MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 12333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008322	GAT	2	6	527217	527222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008322	T	6	6	537252	537257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008322	TCA	2	6	537286	537291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008322	GA	3	6	537299	537304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008322	AGT	2	6	537954	537959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008322	GCCT	2	8	538553	538560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_008322	T	8	8	538569	538576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008322	TAA	2	6	538606	538611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008322	ATT	2	6	538625	538630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_008322	TTTG	2	8	538634	538641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008322	TGAT	2	8	545024	545031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008322	GGT	2	6	545040	545045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008322	T	6	6	545045	545050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_008322	GCG	2	6	545054	545059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008322	T	6	6	545167	545172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008322	A	9	9	545205	545213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008322	TCT	2	6	545291	545296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_008322	ATACA	2	10	548557	548566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_008322	TTAAT	2	10	548636	548645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008322	GCA	2	6	556777	556782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_008322	GCC	2	6	556802	556807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_008322	ATG	2	6	556812	556817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008322	CAA	2	6	561720	561725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_008322	AGATAT	2	12	561773	561784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008322	A	6	6	561796	561801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008322	T	7	7	561840	561846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008322	TCA	2	6	562321	562326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_008322	CAA	2	6	562425	562430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_008322	GAC	2	6	562470	562475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_008322	GC	3	6	562535	562540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_008322	TG	3	6	562585	562590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008322	TGT	2	6	562682	562687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008322	AATC	2	8	562714	562721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_008322	CTG	2	6	562742	562747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_008322	AGG	2	6	562752	562757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008322	TTG	2	6	566651	566656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008322	TAA	3	9	567232	567240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008322	GC	3	6	567303	567308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_008322	AATA	2	8	567309	567316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008322	TAGC	2	8	568821	568828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_008322	ATC	2	6	571003	571008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008322	GCG	2	6	571106	571111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_008322	GCC	2	6	572016	572021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_008322	TAT	2	6	572071	572076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008322	ATA	2	6	572107	572112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008322	ACT	2	6	572131	572136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008322	CGC	2	6	572177	572182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_008322	ATGAA	2	10	572210	572219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008322	GAG	2	6	572222	572227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008322	TCTGC	2	10	572580	572589	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1551	NC_008322	A	6	6	572645	572650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008322	CGAAT	2	10	572711	572720	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1553	NC_008322	GCTGAT	2	12	574201	574212	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1554	NC_008322	GCG	2	6	574315	574320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_008322	CGC	2	6	574347	574352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_008322	ATGA	2	8	574365	574372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008322	A	6	6	574419	574424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008322	A	7	7	574430	574436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008322	ATG	2	6	574480	574485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008322	GCC	2	6	574557	574562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_008322	CT	3	6	575343	575348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_008322	GCT	2	6	575359	575364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_008322	AGC	2	6	575371	575376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_008322	GAA	2	6	575429	575434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008322	TAA	2	6	575475	575480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008322	AT	3	6	575547	575552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008322	GCT	2	6	576423	576428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_008322	AGG	2	6	576545	576550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008322	TCC	2	6	576564	576569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_008322	TCT	2	6	576801	576806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_008322	T	6	6	576879	576884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_008322	CAG	2	6	576908	576913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_008322	TGT	2	6	576930	576935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008322	TAG	2	6	576943	576948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_008322	T	6	6	576974	576979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008322	CGCCC	2	10	577008	577017	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1577	NC_008322	GCGA	2	8	577018	577025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_008322	GCGTA	2	10	577026	577035	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1579	NC_008322	AT	3	6	577134	577139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008322	ACAT	2	8	579073	579080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_008322	ACA	2	6	579102	579107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_008322	AGG	2	6	579304	579309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008322	AGT	2	6	579318	579323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008322	CCT	2	6	579324	579329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_008322	AAAT	2	8	579398	579405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_008322	A	6	6	579427	579432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008322	GA	3	6	580906	580911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008322	GCG	2	6	580992	580997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_008322	GGGGA	2	10	581012	581021	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008322	GCG	2	6	581027	581032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_008322	AATA	2	8	581066	581073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008322	GGT	2	6	581166	581171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008322	T	6	6	581230	581235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008322	TAGG	2	8	581275	581282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008322	GAC	2	6	581988	581993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_008322	CT	3	6	582016	582021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_008322	T	6	6	582156	582161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_008322	ACG	2	6	582279	582284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_008322	TAA	2	6	582306	582311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008322	GCAA	2	8	586275	586282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_008322	T	7	7	586303	586309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_008322	CAAAA	2	10	587097	587106	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1603	NC_008322	ATT	2	6	587565	587570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008322	CTA	2	6	587572	587577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_008322	TAA	2	6	591294	591299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_008322	C	6	6	591300	591305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1607	NC_008322	GAA	2	6	591313	591318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008322	T	7	7	591384	591390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008322	GGT	2	6	591418	591423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008322	T	6	6	591457	591462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_008322	A	6	6	592507	592512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008322	CGC	2	6	592513	592518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_008322	GCG	2	6	592525	592530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008322	TCT	2	6	592698	592703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_008322	TAC	2	6	592733	592738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_008322	T	7	7	592785	592791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008322	CTAA	2	8	592815	592822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_008322	AATAT	2	10	595448	595457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_008322	T	7	7	595462	595468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008322	TGT	2	6	595499	595504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008322	CAC	2	6	595540	595545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_008322	AGC	2	6	597333	597338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_008322	AGG	2	6	597489	597494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008322	TCC	2	6	597508	597513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_008322	C	6	6	597611	597616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1626	NC_008322	TTC	2	6	597654	597659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_008322	GTC	2	6	597740	597745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008322	ATT	2	6	597834	597839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008322	ATT	2	6	597860	597865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008322	CTGATG	2	12	597934	597945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1631	NC_008322	ATT	2	6	597967	597972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008322	GGTT	2	8	598005	598012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_008322	AGA	2	6	598019	598024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_008322	ATA	2	6	598500	598505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_008322	GTT	2	6	598562	598567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_008322	AAT	2	6	598609	598614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_008322	AATG	2	8	598654	598661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_008322	TAAA	2	8	598749	598756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_008322	AT	3	6	598803	598808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1640	NC_008322	TTAG	2	8	598881	598888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1656	NC_008322	CTGA	2	8	606233	606240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1672	NC_008322	GTT	2	6	613427	613432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1676	NC_008322	GTT	2	6	613477	613482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1686	NC_008322	TTA	2	6	614276	614281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1761	NC_008322	TAAT	2	8	646696	646703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1769	NC_008322	AGAGA	2	10	648678	648687	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1770	NC_008322	GTTA	3	12	648738	648749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1771	NC_008322	GCT	2	6	649025	649030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1773	NC_008322	TTG	2	6	649119	649124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_008322	CCTT	2	8	711089	711096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1915	NC_008322	TCC	2	6	711108	711113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1916	NC_008322	GGA	2	6	711120	711125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_008322	GCG	2	6	712856	712861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1918	NC_008322	TTACA	2	10	712945	712954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1922	NC_008322	TGA	2	6	715696	715701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_008322	TGA	2	6	715710	715715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_008322	TGA	2	6	715724	715729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1929	NC_008322	A	6	6	717629	717634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_008322	TGA	2	6	718221	718226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1935	NC_008322	AGC	2	6	719118	719123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1937	NC_008322	CGAGC	2	10	719933	719942	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1943	NC_008322	TGC	2	6	720640	720645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1946	NC_008322	TGG	2	6	723883	723888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1949	NC_008322	AGAA	2	8	724109	724116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_008322	GAA	2	6	724208	724213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_008322	A	6	6	724220	724225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_008322	GTTT	2	8	725777	725784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_008322	T	6	6	728849	728854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_008322	TC	3	6	728868	728873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1955	NC_008322	TGC	2	6	728886	728891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1957	NC_008322	CGC	2	6	728983	728988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1958	NC_008322	ATG	2	6	728991	728996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_008322	GTC	2	6	729006	729011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1962	NC_008322	CCTGT	2	10	729100	729109	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1967	NC_008322	A	6	6	730204	730209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1972	NC_008322	CTA	2	6	730372	730377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1973	NC_008322	CAA	2	6	730407	730412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1974	NC_008322	CCTGT	2	10	730450	730459	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1976	NC_008322	TTAAG	2	10	733190	733199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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