MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008345	TAA	2	6	1860591	1860596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008345	ATTA	2	8	1860606	1860613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_008345	TTA	2	6	1860669	1860674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_008345	AAT	2	6	1860678	1860683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_008345	TGT	2	6	1860712	1860717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_008345	AAAT	2	8	1860722	1860729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_008345	TTAT	2	8	1860744	1860751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008345	GTT	2	6	1860771	1860776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_008345	GAA	2	6	1860824	1860829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008345	CAA	2	6	1860839	1860844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_008345	CCA	2	6	1860880	1860885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_008345	TA	3	6	1860955	1860960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_008345	GAT	2	6	1860994	1860999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_008345	TAA	2	6	1861041	1861046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008345	CAT	2	6	1861098	1861103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_008345	AAG	2	6	1861148	1861153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_008345	CCA	2	6	1866143	1866148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_008345	TATT	2	8	1866432	1866439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008345	TAT	2	6	1866443	1866448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008345	TCA	2	6	1866485	1866490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_008345	ATTA	2	8	1866528	1866535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008345	T	7	7	1866564	1866570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008345	ATT	2	6	1866578	1866583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008345	GGT	2	6	1866624	1866629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008345	AT	3	6	1866632	1866637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_008345	GAAT	2	8	1866653	1866660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_008345	T	6	6	1866751	1866756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_008345	C	6	6	1867313	1867318	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6029	NC_008345	TTA	2	6	1867348	1867353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008345	T	6	6	1867362	1867367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_008345	T	8	8	1867827	1867834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_008345	AAT	2	6	1867849	1867854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_008345	GTTT	2	8	1869209	1869216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_008345	CCCT	2	8	1869249	1869256	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6035	NC_008345	T	6	6	1869318	1869323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_008345	ATC	2	6	1870291	1870296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_008345	T	6	6	1870336	1870341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_008345	TC	3	6	1870414	1870419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_008345	T	6	6	1870423	1870428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008345	GA	3	6	1870499	1870504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_008345	ACG	2	6	1870559	1870564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_008345	ATC	2	6	1870626	1870631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_008345	TGCCT	2	10	1870632	1870641	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6044	NC_008345	GTT	2	6	1870749	1870754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_008345	GTA	2	6	1870849	1870854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_008345	ATT	2	6	1870882	1870887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_008345	GCT	2	6	1873448	1873453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6049	NC_008345	GGA	2	6	1874244	1874249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_008345	TTAT	2	8	1874262	1874269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_008345	TA	3	6	1874287	1874292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_008345	TGC	2	6	1876516	1876521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_008345	TAA	2	6	1876561	1876566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008345	TAA	2	6	1876573	1876578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008345	TAG	2	6	1876591	1876596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_008345	TAT	2	6	1876750	1876755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_008345	CTG	2	6	1876758	1876763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_008345	TATT	2	8	1876801	1876808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008345	GGT	2	6	1876809	1876814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_008345	GTT	2	6	1876920	1876925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_008345	CAAG	2	8	1876936	1876943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_008345	GCTC	2	8	1877009	1877016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_008345	TTA	2	6	1877101	1877106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_008345	TAT	2	6	1878142	1878147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_008345	T	7	7	1878172	1878178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6067	NC_008345	TAA	2	6	1879738	1879743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_008345	GTATT	2	10	1879754	1879763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_008345	TCA	2	6	1879792	1879797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_008345	TTG	2	6	1879834	1879839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_008345	TAA	2	6	1879848	1879853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_008345	TTA	2	6	1879882	1879887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_008345	A	6	6	1881538	1881543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_008345	TGC	2	6	1881611	1881616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_008345	ATTA	2	8	1881617	1881624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_008345	ATG	2	6	1881627	1881632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_008345	TA	3	6	1881690	1881695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_008345	ATCA	2	8	1883924	1883931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6079	NC_008345	TATCA	2	10	1883950	1883959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6080	NC_008345	GTTT	2	8	1884017	1884024	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_008345	TAT	2	6	1884025	1884030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_008345	TTAA	3	12	1884044	1884055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_008345	GAAC	2	8	1884064	1884071	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_008345	CTAAAG	2	12	1884126	1884137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6087	NC_008345	TGA	2	6	1885132	1885137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_008345	ATTG	2	8	1885202	1885209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_008345	AATT	2	8	1885238	1885245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_008345	AATAA	2	10	1885266	1885275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_008345	TG	3	6	1885291	1885296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_008345	ATA	2	6	1885324	1885329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_008345	ACA	2	6	1885415	1885420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_008345	ATA	2	6	1885812	1885817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_008345	GCTA	2	8	1885874	1885881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_008345	G	6	6	1885934	1885939	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_008345	TTGA	2	8	1885997	1886004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6099	NC_008345	TTG	2	6	1888946	1888951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_008345	TGAT	2	8	1888971	1888978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_008345	TTA	2	6	1889003	1889008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_008345	TAA	2	6	1889021	1889026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008345	TAA	2	6	1889890	1889895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_008345	AAT	2	6	1889911	1889916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_008345	TTGT	2	8	1889946	1889953	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_008345	AT	3	6	1891218	1891223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_008345	TATT	2	8	1891247	1891254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_008345	GTCG	2	8	1891330	1891337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_008345	A	6	6	1891423	1891428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_008345	GTTAT	2	10	1891469	1891478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_008345	AGTT	2	8	1891503	1891510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_008345	ATG	2	6	1891532	1891537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_008345	TAA	2	6	1891545	1891550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_008345	TTATT	2	10	1891556	1891565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_008345	GTT	2	6	1891597	1891602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_008345	TTG	2	6	1891614	1891619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_008345	A	6	6	1892704	1892709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_008345	TAA	2	6	1893388	1893393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_008345	ATGGT	2	10	1893413	1893422	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_008345	ACA	2	6	1894036	1894041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_008345	AAT	2	6	1894099	1894104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_008345	TGAG	2	8	1894957	1894964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_008345	CTG	2	6	1896566	1896571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6127	NC_008345	AAT	2	6	1897137	1897142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_008345	TGC	2	6	1897672	1897677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_008345	GCA	2	6	1897734	1897739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_008345	GAAA	2	8	1897759	1897766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_008345	GAT	2	6	1901724	1901729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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