MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008345	AAT	2	6	515796	515801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008345	CAC	2	6	515824	515829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_008345	GTGA	2	8	515860	515867	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008345	CAA	2	6	515925	515930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_008345	ATA	2	6	515946	515951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008345	AGT	2	6	515990	515995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008345	T	6	6	516043	516048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008345	ACA	2	6	516062	516067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_008345	ATC	2	6	516098	516103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_008345	A	6	6	516152	516157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008345	TGTT	2	8	516167	516174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008345	TAT	2	6	516226	516231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008345	CAT	2	6	516243	516248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_008345	ATT	2	6	516254	516259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008345	ATGA	2	8	519322	519329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008345	TAC	2	6	519372	519377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_008345	AAAAC	2	10	519391	519400	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1518	NC_008345	TTA	2	6	519773	519778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008345	TAG	2	6	520780	520785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008345	T	6	6	520789	520794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008345	T	6	6	520833	520838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008345	TTA	2	6	520848	520853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008345	TAA	2	6	520871	520876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008345	T	6	6	520883	520888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008345	AG	3	6	520918	520923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008345	TA	3	6	520933	520938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008345	AAC	2	6	520960	520965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_008345	ATT	2	6	521011	521016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008345	TTA	2	6	521967	521972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008345	T	6	6	522018	522023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008345	TGA	2	6	522084	522089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008345	TGT	2	6	522158	522163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008345	ATT	2	6	522198	522203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008345	TAT	2	6	522285	522290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008345	TG	3	6	522312	522317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008345	TAA	2	6	522338	522343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008345	ATG	2	6	522436	522441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008345	GCT	2	6	525982	525987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008345	GCT	2	6	526091	526096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_008345	GCT	2	6	526200	526205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_008345	GCT	2	6	526309	526314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008345	GCT	2	6	526418	526423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_008345	AATG	2	8	526581	526588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008345	CGC	2	6	526636	526641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1547	NC_008345	ATT	2	6	526739	526744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_008345	CGA	2	6	528047	528052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1550	NC_008345	TGAT	2	8	528094	528101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008345	A	6	6	528122	528127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008345	TGA	2	6	528130	528135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008345	GTC	2	6	528159	528164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_008345	TAAA	2	8	528178	528185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008345	TTA	2	6	528606	528611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008345	T	7	7	528695	528701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008345	TAA	2	6	530992	530997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008345	A	6	6	530996	531001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008345	T	6	6	531023	531028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008345	ATT	2	6	531035	531040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008345	TTA	2	6	531044	531049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008345	GTT	2	6	531056	531061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008345	AAAC	2	8	531063	531070	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_008345	CTT	2	6	531082	531087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_008345	ATG	2	6	531729	531734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008345	ATG	2	6	531775	531780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008345	AATTG	2	10	531782	531791	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008345	TCA	2	6	532577	532582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_008345	TGC	2	6	532605	532610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_008345	GCT	2	6	532616	532621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_008345	TAAAA	2	10	533119	533128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_008345	A	6	6	533125	533130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008345	TAA	2	6	536947	536952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_008345	ATA	2	6	539018	539023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_008345	TAA	2	6	539054	539059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008345	TAAT	2	8	542116	542123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008345	TGC	2	6	542158	542163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1583	NC_008345	CTTAC	2	10	542197	542206	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1584	NC_008345	GCA	2	6	542238	542243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1587	NC_008345	A	7	7	543402	543408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008345	ATCA	2	8	544051	544058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_008345	GTAA	2	8	544140	544147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008345	TTTC	2	8	544149	544156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_008345	AT	3	6	544176	544181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008345	T	6	6	544206	544211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008345	TTA	2	6	544254	544259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008345	ATA	2	6	544275	544280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008345	AG	3	6	544324	544329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008345	CTGC	2	8	544743	544750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_008345	CCGC	2	8	544758	544765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1598	NC_008345	CTT	2	6	544793	544798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_008345	TAT	2	6	544966	544971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008345	GTA	2	6	545589	545594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008345	CTC	2	6	545640	545645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_008345	GTA	2	6	545648	545653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008345	AGAA	2	8	545665	545672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008345	TGC	2	6	546777	546782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1606	NC_008345	TCT	2	6	547314	547319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008345	CT	3	6	547318	547323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_008345	AAC	2	6	547342	547347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_008345	TTTTAT	2	12	547382	547393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008345	GCTT	2	8	547408	547415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_008345	AAT	2	6	547448	547453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008345	A	6	6	547454	547459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_008345	CTT	2	6	547518	547523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008345	TG	3	6	547614	547619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008345	TAG	2	6	547631	547636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008345	TAA	2	6	547646	547651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008345	CAG	2	6	547733	547738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_008345	A	7	7	548850	548856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_008345	T	6	6	548875	548880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008345	T	6	6	548889	548894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008345	T	6	6	548896	548901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008345	AGTT	2	8	548919	548926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008345	T	6	6	549008	549013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008345	TGATTT	2	12	549015	549026	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008345	CGT	2	6	549052	549057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_008345	GCT	2	6	549095	549100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_008345	A	7	7	549118	549124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_008345	CGC	2	6	549132	549137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_008345	CGA	2	6	549171	549176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_008345	CA	3	6	549255	549260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_008345	AT	3	6	549292	549297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008345	CAG	2	6	549302	549307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_008345	TGA	2	6	549333	549338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_008345	CTGT	2	8	549386	549393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1636	NC_008345	CAA	2	6	549445	549450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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