MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 12333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008322	ATA	2	6	1560102	1560107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008322	TCA	2	6	1560114	1560119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008322	AGT	2	6	1560121	1560126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008322	TGG	2	6	1560129	1560134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008322	ATAA	2	8	1560181	1560188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008322	GTT	2	6	1561676	1561681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008322	T	6	6	1561756	1561761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008322	AG	3	6	1564325	1564330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008322	CGA	2	6	1564348	1564353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_008322	TTC	2	6	1570206	1570211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_008322	TGCT	2	8	1570244	1570251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_008322	AGCGCT	2	12	1577637	1577648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_008322	GC	3	6	1577651	1577656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_008322	GTT	2	6	1577670	1577675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_008322	ATT	2	6	1582787	1582792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008322	GGA	2	6	1582819	1582824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_008322	ATG	2	6	1590293	1590298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008322	GAC	2	6	1590300	1590305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_008322	GTC	2	6	1590320	1590325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_008322	TTG	2	6	1590402	1590407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008322	GAT	2	6	1590433	1590438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008322	ATT	2	6	1590854	1590859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_008322	TTG	2	6	1593216	1593221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_008322	AAC	2	6	1593302	1593307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_008322	ATGA	2	8	1593344	1593351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008322	ATTT	2	8	1593409	1593416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008322	AG	3	6	1593418	1593423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008322	T	6	6	1594242	1594247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008322	TTC	2	6	1594276	1594281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008322	AATG	2	8	1594311	1594318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_008322	GAATGT	2	12	1595476	1595487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008322	GAT	2	6	1595492	1595497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008322	ATC	2	6	1595554	1595559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_008322	CAAT	2	8	1595565	1595572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_008322	A	6	6	1595573	1595578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008322	T	6	6	1595595	1595600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008322	ATTG	2	8	1595601	1595608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008322	GAT	2	6	1597140	1597145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008322	CAC	2	6	1597148	1597153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_008322	GTT	2	6	1597163	1597168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_008322	TTG	2	6	1597230	1597235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008322	GTT	2	6	1597269	1597274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008322	ATA	2	6	1597275	1597280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008322	AAT	2	6	1597307	1597312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008322	TA	3	6	1597331	1597336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008322	AT	3	6	1597429	1597434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_008322	A	6	6	1597475	1597480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008322	TCCA	2	8	1597486	1597493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_008322	TAG	2	6	1597558	1597563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008322	TTA	2	6	1598066	1598071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_008322	TAAAA	2	10	1598165	1598174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008322	GTT	2	6	1598219	1598224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_008322	ATTA	2	8	1598274	1598281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008322	ATT	2	6	1598409	1598414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008322	A	6	6	1598523	1598528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008322	GAAT	2	8	1598601	1598608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008322	TGT	2	6	1598680	1598685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008322	TCT	2	6	1598777	1598782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_008322	CAT	2	6	1598827	1598832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_008322	CGC	2	6	1601405	1601410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_008322	GCA	2	6	1601897	1601902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_008322	GCTCT	2	10	1601981	1601990	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4063	NC_008322	AGCGC	2	10	1602039	1602048	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4064	NC_008322	CGC	2	6	1602052	1602057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_008322	GAA	2	6	1602082	1602087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008322	CTG	2	6	1603095	1603100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_008322	TTGGT	2	10	1603129	1603138	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008322	AT	3	6	1603151	1603156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008322	TAC	2	6	1603170	1603175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_008322	CCT	2	6	1603177	1603182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_008322	TGG	2	6	1603233	1603238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008322	TTTGG	2	10	1603241	1603250	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008322	ATT	2	6	1603327	1603332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008322	T	8	8	1603331	1603338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008322	AC	3	6	1603374	1603379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_008322	AG	4	8	1603380	1603387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_008322	GTATT	2	10	1614162	1614171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_008322	AAT	2	6	1614269	1614274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008322	TA	3	6	1614282	1614287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_008322	ATT	3	9	1614337	1614345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008322	TG	3	6	1614373	1614378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_008322	GT	3	6	1614380	1614385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_008322	TGT	2	6	1614435	1614440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008322	GT	3	6	1614439	1614444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008322	T	7	7	1615657	1615663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008322	AG	3	6	1615716	1615721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_008322	GAG	2	6	1618213	1618218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008322	GTT	2	6	1618233	1618238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_008322	AAG	2	6	1618304	1618309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008322	TAG	2	6	1618325	1618330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008322	AAAGC	2	10	1618372	1618381	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_008322	TTG	2	6	1618430	1618435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008322	TGT	2	6	1618448	1618453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_008322	GAA	2	6	1618457	1618462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_008322	T	7	7	1620323	1620329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008322	TTAT	2	8	1620927	1620934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_008322	A	7	7	1621007	1621013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008322	GAT	2	6	1621027	1621032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_008322	GT	3	6	1621113	1621118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008322	AAT	2	6	1628037	1628042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008322	AT	3	6	1628061	1628066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008322	T	6	6	1628091	1628096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008322	A	8	8	1628119	1628126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008322	GGC	2	6	1628139	1628144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_008322	ACTA	2	8	1628159	1628166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_008322	A	6	6	1628439	1628444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008322	TGC	2	6	1628543	1628548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_008322	AAT	2	6	1628562	1628567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008322	GTG	2	6	1628641	1628646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008322	ATTT	2	8	1628657	1628664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008322	TTA	2	6	1629841	1629846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008322	TTA	2	6	1629852	1629857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008322	A	6	6	1629874	1629879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008322	T	6	6	1629950	1629955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008322	A	6	6	1629968	1629973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008322	GAT	2	6	1631849	1631854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_008322	A	6	6	1633336	1633341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008322	CAA	2	6	1633357	1633362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_008322	GTT	2	6	1633383	1633388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008322	A	6	6	1638371	1638376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_008322	T	6	6	1638394	1638399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_008322	TTA	2	6	1638866	1638871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008322	AAC	2	6	1638885	1638890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008322	ATT	2	6	1638956	1638961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008322	A	6	6	1639026	1639031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008322	ACGTTA	2	12	1639058	1639069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4127	NC_008322	TGA	2	6	1639102	1639107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008322	AGGA	2	8	1639138	1639145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008322	AGT	2	6	1640951	1640956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_008322	CTG	2	6	1641030	1641035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_008322	ACA	2	6	1641054	1641059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_008322	CCA	2	6	1641152	1641157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_008322	GAA	2	6	1641187	1641192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_008322	AAAT	2	8	1642827	1642834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008322	T	7	7	1642858	1642864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_008322	TTA	2	6	1642867	1642872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_008322	GTAA	2	8	1645122	1645129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4153	NC_008322	TGT	2	6	1648421	1648426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_008322	AAAC	2	8	1651741	1651748	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4156	NC_008322	TTCA	2	8	1651822	1651829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4157	NC_008322	GTG	2	6	1651876	1651881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4163	NC_008322	TAA	2	6	1658631	1658636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_008322	TGA	2	6	1658765	1658770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4248	NC_008322	ATTA	2	8	1676558	1676565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_008322	ATTTA	2	10	1676606	1676615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_008322	A	6	6	1676619	1676624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_008322	GC	3	6	1679349	1679354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4255	NC_008322	CAAT	2	8	1679458	1679465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4258	NC_008322	T	7	7	1680841	1680847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_008322	T	6	6	1682078	1682083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_008322	TAA	2	6	1682086	1682091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_008322	TGC	2	6	1682130	1682135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4397	NC_008322	TCT	2	6	1751039	1751044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4398	NC_008322	A	6	6	1751085	1751090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_008322	TCGT	2	8	1751112	1751119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4400	NC_008322	T	6	6	1751157	1751162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_008322	CTT	2	6	1753045	1753050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4403	NC_008322	AAT	2	6	1753115	1753120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4404	NC_008322	TGA	2	6	1753130	1753135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4425	NC_008322	CATT	2	8	1757834	1757841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4432	NC_008322	GGT	2	6	1760119	1760124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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