MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008345	GTA	2	6	306773	306778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008345	T	7	7	307693	307699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008345	TGA	2	6	307712	307717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008345	AAAT	2	8	313102	313109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008345	TC	3	6	313222	313227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_008345	TA	3	6	313234	313239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008345	TGT	2	6	313240	313245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008345	TTA	2	6	313253	313258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008345	ATTT	2	8	313264	313271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008345	AT	3	6	314767	314772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008345	TAT	2	6	316080	316085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008345	ATT	2	6	316537	316542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008345	T	6	6	316563	316568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008345	AAT	2	6	316612	316617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008345	CAT	2	6	317269	317274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008345	GAT	2	6	317302	317307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008345	T	8	8	317343	317350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008345	TGT	2	6	317372	317377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008345	TCAA	2	8	318126	318133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_008345	GTT	2	6	319700	319705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008345	TGA	2	6	319712	319717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008345	GT	3	6	319732	319737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008345	TTAG	2	8	319759	319766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008345	AT	4	8	319790	319797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008345	AGCCT	2	10	319849	319858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1026	NC_008345	AAT	2	6	321880	321885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008345	A	6	6	322010	322015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008345	CAA	2	6	322052	322057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008345	AACA	2	8	322745	322752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_008345	TTA	2	6	323070	323075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008345	T	6	6	323135	323140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008345	ACG	2	6	323229	323234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008345	GCCA	2	8	323340	323347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_008345	GATG	2	8	323370	323377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008345	GTG	2	6	323427	323432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008345	A	7	7	323478	323484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008345	A	7	7	323489	323495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008345	TGT	2	6	323520	323525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008345	GTT	2	6	323549	323554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008345	TCT	2	6	324220	324225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_008345	GCA	2	6	324267	324272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_008345	TAA	2	6	324301	324306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008345	ATAA	2	8	324377	324384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008345	ACT	2	6	324463	324468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_008345	A	6	6	324940	324945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008345	ATA	2	6	325000	325005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008345	TGTA	2	8	325081	325088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008345	TCA	2	6	325123	325128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008345	ATA	2	6	325134	325139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008345	CTAT	2	8	325676	325683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_008345	TCAT	2	8	326758	326765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_008345	TTA	2	6	326779	326784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008345	GA	3	6	326825	326830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008345	AAG	2	6	326831	326836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008345	T	7	7	328102	328108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008345	TTC	2	6	329101	329106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008345	TAT	2	6	329114	329119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008345	CAA	2	6	329161	329166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008345	CAA	2	6	329175	329180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008345	TTGA	2	8	330203	330210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008345	TAA	2	6	330900	330905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008345	TTG	2	6	330972	330977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008345	ATT	2	6	330983	330988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008345	ATA	2	6	330989	330994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008345	TAA	2	6	332335	332340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008345	TAA	2	6	332349	332354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008345	TAA	2	6	332362	332367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008345	GTA	2	6	335231	335236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008345	ATG	2	6	335241	335246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008345	T	6	6	335265	335270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008345	TGA	2	6	336904	336909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008345	GCTG	2	8	336915	336922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_008345	T	7	7	338540	338546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008345	AAT	2	6	338620	338625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008345	GAT	2	6	338912	338917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008345	GTC	2	6	339034	339039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008345	AGCT	2	8	339050	339057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_008345	ATT	2	6	339058	339063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008345	ATT	2	6	339110	339115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008345	T	6	6	339149	339154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008345	CTTAT	2	10	341316	341325	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_008345	AAAT	2	8	343035	343042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008345	TCG	2	6	343574	343579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_008345	T	6	6	343618	343623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008345	ATC	2	6	343729	343734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_008345	AAT	2	6	344663	344668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008345	ATT	2	6	344710	344715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008345	ATAA	2	8	345501	345508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008345	TCC	2	6	348134	348139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_008345	AAG	2	6	348162	348167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008345	GAA	2	6	348305	348310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008345	CGT	2	6	348311	348316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008345	T	6	6	348352	348357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008345	AAT	2	6	348398	348403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008345	TGT	2	6	348417	348422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008345	TGA	2	6	348435	348440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008345	T	7	7	348565	348571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008345	CA	3	6	348714	348719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_008345	CAT	2	6	348800	348805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008345	CACT	2	8	348896	348903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_008345	GT	3	6	348955	348960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008345	ATG	2	6	349018	349023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008345	ATT	2	6	349024	349029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008345	TG	3	6	349052	349057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008345	TTA	2	6	349070	349075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008345	TGA	2	6	349096	349101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008345	ATG	2	6	349206	349211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008345	TAC	2	6	350654	350659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008345	ATG	2	6	351755	351760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008345	AC	3	6	351790	351795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_008345	TGAA	2	8	351837	351844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008345	A	8	8	352436	352443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008345	TTA	2	6	352502	352507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008345	ATCT	2	8	352863	352870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_008345	TGT	2	6	352905	352910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008345	TCGCT	2	10	352921	352930	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_008345	TCGCT	2	10	352960	352969	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1119	NC_008345	ACT	2	6	352989	352994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008345	AGC	2	6	353051	353056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008345	CAA	2	6	353098	353103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_008345	ATGC	2	8	353113	353120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_008345	A	9	9	355016	355024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008345	AGT	2	6	355034	355039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008345	A	6	6	355059	355064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008345	CAG	2	6	355083	355088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008345	ATT	2	6	355103	355108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008345	A	6	6	355145	355150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008345	TA	4	8	355163	355170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008345	ATG	2	6	355183	355188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008345	TAACAT	2	12	355220	355231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1132	NC_008345	ATG	2	6	355258	355263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008345	AGA	2	6	355304	355309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008345	TTAG	2	8	355341	355348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_008345	CAT	2	6	355409	355414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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