MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008345	AGATT	2	10	1551042	1551051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_008345	CAT	2	6	1551064	1551069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_008345	GTTG	2	8	1552870	1552877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_008345	TTA	2	6	1552904	1552909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008345	TTTAT	2	10	1552947	1552956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008345	CTGC	2	8	1553457	1553464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_008345	GCAG	2	8	1553481	1553488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_008345	GTTC	2	8	1560263	1560270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_008345	CGT	2	6	1560276	1560281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_008345	ATT	2	6	1560291	1560296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008345	CTTG	2	8	1560307	1560314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_008345	GTT	2	6	1560328	1560333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008345	ATT	2	6	1560340	1560345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008345	ATGTC	2	10	1560347	1560356	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5015	NC_008345	ATT	3	9	1561957	1561965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008345	TGA	2	6	1561973	1561978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008345	T	7	7	1562051	1562057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008345	A	6	6	1562094	1562099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008345	AGG	2	6	1562136	1562141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008345	TC	3	6	1565213	1565218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_008345	T	8	8	1565244	1565251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008345	ATT	2	6	1565275	1565280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008345	CAA	2	6	1565352	1565357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_008345	ATT	2	6	1565370	1565375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_008345	T	6	6	1565416	1565421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008345	TGT	2	6	1565425	1565430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_008345	CTTT	2	8	1565479	1565486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_008345	A	6	6	1565624	1565629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008345	ATT	2	6	1568079	1568084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008345	ATG	2	6	1568098	1568103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008345	ATTA	2	8	1569509	1569516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_008345	TTA	2	6	1569541	1569546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_008345	A	6	6	1569595	1569600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_008345	ATTA	2	8	1569678	1569685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_008345	AAT	2	6	1569696	1569701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_008345	ATT	2	6	1569713	1569718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008345	ATC	2	6	1569752	1569757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_008345	ATT	2	6	1569802	1569807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008345	AAC	2	6	1569854	1569859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_008345	TGT	2	6	1573913	1573918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008345	TAC	2	6	1573925	1573930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_008345	A	6	6	1573945	1573950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008345	TG	3	6	1575075	1575080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008345	GTT	2	6	1575183	1575188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008345	AGC	2	6	1575268	1575273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008345	T	6	6	1575326	1575331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008345	TTGA	2	8	1575341	1575348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008345	ATG	2	6	1575374	1575379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008345	TAA	3	9	1576298	1576306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008345	AAT	2	6	1577263	1577268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008345	T	6	6	1577321	1577326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008345	GTTT	2	8	1577334	1577341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008345	GGC	2	6	1577344	1577349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008345	AAT	2	6	1577370	1577375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008345	TTAT	2	8	1578213	1578220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008345	TAT	2	6	1579761	1579766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_008345	T	6	6	1579834	1579839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008345	TAAA	2	8	1579858	1579865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_008345	AT	3	6	1580373	1580378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008345	TGC	2	6	1580380	1580385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_008345	GCA	2	6	1580406	1580411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_008345	AATA	2	8	1580433	1580440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_008345	AAT	2	6	1580443	1580448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_008345	TTCA	2	8	1580455	1580462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_008345	TCC	2	6	1580511	1580516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_008345	TAC	2	6	1580524	1580529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_008345	ATT	2	6	1580597	1580602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_008345	CAA	2	6	1580626	1580631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_008345	TTAG	2	8	1581773	1581780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_008345	ATT	2	6	1581832	1581837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_008345	AG	3	6	1581911	1581916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_008345	TATT	2	8	1581934	1581941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008345	TAC	2	6	1581955	1581960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_008345	CAA	2	6	1582876	1582881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_008345	ATTTA	2	10	1582899	1582908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_008345	TAA	2	6	1583402	1583407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_008345	GCCA	2	8	1584979	1584986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_008345	AAT	2	6	1585055	1585060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_008345	CAC	2	6	1585078	1585083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_008345	TACT	2	8	1585099	1585106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_008345	TAG	2	6	1585163	1585168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_008345	T	6	6	1586246	1586251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008345	TCA	3	9	1587605	1587613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008345	TAG	2	6	1587727	1587732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008345	TTG	2	6	1587743	1587748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_008345	ATG	2	6	1587759	1587764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008345	AGA	2	6	1588519	1588524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_008345	TTG	2	6	1588565	1588570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008345	TCATC	2	10	1589325	1589334	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5090	NC_008345	AAT	2	6	1589338	1589343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008345	ATA	2	6	1589349	1589354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008345	A	7	7	1589383	1589389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008345	ATG	2	6	1589429	1589434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008345	ATG	2	6	1589511	1589516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_008345	GAT	2	6	1589540	1589545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008345	A	6	6	1589562	1589567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008345	TGGT	2	8	1589619	1589626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_008345	TAAT	2	8	1589660	1589667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008345	CCCT	2	8	1592649	1592656	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5100	NC_008345	GTT	2	6	1592670	1592675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008345	AT	4	8	1592765	1592772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_008345	ATTA	2	8	1592844	1592851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008345	T	6	6	1592870	1592875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_008345	CGTCAA	2	12	1592892	1592903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_008345	ATT	2	6	1592916	1592921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008345	T	6	6	1592930	1592935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_008345	AAGTT	2	10	1594161	1594170	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_008345	ACC	2	6	1594178	1594183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_008345	ACA	2	6	1594230	1594235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_008345	ATG	2	6	1595810	1595815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008345	ACA	2	6	1595856	1595861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_008345	ACC	2	6	1595864	1595869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_008345	AATG	2	8	1600837	1600844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008345	ATG	2	6	1600874	1600879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008345	T	6	6	1600910	1600915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008345	A	8	8	1600958	1600965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008345	ACAT	2	8	1602188	1602195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_008345	AATAA	2	10	1602201	1602210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008345	TTTA	2	8	1603294	1603301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_008345	AGC	2	6	1603333	1603338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_008345	CCT	2	6	1603438	1603443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_008345	TGT	2	6	1603483	1603488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_008345	AT	3	6	1603499	1603504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008345	TAA	2	6	1603512	1603517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_008345	ATTG	2	8	1603592	1603599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_008345	T	6	6	1603621	1603626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_008345	ACA	2	6	1604757	1604762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_008345	GAT	2	6	1604771	1604776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008345	AC	3	6	1604996	1605001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_008345	ACA	2	6	1605029	1605034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_008345	TTTA	2	8	1606701	1606708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_008345	ATTC	2	8	1608037	1608044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5133	NC_008345	ACT	2	6	1608105	1608110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_008345	ATT	2	6	1608131	1608136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_008345	TGT	2	6	1608179	1608184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5143	NC_008345	T	7	7	1611986	1611992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_008345	CTTTTG	2	12	1653744	1653755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5257	NC_008345	T	6	6	1654894	1654899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_008345	GGAC	2	8	1655002	1655009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5261	NC_008345	ACGT	2	8	1655382	1655389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5262	NC_008345	GGT	2	6	1655448	1655453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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