MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008345	CAT	2	6	883237	883242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008345	ATTGA	2	10	883254	883263	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008345	ATT	2	6	883287	883292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008345	CTTA	2	8	883314	883321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_008345	TTG	2	6	883330	883335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008345	TTTC	2	8	883343	883350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_008345	TTG	2	6	883360	883365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008345	GCT	2	6	883374	883379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_008345	AT	3	6	883426	883431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008345	TCT	2	6	883442	883447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_008345	ATT	2	6	883517	883522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008345	GTG	2	6	884743	884748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008345	GAA	2	6	884770	884775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008345	AAT	2	6	884798	884803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008345	TGG	2	6	884826	884831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008345	TTAAG	2	10	885356	885365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008345	CGT	2	6	885375	885380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_008345	GA	3	6	885382	885387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008345	TTG	2	6	885405	885410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008345	CTAA	2	8	885424	885431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_008345	GTT	2	6	885467	885472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008345	CTG	2	6	885501	885506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_008345	TTAA	2	8	886790	886797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008345	A	6	6	888105	888110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008345	AGGTAT	2	12	888138	888149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008345	TATC	2	8	888253	888260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_008345	TTG	2	6	888506	888511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008345	AAT	2	6	888514	888519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008345	ATTG	2	8	888530	888537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008345	TTA	2	6	888538	888543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008345	GCC	2	6	888578	888583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_008345	ATT	2	6	894088	894093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008345	TCC	2	6	894095	894100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_008345	AAT	2	6	894177	894182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008345	TTC	2	6	894239	894244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_008345	TCC	2	6	894270	894275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_008345	ATTT	2	8	894304	894311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008345	TTCA	2	8	894312	894319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_008345	A	6	6	894325	894330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008345	CCA	2	6	894331	894336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_008345	TAGT	2	8	894340	894347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008345	CAT	2	6	894364	894369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_008345	TCCAA	2	10	894383	894392	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3044	NC_008345	TAA	2	6	894408	894413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008345	T	7	7	894417	894423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008345	AAC	2	6	894424	894429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_008345	AT	3	6	894447	894452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008345	AAT	2	6	894463	894468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008345	ATA	2	6	894502	894507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008345	TAAGT	2	10	894550	894559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008345	TA	3	6	894577	894582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008345	GT	3	6	894594	894599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008345	ATT	2	6	894706	894711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008345	TAA	2	6	894719	894724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008345	TGA	2	6	894825	894830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008345	ATACTC	2	12	894875	894886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_008345	TGG	2	6	894906	894911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008345	TGT	2	6	895011	895016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008345	T	6	6	895781	895786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008345	TCT	2	6	896935	896940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_008345	ATG	2	6	901717	901722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008345	T	6	6	901726	901731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008345	TAT	2	6	901737	901742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008345	AC	3	6	901747	901752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_008345	ATC	2	6	901850	901855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_008345	TGA	2	6	901862	901867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008345	A	7	7	901867	901873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008345	CTA	2	6	901887	901892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_008345	TAT	2	6	902576	902581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008345	T	7	7	902594	902600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008345	A	7	7	902607	902613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008345	AC	3	6	902710	902715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_008345	GA	3	6	902716	902721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008345	TGT	2	6	902751	902756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008345	AAC	2	6	902761	902766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_008345	ACA	2	6	902874	902879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_008345	ATA	3	9	902883	902891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008345	TAA	2	6	905548	905553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008345	TGAA	2	8	905555	905562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008345	AAT	2	6	905641	905646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008345	ACG	2	6	905706	905711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_008345	TAGC	2	8	905737	905744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_008345	T	6	6	905751	905756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008345	T	7	7	905813	905819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008345	ATGA	2	8	905821	905828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008345	TAA	2	6	905836	905841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008345	TA	3	6	905907	905912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008345	AAAC	2	8	905985	905992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_008345	AT	3	6	906003	906008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008345	GAT	2	6	906024	906029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008345	AAT	2	6	906030	906035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_008345	ATT	2	6	907509	907514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008345	TTAA	2	8	907525	907532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008345	TTG	2	6	907560	907565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008345	TAA	2	6	908829	908834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008345	AAT	2	6	908883	908888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008345	AT	3	6	908899	908904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008345	TG	3	6	908949	908954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008345	TTA	2	6	909006	909011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008345	ATT	2	6	909014	909019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008345	CTT	2	6	910951	910956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_008345	TAG	2	6	911027	911032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008345	TCAT	2	8	911048	911055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_008345	ATC	2	6	911968	911973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_008345	ATG	2	6	915250	915255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_008345	AAT	2	6	915366	915371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_008345	TAAT	2	8	915417	915424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_008345	GAT	2	6	916092	916097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008345	T	8	8	916124	916131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008345	GGT	2	6	916151	916156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008345	A	6	6	916236	916241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008345	CGT	2	6	916338	916343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_008345	GCC	2	6	916404	916409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_008345	TTC	2	6	916571	916576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_008345	TTA	2	6	916631	916636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008345	GT	3	6	916789	916794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008345	CTC	2	6	916922	916927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_008345	CAA	2	6	918857	918862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_008345	AAT	2	6	918869	918874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008345	GTTA	2	8	918906	918913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008345	GAA	2	6	918960	918965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008345	GGC	2	6	919141	919146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_008345	ACG	2	6	919207	919212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_008345	TGG	2	6	919214	919219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008345	ACG	2	6	919308	919313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_008345	TGG	2	6	919315	919320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_008345	T	9	9	920315	920323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008345	AT	4	8	920387	920394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008345	GTT	2	6	920435	920440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_008345	GCA	2	6	921960	921965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_008345	GCA	2	6	921974	921979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_008345	GCA	2	6	921988	921993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_008345	AAT	2	6	922036	922041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_008345	AAT	2	6	922120	922125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_008345	ATT	2	6	922238	922243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_008345	TTGT	2	8	923012	923019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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