MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 9467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008532	T	6	6	244179	244184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008532	ATA	2	6	247422	247427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008532	CAT	2	6	247479	247484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008532	GAT	2	6	249640	249645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008532	TGT	2	6	249679	249684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008532	GCT	2	6	249720	249725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_008532	AGG	2	6	249884	249889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008532	TATC	2	8	249910	249917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_008532	CTA	2	6	250034	250039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_008532	GTTAC	2	10	250144	250153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_008532	T	6	6	250188	250193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008532	AGG	2	6	250221	250226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008532	TTAA	2	8	252219	252226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_008532	ACT	2	6	252240	252245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008532	A	7	7	252271	252277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008532	GTA	2	6	252835	252840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008532	T	6	6	252892	252897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008532	ATA	2	6	252909	252914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008532	T	6	6	252961	252966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008532	T	6	6	254659	254664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008532	T	6	6	254688	254693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008532	CAT	2	6	254722	254727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_008532	CCT	2	6	255017	255022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_008532	TTCT	2	8	255031	255038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_008532	GAT	2	6	255856	255861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008532	GAA	2	6	255915	255920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008532	AATT	2	8	256448	256455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008532	A	8	8	257169	257176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008532	T	7	7	257193	257199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008532	T	6	6	257210	257215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008532	TTG	2	6	257227	257232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008532	ATAG	2	8	257253	257260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008532	TCTT	2	8	257312	257319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_008532	ATTT	2	8	257350	257357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008532	GTCT	2	8	257359	257366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_008532	ACTT	2	8	257380	257387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_008532	T	7	7	257386	257392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008532	AGA	2	6	257802	257807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008532	T	6	6	257834	257839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008532	GTT	2	6	257850	257855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008532	T	6	6	257868	257873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008532	T	7	7	258331	258337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008532	ATT	2	6	258351	258356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008532	TAT	2	6	258380	258385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008532	ATT	2	6	258401	258406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008532	TAA	2	6	258440	258445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_008532	A	6	6	258458	258463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_008532	A	6	6	259730	259735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008532	AGG	2	6	259746	259751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008532	TA	3	6	260311	260316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008532	ATA	2	6	260320	260325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008532	TA	3	6	260337	260342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008532	T	6	6	260352	260357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008532	AAG	2	6	260395	260400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008532	T	7	7	260438	260444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008532	TTGT	2	8	260470	260477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008532	TATAA	2	10	260497	260506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008532	TGG	2	6	260784	260789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008532	ATGTA	2	10	260821	260830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008532	AGG	2	6	260839	260844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008532	TTG	2	6	265625	265630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008532	T	6	6	266694	266699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008532	AAT	2	6	269512	269517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008532	ATC	2	6	269549	269554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_008532	CAGC	2	8	269560	269567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_008532	A	6	6	269586	269591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008532	TGA	2	6	269594	269599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008532	T	7	7	269615	269621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008532	CTA	2	6	269622	269627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_008532	AATG	2	8	269710	269717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008532	GTC	2	6	269729	269734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_008532	T	6	6	269764	269769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008532	TGT	2	6	270306	270311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008532	CAA	2	6	270342	270347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_008532	T	7	7	270385	270391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008532	CGG	2	6	270436	270441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_008532	TGA	2	6	270473	270478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008532	TGGA	2	8	270508	270515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008532	AGA	2	6	270516	270521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008532	T	7	7	270541	270547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008532	CTT	2	6	270571	270576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_008532	GGA	2	6	270594	270599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008532	T	7	7	270601	270607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008532	TTG	2	6	271848	271853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_008532	ATT	2	6	271881	271886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_008532	TTA	2	6	271890	271895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008532	A	6	6	271934	271939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008532	TA	3	6	271948	271953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_008532	AT	3	6	271958	271963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008532	ATA	2	6	271976	271981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008532	TGG	2	6	272916	272921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008532	T	8	8	272939	272946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008532	ATAA	2	8	272972	272979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008532	ACT	2	6	273032	273037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_008532	TAA	2	6	273072	273077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008532	CAT	2	6	273083	273088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_008532	AT	3	6	273101	273106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_008532	GTT	2	6	273114	273119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_008532	TTGGT	2	10	273235	273244	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008532	TAT	2	6	273332	273337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008532	TGG	2	6	273353	273358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_008532	ATT	2	6	273367	273372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008532	ATT	2	6	273377	273382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008532	T	6	6	273489	273494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008532	TCT	2	6	273539	273544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_008532	TCG	2	6	273566	273571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008532	ATT	2	6	273627	273632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008532	TTA	2	6	273638	273643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008532	TAT	2	6	273653	273658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008532	AAG	2	6	273676	273681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_008532	TCT	2	6	273689	273694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_008532	TC	3	6	273705	273710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_008532	CAA	2	6	273734	273739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008532	T	6	6	273748	273753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008532	TCT	2	6	273763	273768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_008532	TCCT	2	8	273804	273811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_008532	CTTT	2	8	273827	273834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_008532	TTC	2	6	273845	273850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_008532	CGT	2	6	273857	273862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_008532	TAT	2	6	273901	273906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008532	CAA	2	6	273921	273926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_008532	T	7	7	273998	274004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008532	ATT	2	6	274040	274045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008532	TAT	2	6	274117	274122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008532	TGA	2	6	274123	274128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008532	AG	3	6	274168	274173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_008532	ACT	2	6	274206	274211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008532	GAA	2	6	274213	274218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008532	AGTT	2	8	274275	274282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008532	TATGG	2	10	274299	274308	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_008532	CTG	2	6	274338	274343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_008532	ATT	2	6	274374	274379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_008532	TAAT	2	8	274392	274399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_008532	TATC	2	8	274402	274409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_008532	AAT	2	6	274442	274447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_008532	AAG	2	6	274455	274460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_008532	GAA	2	6	274478	274483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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