MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 12333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008322	TAA	3	9	1360097	1360105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_008322	AAATT	2	10	1360114	1360123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008322	ATT	2	6	1360166	1360171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008322	AT	3	6	1360201	1360206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_008322	TAG	2	6	1360214	1360219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_008322	ATT	2	6	1360267	1360272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_008322	ATAA	2	8	1360330	1360337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008322	TTAT	2	8	1360353	1360360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008322	TA	3	6	1362101	1362106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_008322	TA	3	6	1362114	1362119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008322	ATT	2	6	1362173	1362178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_008322	CTCA	2	8	1363149	1363156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_008322	T	7	7	1363167	1363173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_008322	AGG	2	6	1363219	1363224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008322	TCA	2	6	1363225	1363230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_008322	ATAGC	2	10	1363292	1363301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3517	NC_008322	AAT	2	6	1363341	1363346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008322	CGCAG	2	10	1368039	1368048	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3519	NC_008322	TTC	2	6	1369508	1369513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_008322	A	6	6	1369564	1369569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_008322	TTG	2	6	1369584	1369589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008322	GGT	2	6	1369632	1369637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008322	AAAT	2	8	1369665	1369672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008322	G	8	8	1371945	1371952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008322	GTCC	2	8	1372007	1372014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_008322	GTC	2	6	1372050	1372055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_008322	GTT	2	6	1372089	1372094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008322	AC	3	6	1372114	1372119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_008322	AAT	2	6	1372185	1372190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_008322	CA	3	6	1373259	1373264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_008322	TAG	2	6	1373290	1373295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008322	CT	3	6	1373330	1373335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_008322	TTC	2	6	1373336	1373341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_008322	GCA	2	6	1373518	1373523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_008322	GCTG	2	8	1373563	1373570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_008322	ACA	2	6	1373582	1373587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_008322	TAA	2	6	1373625	1373630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008322	TA	3	6	1373656	1373661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_008322	T	6	6	1381287	1381292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008322	TCAAA	2	10	1381294	1381303	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_008322	AAAT	2	8	1381310	1381317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008322	AACT	2	8	1381346	1381353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_008322	GACT	2	8	1381383	1381390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_008322	GAC	2	6	1381457	1381462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_008322	CCT	2	6	1382081	1382086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_008322	TGA	2	6	1382094	1382099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008322	TAA	2	6	1382165	1382170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008322	TGG	2	6	1382816	1382821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008322	GAA	2	6	1382830	1382835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008322	TGCAA	2	10	1383428	1383437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3551	NC_008322	CA	3	6	1383470	1383475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_008322	CAG	2	6	1383506	1383511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_008322	GCG	2	6	1383535	1383540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_008322	TAT	2	6	1383569	1383574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_008322	ATA	2	6	1383639	1383644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_008322	TC	3	6	1383688	1383693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_008322	GGTCA	2	10	1383766	1383775	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3558	NC_008322	CAAG	2	8	1383820	1383827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_008322	TTA	2	6	1383943	1383948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008322	CT	3	6	1384010	1384015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_008322	TAC	2	6	1385019	1385024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_008322	ATTGGT	2	12	1386891	1386902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008322	T	6	6	1386902	1386907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_008322	GTC	2	6	1388240	1388245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_008322	CCA	2	6	1388259	1388264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_008322	TGG	2	6	1388267	1388272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008322	T	6	6	1388275	1388280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_008322	T	7	7	1388301	1388307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008322	TCC	2	6	1388330	1388335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_008322	TTA	2	6	1389421	1389426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008322	AAGA	2	8	1389945	1389952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_008322	TTG	2	6	1393468	1393473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008322	GGA	2	6	1393478	1393483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_008322	A	6	6	1393485	1393490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008322	CAA	2	6	1394559	1394564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_008322	A	6	6	1394570	1394575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008322	T	7	7	1394594	1394600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_008322	A	6	6	1397291	1397296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008322	AAAT	2	8	1397324	1397331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008322	AAT	2	6	1397348	1397353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008322	GCA	2	6	1397408	1397413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_008322	CTGA	2	8	1397450	1397457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_008322	AAAT	2	8	1397459	1397466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008322	CAG	2	6	1397510	1397515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_008322	TTA	2	6	1397553	1397558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_008322	CTG	2	6	1399232	1399237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_008322	CTC	2	6	1399252	1399257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_008322	GTC	2	6	1399349	1399354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_008322	GT	3	6	1403417	1403422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_008322	T	6	6	1403692	1403697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_008322	T	6	6	1403705	1403710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_008322	T	6	6	1403712	1403717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008322	GTT	2	6	1403793	1403798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_008322	CCT	2	6	1403932	1403937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_008322	A	6	6	1403959	1403964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_008322	TCA	2	6	1404174	1404179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_008322	AAGT	2	8	1404218	1404225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008322	CG	3	6	1404473	1404478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_008322	CCT	2	6	1404664	1404669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_008322	CTT	2	6	1404721	1404726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_008322	TTAG	2	8	1404854	1404861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008322	T	6	6	1404894	1404899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008322	TGA	2	6	1405134	1405139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_008322	GACTT	2	10	1408733	1408742	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3605	NC_008322	AAAGC	2	10	1408821	1408830	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3606	NC_008322	CAAA	2	8	1408863	1408870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_008322	TCC	2	6	1408875	1408880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_008322	AAAC	2	8	1408929	1408936	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_008322	AAC	2	6	1409050	1409055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008322	AGC	2	6	1409107	1409112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_008322	CCT	2	6	1409197	1409202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_008322	TCC	2	6	1409281	1409286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_008322	GTA	2	6	1409347	1409352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008322	TCA	2	6	1409419	1409424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_008322	TAGTAA	2	12	1409437	1409448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_008322	AG	4	8	1409469	1409476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_008322	TG	3	6	1409543	1409548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_008322	TGG	2	6	1409566	1409571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_008322	CTG	2	6	1409611	1409616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_008322	GTA	2	6	1409631	1409636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_008322	TTA	2	6	1409638	1409643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_008322	AAAC	2	8	1409683	1409690	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_008322	A	6	6	1409698	1409703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_008322	T	6	6	1410205	1410210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_008322	CAT	2	6	1410337	1410342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_008322	CTTTA	2	10	1410351	1410360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3627	NC_008322	A	6	6	1411132	1411137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_008322	T	6	6	1411155	1411160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008322	GAA	2	6	1411174	1411179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_008322	TAGG	2	8	1411729	1411736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_008322	GTTG	2	8	1411761	1411768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_008322	TAC	2	6	1411807	1411812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_008322	A	7	7	1412621	1412627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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