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Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008345	TAAAA	2	10	15493	15502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008345	CTCTT	2	10	43905	43914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008345	AGTCG	2	10	45045	45054	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008345	AGGCT	2	10	45374	45383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008345	TACTT	2	10	47787	47796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008345	TAATT	2	10	59456	59465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008345	ACAAA	2	10	74859	74868	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008345	TCGTT	2	10	82372	82381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008345	GTTTC	2	10	86826	86835	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008345	GAGTC	2	10	97717	97726	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008345	TGTTT	2	10	115790	115799	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008345	CAAAA	2	10	136501	136510	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008345	TAAAC	2	10	143409	143418	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008345	CTCTT	2	10	143889	143898	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008345	AGTCG	2	10	145028	145037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008345	AGGCT	2	10	145357	145366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008345	TCGAT	2	10	152166	152175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008345	AAGCA	2	10	161405	161414	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008345	GAAAG	2	10	194221	194230	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008345	CTCTT	2	10	196442	196451	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008345	AGTCG	2	10	197582	197591	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008345	AGGCT	2	10	197911	197920	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008345	TCCGC	2	10	199825	199834	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008345	TCCGC	2	10	200050	200059	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_008345	CGCCA	2	10	216266	216275	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_008345	AAAAT	2	10	220102	220111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008345	AATAA	2	10	224461	224470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008345	TTAAA	2	10	247835	247844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008345	ACAAA	2	10	258241	258250	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008345	ATTTT	2	10	259950	259959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008345	TTAAC	2	10	264724	264733	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008345	GTTAA	2	10	280486	280495	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008345	ACTTA	2	10	291685	291694	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008345	TGGTT	2	10	300725	300734	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008345	AGCCT	2	10	319849	319858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008345	CTTAT	2	10	341316	341325	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008345	TCGCT	2	10	352921	352930	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008345	TCGCT	2	10	352960	352969	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_008345	TTAAG	2	10	362611	362620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008345	ACTTT	2	10	362770	362779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008345	TCATA	2	10	427793	427802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008345	GTTTT	2	10	432303	432312	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008345	TCTAT	2	10	433435	433444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008345	TTAAC	2	10	436285	436294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008345	AGCTT	2	10	437358	437367	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008345	GATAT	2	10	466812	466821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008345	ACAAT	2	10	503509	503518	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008345	AAAAC	2	10	519391	519400	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008345	AATTG	2	10	531782	531791	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008345	TAAAA	2	10	533119	533128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008345	CTTAC	2	10	542197	542206	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008345	TTTAA	2	10	563816	563825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008345	TGAGT	2	10	568813	568822	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008345	TTAAT	2	10	570733	570742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008345	TATAT	2	10	581399	581408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008345	GAGAA	2	10	588615	588624	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008345	TAATA	2	10	611887	611896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008345	CAACG	2	10	612597	612606	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008345	AGGCA	2	10	614435	614444	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008345	TTGAA	2	10	614691	614700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008345	GATAA	2	10	620608	620617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008345	AAGTA	2	10	625364	625373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008345	GTTTT	2	10	637867	637876	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008345	GTATA	2	10	649647	649656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008345	AGGTA	2	10	650475	650484	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008345	AAAAT	2	10	658068	658077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008345	TTCAT	2	10	675772	675781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008345	TTGAT	2	10	675815	675824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008345	CAAAT	2	10	682014	682023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008345	AGAGT	2	10	691984	691993	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008345	ATCAA	2	10	694249	694258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008345	TATAA	2	10	707964	707973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008345	TAGTG	2	10	720957	720966	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008345	TAAAG	2	10	731682	731691	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008345	TTAAG	2	10	743954	743963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008345	ATAAA	2	10	748233	748242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008345	AATCT	2	10	749532	749541	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008345	GTGAT	2	10	749830	749839	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008345	TCAGC	2	10	771968	771977	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008345	AATTC	2	10	778680	778689	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008345	CTCTT	2	10	787288	787297	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_008345	AGTCG	2	10	788427	788436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008345	AGGCT	2	10	788756	788765	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008345	GTTAA	2	10	792791	792800	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008345	CTCTT	2	10	795162	795171	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_008345	AGTCG	2	10	796302	796311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008345	AGGCT	2	10	796631	796640	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008345	GATAG	2	10	798524	798533	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008345	GGTTT	2	10	800069	800078	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008345	TGGTT	2	10	802122	802131	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008345	CCAAC	2	10	807521	807530	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_008345	ATAAA	2	10	812231	812240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008345	TTAAA	2	10	812563	812572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008345	GTTTT	2	10	812583	812592	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008345	TAAAA	2	10	812611	812620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008345	GTTCA	2	10	815468	815477	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008345	AGTTT	2	10	832950	832959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008345	GTTTT	2	10	841911	841920	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008345	AGCAC	2	10	843307	843316	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008345	AGCAC	2	10	843737	843746	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_008345	ATTTT	2	10	859778	859787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008345	AAAAG	2	10	861080	861089	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008345	TTTCA	2	10	862031	862040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008345	AACTT	2	10	880519	880528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008345	ATTGA	2	10	883254	883263	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008345	TTAAG	2	10	885356	885365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008345	TCCAA	2	10	894383	894392	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008345	TAAGT	2	10	894550	894559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008345	TCGCT	2	10	928731	928740	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_008345	TCGCT	2	10	928768	928777	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008345	TCGCT	2	10	928806	928815	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008345	TCGCT	2	10	928844	928853	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008345	TCGCT	2	10	928882	928891	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_008345	TCGCT	2	10	928920	928929	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008345	TCGCT	2	10	928958	928967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008345	TCGCT	2	10	928996	929005	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008345	TCGCT	2	10	929034	929043	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008345	TTAAA	2	10	935640	935649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008345	ATTGT	2	10	943224	943233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008345	TAACA	2	10	944338	944347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008345	GTATG	2	10	952098	952107	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008345	TAAAT	2	10	953437	953446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008345	ACGTG	2	10	953524	953533	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008345	AATTT	2	10	954953	954962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008345	ACTCA	2	10	956230	956239	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_008345	AATAA	2	10	965277	965286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008345	CAGCG	2	10	967939	967948	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008345	AGGAT	2	10	968505	968514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008345	AATGT	2	10	969792	969801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008345	TCGCT	2	10	981432	981441	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008345	TAACT	2	10	983432	983441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008345	ATTTA	2	10	1003685	1003694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008345	TTTTA	2	10	1003855	1003864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008345	AGGGC	2	10	1003875	1003884	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008345	CAATA	2	10	1004278	1004287	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008345	CGTTT	2	10	1010917	1010926	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008345	TAATT	2	10	1011334	1011343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008345	AAGCT	2	10	1015065	1015074	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008345	ACAAA	2	10	1021579	1021588	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008345	GTTTG	2	10	1021618	1021627	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008345	TAAAT	2	10	1023920	1023929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008345	ATGGC	2	10	1039873	1039882	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008345	AGTTA	2	10	1040761	1040770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008345	ACCAA	2	10	1040787	1040796	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008345	GCTCT	2	10	1052803	1052812	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_008345	AAGCT	2	10	1053081	1053090	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_008345	ATCAA	2	10	2133148	2133157	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_008345	GAAGC	2	10	3429786	3429795	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
488	NC_008345	ACGCT	2	10	3434292	3434301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_008345	GAAGC	2	10	3446951	3446960	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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