MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008345	A	6	6	1347523	1347528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_008345	CTT	2	6	1347547	1347552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_008345	GTAT	2	8	1347580	1347587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_008345	AAT	2	6	1347606	1347611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_008345	TC	3	6	1347627	1347632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_008345	TAGGT	2	10	1347633	1347642	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_008345	TCGTGT	2	12	1347676	1347687	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4508	NC_008345	A	6	6	1347738	1347743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_008345	TTTA	2	8	1347760	1347767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_008345	TGTTT	2	10	1347777	1347786	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_008345	TAAT	2	8	1347792	1347799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_008345	T	6	6	1347808	1347813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_008345	ATTT	2	8	1347833	1347840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_008345	T	6	6	1347887	1347892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_008345	TG	3	6	1347922	1347927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_008345	T	6	6	1347986	1347991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_008345	CTG	2	6	1348089	1348094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_008345	AAT	2	6	1348096	1348101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_008345	TAA	2	6	1348135	1348140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_008345	A	6	6	1348186	1348191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_008345	CAT	3	9	1348332	1348340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_008345	A	6	6	1351258	1351263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_008345	TAA	2	6	1351273	1351278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_008345	T	6	6	1351284	1351289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_008345	ACCG	2	8	1351321	1351328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_008345	GCC	2	6	1351408	1351413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_008345	C	6	6	1351425	1351430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4528	NC_008345	TAA	2	6	1351437	1351442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_008345	CGC	2	6	1351446	1351451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_008345	TAAG	2	8	1351455	1351462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008345	TTTA	2	8	1351466	1351473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_008345	TAAT	2	8	1351527	1351534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_008345	T	6	6	1351551	1351556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_008345	TAA	2	6	1351573	1351578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_008345	TAA	2	6	1352078	1352083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_008345	CAT	2	6	1352089	1352094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_008345	T	6	6	1352133	1352138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_008345	ATT	2	6	1352213	1352218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_008345	ATT	2	6	1354317	1354322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_008345	AATT	2	8	1354328	1354335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_008345	TAGG	2	8	1354341	1354348	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_008345	ACT	2	6	1354376	1354381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_008345	TGA	2	6	1354431	1354436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_008345	AT	3	6	1358653	1358658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008345	TAA	2	6	1358693	1358698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_008345	A	6	6	1358720	1358725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_008345	AGT	2	6	1358758	1358763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_008345	AGT	2	6	1358823	1358828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_008345	TAT	2	6	1359563	1359568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_008345	TAAT	2	8	1359571	1359578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_008345	ATT	2	6	1359635	1359640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_008345	A	6	6	1360617	1360622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_008345	CAA	2	6	1360652	1360657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_008345	AAT	2	6	1361846	1361851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008345	AAT	2	6	1361989	1361994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008345	T	6	6	1362077	1362082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_008345	TTA	2	6	1363446	1363451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008345	TC	3	6	1363510	1363515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_008345	AGC	2	6	1363534	1363539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4561	NC_008345	CTA	2	6	1363608	1363613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_008345	T	6	6	1363643	1363648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_008345	TTC	2	6	1363664	1363669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_008345	ATC	2	6	1363708	1363713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_008345	CAT	2	6	1363715	1363720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_008345	CTATCG	2	12	1363727	1363738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_008345	T	6	6	1363775	1363780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_008345	GTT	2	6	1364299	1364304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_008345	TGT	2	6	1364319	1364324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_008345	AG	3	6	1364348	1364353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_008345	AGC	2	6	1365025	1365030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4573	NC_008345	ATG	2	6	1365586	1365591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_008345	TG	3	6	1365612	1365617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_008345	A	6	6	1366037	1366042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_008345	AAAT	2	8	1366853	1366860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_008345	A	6	6	1366898	1366903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_008345	T	6	6	1366960	1366965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_008345	ATC	2	6	1367025	1367030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_008345	TAT	2	6	1367051	1367056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_008345	TAT	2	6	1368061	1368066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_008345	ATA	2	6	1368961	1368966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_008345	TCG	2	6	1368998	1369003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_008345	TGTT	2	8	1369007	1369014	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_008345	TAAAT	2	10	1369034	1369043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_008345	ATT	2	6	1369919	1369924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_008345	AGG	2	6	1369927	1369932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_008345	TAA	2	6	1370730	1370735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_008345	TCA	2	6	1370750	1370755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_008345	GTTTAC	2	12	1372164	1372175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4591	NC_008345	TTA	2	6	1372183	1372188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_008345	ATA	2	6	1372204	1372209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_008345	TTGTTA	2	12	1372246	1372257	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_008345	CTC	2	6	1372258	1372263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_008345	TTA	2	6	1372275	1372280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_008345	T	6	6	1372303	1372308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_008345	CCT	2	6	1372361	1372366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_008345	ACA	2	6	1372368	1372373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_008345	ATG	2	6	1372393	1372398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_008345	TA	3	6	1372414	1372419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_008345	ATT	2	6	1373201	1373206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_008345	CAC	2	6	1380095	1380100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_008345	AAG	2	6	1380159	1380164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_008345	ATT	2	6	1381638	1381643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_008345	A	8	8	1381770	1381777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_008345	TTC	2	6	1381785	1381790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_008345	TTA	2	6	1381791	1381796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_008345	AT	3	6	1381821	1381826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_008345	ACAG	2	8	1381844	1381851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4610	NC_008345	GAT	2	6	1383351	1383356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_008345	TA	3	6	1383460	1383465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_008345	TGAT	2	8	1383486	1383493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_008345	GGA	2	6	1383540	1383545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_008345	CTT	2	6	1384005	1384010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_008345	A	8	8	1384020	1384027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_008345	TTAA	2	8	1385438	1385445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_008345	AAC	2	6	1385453	1385458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_008345	T	7	7	1385483	1385489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_008345	ATA	2	6	1385495	1385500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_008345	A	6	6	1386299	1386304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_008345	T	6	6	1386318	1386323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_008345	CAT	2	6	1386353	1386358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_008345	GA	4	8	1386368	1386375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_008345	CCA	2	6	1386406	1386411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_008345	TGAA	2	8	1386439	1386446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_008345	A	6	6	1386445	1386450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_008345	CAT	2	6	1386451	1386456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_008345	TGT	2	6	1386477	1386482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_008345	TGCT	2	8	1386500	1386507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_008345	ATA	2	6	1386520	1386525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_008345	TTA	2	6	1386638	1386643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_008345	TAT	2	6	1386721	1386726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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