MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 1202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008532	TAAG	2	8	9895	9902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008532	TTCT	2	8	17299	17306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008532	GCTC	2	8	17956	17963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008532	CAGT	2	8	18766	18773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008532	ATTT	2	8	19344	19351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008532	GTGA	2	8	19554	19561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008532	AGCG	2	8	19725	19732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008532	TGGT	2	8	20390	20397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008532	AGCC	2	8	20606	20613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008532	GTAA	2	8	20881	20888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008532	ATAG	2	8	20895	20902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008532	GCGA	2	8	21209	21216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008532	ATTC	2	8	22074	22081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008532	CTAA	2	8	22428	22435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008532	CTGA	2	8	22701	22708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008532	TAGG	2	8	23083	23090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008532	GCGT	2	8	25067	25074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008532	ATTT	2	8	28549	28556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008532	GTTT	2	8	34313	34320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008532	GAGT	2	8	38867	38874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008532	TGAA	2	8	42091	42098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008532	AGAA	2	8	42117	42124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008532	CTTT	2	8	43741	43748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008532	AATC	2	8	44475	44482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008532	ACCT	2	8	45939	45946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008532	GCGA	2	8	47523	47530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008532	AGTT	2	8	47710	47717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008532	AAAC	2	8	49576	49583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008532	AATA	2	8	50710	50717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008532	AGGA	2	8	52284	52291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008532	ATGA	2	8	52380	52387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008532	AGTC	2	8	59118	59125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008532	AAAG	2	8	62103	62110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008532	TTGA	2	8	63285	63292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008532	AAAC	2	8	63320	63327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008532	AGAA	2	8	64659	64666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008532	ATTT	2	8	67006	67013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008532	GTGA	2	8	67216	67223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008532	AGCG	2	8	67387	67394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008532	TGGT	2	8	68052	68059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008532	AGCC	2	8	68268	68275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008532	GTAA	2	8	68543	68550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008532	ATAG	2	8	68557	68564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008532	GCGA	2	8	68871	68878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008532	ATTC	2	8	69736	69743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008532	CTAA	2	8	70090	70097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008532	CTGA	2	8	70363	70370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008532	TAGG	2	8	70745	70752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008532	GCGT	2	8	72132	72139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008532	ATTT	2	8	72321	72328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008532	TCCC	2	8	72403	72410	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_008532	AGTC	2	8	77230	77237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008532	TTTG	2	8	77249	77256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008532	AATT	2	8	79150	79157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008532	GTTG	2	8	79219	79226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008532	GATT	2	8	79265	79272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008532	TTAT	2	8	80990	80997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008532	TTGC	2	8	81125	81132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008532	TTAT	2	8	81474	81481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008532	TGCT	2	8	81516	81523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008532	TTGA	2	8	82253	82260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008532	TGGG	2	8	82894	82901	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008532	AAAT	2	8	83818	83825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008532	AATC	2	8	84918	84925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008532	TAGG	2	8	88849	88856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008532	TGGT	2	8	88935	88942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008532	TGTT	2	8	88956	88963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008532	CTTG	2	8	89020	89027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008532	CAGA	2	8	89951	89958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008532	ATGA	2	8	93217	93224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008532	GAAA	2	8	96983	96990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008532	AATT	2	8	97341	97348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008532	TTTA	2	8	103131	103138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008532	TTTA	2	8	103144	103151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008532	TAGC	2	8	103152	103159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008532	GGTA	2	8	104248	104255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008532	ATTC	2	8	105598	105605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008532	ACAT	2	8	105882	105889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008532	GAAT	2	8	106179	106186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008532	AAAT	2	8	106205	106212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008532	ATTG	2	8	106372	106379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008532	CTAG	2	8	108666	108673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008532	TGAT	2	8	108726	108733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008532	TCAT	2	8	109347	109354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008532	TATT	2	8	109803	109810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008532	TCAA	2	8	111618	111625	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008532	TCGA	2	8	114533	114540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008532	AATT	2	8	114738	114745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008532	TCAA	2	8	120582	120589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008532	ATTT	2	8	120670	120677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008532	GTTT	2	8	120734	120741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008532	TGAT	2	8	120850	120857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008532	ATTT	2	8	122762	122769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008532	ATTA	2	8	124037	124044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008532	TAAT	2	8	126719	126726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008532	TAAA	2	8	126955	126962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008532	TCAA	2	8	127172	127179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008532	GCTA	2	8	131038	131045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008532	AGAA	2	8	135152	135159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008532	AGAA	2	8	137070	137077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008532	AGAT	2	8	137346	137353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008532	AAGA	2	8	140310	140317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008532	TATT	2	8	140395	140402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008532	TTGG	2	8	140582	140589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008532	TCAA	2	8	140616	140623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008532	ATTT	2	8	141215	141222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008532	GTGA	2	8	141425	141432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008532	AGCG	2	8	141596	141603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008532	TGGT	2	8	142261	142268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008532	AGCC	2	8	142477	142484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008532	GTAA	2	8	142752	142759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008532	ATAG	2	8	142766	142773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008532	GCGA	2	8	143080	143087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008532	ATTC	2	8	143945	143952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008532	CTAA	2	8	144299	144306	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008532	CTGA	2	8	144572	144579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008532	TAGG	2	8	144954	144961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008532	ATTT	2	8	147021	147028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008532	GTGA	2	8	147231	147238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008532	AGCG	2	8	147402	147409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008532	TGGT	2	8	148067	148074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008532	AGCC	2	8	148283	148290	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008532	GTAA	2	8	148558	148565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008532	ATAG	2	8	148572	148579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008532	GCGA	2	8	148886	148893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008532	ATTC	2	8	149751	149758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008532	CTAA	2	8	150105	150112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008532	CTGA	2	8	150378	150385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008532	TAGG	2	8	150760	150767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008532	TATG	2	8	151958	151965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008532	GAAA	2	8	152446	152453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008532	TCAC	2	8	152577	152584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008532	CTTT	2	8	152700	152707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008532	CAAG	2	8	154155	154162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008532	GTGA	2	8	154205	154212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008532	ATTG	2	8	154961	154968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008532	GTGG	2	8	155365	155372	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008532	TTAT	2	8	155412	155419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008532	GTTT	2	8	156031	156038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008532	AATC	2	8	159314	159321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008532	AAGA	2	8	161041	161048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008532	TCTA	2	8	166910	166917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008532	TGTT	2	8	166925	166932	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008532	TTAC	2	8	167011	167018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008532	GAAG	2	8	167054	167061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008532	TAGA	2	8	169845	169852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008532	AAAG	2	8	170046	170053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008532	CAAG	2	8	170881	170888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008532	AACT	2	8	170939	170946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008532	TCAA	2	8	171171	171178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008532	AGCT	2	8	171491	171498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008532	AATA	2	8	171902	171909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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