MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 9467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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503	NC_008532	T	6	6	82425	82430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008532	ACT	2	6	82525	82530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_008532	ATT	2	6	82559	82564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008532	TCG	2	6	82615	82620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008532	AC	3	6	82657	82662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_008532	TAA	2	6	82696	82701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008532	AAT	2	6	82708	82713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008532	T	6	6	82782	82787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008532	TAT	2	6	82842	82847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008532	CAA	2	6	82849	82854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_008532	TGGG	2	8	82894	82901	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008532	GAG	2	6	82923	82928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008532	T	6	6	82936	82941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008532	GGGGC	2	10	83784	83793	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
517	NC_008532	CAGCC	2	10	83795	83804	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
518	NC_008532	AAAT	2	8	83818	83825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008532	AAAAG	2	10	84898	84907	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008532	AATC	2	8	84918	84925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_008532	CTT	2	6	84930	84935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008532	T	6	6	84934	84939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008532	GTG	2	6	85522	85527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008532	A	7	7	85544	85550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008532	CTA	2	6	85560	85565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008532	TAA	2	6	85662	85667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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533	NC_008532	TGGT	2	8	88935	88942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008532	TGTT	2	8	88956	88963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008532	T	6	6	88978	88983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008532	ATA	2	6	88986	88991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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540	NC_008532	ATA	2	6	89193	89198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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545	NC_008532	ATT	2	6	89489	89494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008532	TCA	2	6	89553	89558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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551	NC_008532	CTG	2	6	89923	89928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008532	CAGA	2	8	89951	89958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_008532	AAG	2	6	89961	89966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008532	ATA	2	6	89970	89975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008532	T	7	7	89987	89993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008532	TAT	2	6	90026	90031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008532	TGATAT	2	12	90117	90128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_008532	TAT	2	6	91771	91776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_008532	TAT	2	6	93104	93109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008532	ATGA	2	8	93217	93224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008532	TAT	2	6	96295	96300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008532	A	6	6	96311	96316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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566	NC_008532	AAT	2	6	96336	96341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008532	GAAA	2	8	96983	96990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008532	T	6	6	97110	97115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008532	A	6	6	97166	97171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008532	T	6	6	97189	97194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008532	TTTTA	2	10	97199	97208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008532	TA	3	6	97207	97212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008532	A	6	6	97327	97332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008532	AATT	2	8	97341	97348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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590	NC_008532	TTTA	2	8	103144	103151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008532	TAGC	2	8	103152	103159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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599	NC_008532	GGTA	2	8	104248	104255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_008532	TA	4	8	104389	104396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_008532	TAT	2	6	105381	105386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_008532	CAG	2	6	105415	105420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_008532	ATT	2	6	105643	105648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008532	TTA	2	6	105716	105721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008532	TTTAC	2	10	105730	105739	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_008532	GGA	2	6	105740	105745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008532	ATG	2	6	105844	105849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008532	ACAT	2	8	105882	105889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_008532	AGT	2	6	105968	105973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008532	ATT	3	9	105978	105986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008532	ATA	2	6	106007	106012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_008532	TCT	2	6	106112	106117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008532	ATTTT	2	10	106149	106158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008532	ATA	2	6	106159	106164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008532	GAAT	2	8	106179	106186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008532	ATT	2	6	106196	106201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008532	AAAT	2	8	106205	106212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008532	TAT	2	6	106223	106228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008532	AGA	2	6	106242	106247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008532	ATTG	2	8	106372	106379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008532	TTTAA	2	10	108131	108140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008532	ATTAT	2	10	108182	108191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008532	AAT	2	6	108227	108232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008532	GAA	2	6	108258	108263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008532	GT	3	6	108286	108291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008532	CCT	2	6	108379	108384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_008532	CTT	2	6	108401	108406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008532	CT	3	6	108570	108575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_008532	CTAG	2	8	108666	108673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_008532	GTT	3	9	108700	108708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008532	TGAT	2	8	108726	108733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008532	AAG	2	6	108823	108828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008532	TGA	2	6	109059	109064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008532	GAT	2	6	109079	109084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_008532	TCA	2	6	109383	109388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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