226625	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_008554	A	6	6	1226653	1226658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008554	TCGATG	2	12	1226674	1226685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4559	NC_008554	TGGCGA	2	12	1226750	1226761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4560	NC_008554	TCG	2	6	1226782	1226787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_008554	TCC	2	6	1226901	1226906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_008554	GGA	2	6	1226980	1226985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_008554	GAA	2	6	1227072	1227077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_008554	CCT	2	6	1227089	1227094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_008554	GGGA	2	8	1227275	1227282	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_008554	G	6	6	1227342	1227347	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_008554	TCT	2	6	1227350	1227355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_008554	C	6	6	1227366	1227371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4569	NC_008554	TCG	2	6	1227406	1227411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_008554	TTC	2	6	1227450	1227455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_008554	CCA	2	6	1227509	1227514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_008554	CCT	2	6	1227554	1227559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_008554	TGA	2	6	1227572	1227577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_008554	GCA	2	6	1227623	1227628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_008554	CCAG	2	8	1227695	1227702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_008554	AGCG	2	8	1227783	1227790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_008554	TCATC	2	10	1227848	1227857	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4578	NC_008554	CG	3	6	1227900	1227905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_008554	TGG	2	6	1227982	1227987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_008554	TCT	2	6	1228019	1228024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_008554	ACGA	2	8	1228072	1228079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4582	NC_008554	GATTCT	2	12	1228149	1228160	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4583	NC_008554	GTT	2	6	1228161	1228166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_008554	ACGA	2	8	1228179	1228186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4585	NC_008554	GCC	2	6	1228275	1228280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_008554	TCGAA	2	10	1228406	1228415	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4587	NC_008554	CG	3	6	1228448	1228453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_008554	CGG	2	6	1228505	1228510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_008554	AAAC	2	8	1230010	1230017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_008554	GAT	2	6	1230025	1230030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_008554	CG	3	6	1230044	1230049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_008554	CAT	2	6	1230083	1230088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_008554	CGC	2	6	1230319	1230324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_008554	GGC	2	6	1230337	1230342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_008554	T	7	7	1233228	1233234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_008554	CGGA	2	8	1235852	1235859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_008554	GGA	2	6	1235886	1235891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_008554	AGG	2	6	1237071	1237076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_008554	ATC	2	6	1238832	1238837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_008554	TCA	2	6	1238875	1238880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_008554	TCC	2	6	1238938	1238943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_008554	CAG	2	6	1238970	1238975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_008554	CTTT	2	8	1239001	1239008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_008554	TGACGT	2	12	1239092	1239103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4605	NC_008554	TCTG	2	8	1239170	1239177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_008554	GGT	2	6	1239182	1239187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_008554	CCGC	2	8	1239211	1239218	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4608	NC_008554	CTC	2	6	1239252	1239257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_008554	CT	3	6	1239375	1239380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_008554	CTC	2	6	1239387	1239392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_008554	CGAA	2	8	1239434	1239441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_008554	GAA	2	6	1239486	1239491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_008554	CGC	2	6	1239555	1239560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_008554	GAT	2	6	1239921	1239926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_008554	TGG	2	6	1239965	1239970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_008554	TCG	2	6	1239985	1239990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_008554	TTC	2	6	1240110	1240115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_008554	TCC	2	6	1240122	1240127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_008554	ATG	3	9	1240237	1240245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_008554	TCGC	2	8	1240293	1240300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_008554	TCC	2	6	1240337	1240342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_008554	ACC	2	6	1240363	1240368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_008554	CGA	2	6	1240373	1240378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_008554	CGC	2	6	1240497	1240502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_008554	CGC	2	6	1240514	1240519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_008554	ACC	2	6	1240537	1240542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_008554	CCG	3	9	1240559	1240567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_008554	TCGC	2	8	1240582	1240589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_008554	GCTC	2	8	1240631	1240638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_008554	ACC	2	6	1240645	1240650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_008554	TCC	2	6	1240651	1240656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_008554	GCCCCG	2	12	1240774	1240785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4672	NC_008554	A	6	6	1246067	1246072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4748	NC_008554	TAT	2	6	1268841	1268846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_008554	AT	3	6	1268853	1268858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4750	NC_008554	TAT	2	6	1268869	1268874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4757	NC_008554	ATA	2	6	1269308	1269313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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