MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 12333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008322	GTT	2	6	392735	392740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008322	AAG	2	6	392744	392749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008322	TTA	2	6	392767	392772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008322	GA	3	6	392821	392826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008322	TCA	2	6	393523	393528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008322	T	7	7	393541	393547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008322	TCC	2	6	394226	394231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_008322	ACT	2	6	394232	394237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008322	A	6	6	394377	394382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008322	CTT	2	6	394430	394435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008322	AAAG	2	8	396543	396550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008322	AAT	2	6	398895	398900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008322	A	6	6	398950	398955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008322	T	6	6	399787	399792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008322	T	8	8	400265	400272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008322	T	6	6	400277	400282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008322	TCA	2	6	400293	400298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008322	A	7	7	400352	400358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008322	T	6	6	400383	400388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008322	TCAT	2	8	400484	400491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_008322	ATA	2	6	401915	401920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008322	TTG	2	6	401926	401931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008322	GCG	2	6	402535	402540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008322	ACA	2	6	403450	403455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008322	AGG	2	6	403469	403474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008322	GT	3	6	403494	403499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008322	AGA	2	6	403552	403557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008322	AAT	2	6	403571	403576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008322	A	6	6	403627	403632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008322	CTT	2	6	404141	404146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_008322	TGA	2	6	404259	404264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008322	GTT	2	6	404296	404301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008322	AGA	2	6	404382	404387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008322	CGG	2	6	408014	408019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_008322	T	7	7	408045	408051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008322	A	6	6	408056	408061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008322	T	7	7	408065	408071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008322	CAA	2	6	408114	408119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008322	A	6	6	408175	408180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008322	A	7	7	408194	408200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008322	AC	3	6	408210	408215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_008322	AGGC	2	8	408218	408225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_008322	AATA	2	8	408263	408270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008322	TTTAA	2	10	408271	408280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008322	AGC	2	6	408293	408298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_008322	CCT	3	9	408307	408315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_008322	TC	5	10	408316	408325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_008322	GCTC	2	8	408354	408361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_008322	GATA	2	8	408362	408369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008322	T	6	6	408408	408413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008322	AAT	2	6	408437	408442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008322	ACA	2	6	413329	413334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008322	TATT	2	8	413346	413353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008322	ATTAA	2	10	413356	413365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008322	GT	3	6	413453	413458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008322	ATTT	2	8	413484	413491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008322	T	6	6	413496	413501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008322	TAA	2	6	413604	413609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008322	T	6	6	413614	413619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008322	TTG	2	6	413638	413643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008322	TCT	2	6	413650	413655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008322	TG	3	6	413703	413708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008322	AAT	2	6	413744	413749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008322	TGA	2	6	415124	415129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008322	T	6	6	415152	415157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008322	GCC	2	6	415211	415216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_008322	AT	3	6	415225	415230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008322	ATAGG	2	10	415289	415298	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008322	AAAT	2	8	416793	416800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008322	TGAAA	2	10	416804	416813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008322	CCT	2	6	417182	417187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_008322	CGG	2	6	417214	417219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008322	A	6	6	419212	419217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008322	TGT	2	6	419229	419234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008322	GCT	3	9	419331	419339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_008322	T	6	6	419339	419344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008322	TGC	2	6	419436	419441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008322	ATCCC	2	10	419473	419482	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1079	NC_008322	CTA	2	6	419497	419502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008322	AGGAT	2	10	419557	419566	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008322	AAG	2	6	420052	420057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008322	AG	3	6	420056	420061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008322	CAAA	2	8	421010	421017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_008322	ACT	2	6	432133	432138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008322	TA	3	6	432176	432181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008322	TAG	2	6	432204	432209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008322	AAAC	2	8	432226	432233	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_008322	TGG	2	6	432261	432266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008322	TGC	2	6	435575	435580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_008322	TG	4	8	435584	435591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008322	ATT	2	6	435607	435612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008322	ATA	2	6	437018	437023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008322	CAT	2	6	437965	437970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008322	GT	3	6	440861	440866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008322	A	6	6	440955	440960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008322	A	7	7	440965	440971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008322	A	6	6	440975	440980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008322	CTG	2	6	440999	441004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_008322	CCT	2	6	441077	441082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_008322	AAAG	2	8	441093	441100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008322	ACT	2	6	441109	441114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008322	TG	3	6	441217	441222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008322	AATG	2	8	441290	441297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008322	TTA	2	6	441325	441330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008322	GGC	2	6	441421	441426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008322	GCA	2	6	441452	441457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_008322	AAGT	2	8	441459	441466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008322	GCG	2	6	441485	441490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008322	AGG	2	6	441580	441585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008322	CGA	2	6	441660	441665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008322	GAT	2	6	441685	441690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008322	GCA	2	6	441734	441739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_008322	GT	3	6	441787	441792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008322	GAA	2	6	441793	441798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008322	GGA	2	6	441829	441834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008322	AGA	2	6	441876	441881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008322	CAG	2	6	441902	441907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008322	G	6	6	442049	442054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008322	GGA	2	6	442093	442098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008322	GGC	2	6	442113	442118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008322	GAA	2	6	442356	442361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008322	TGC	2	6	442432	442437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_008322	GTC	2	6	442444	442449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008322	TGG	2	6	442522	442527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008322	GGA	2	6	442558	442563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008322	GAC	2	6	442571	442576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008322	TCA	2	6	442583	442588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_008322	AC	3	6	442609	442614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_008322	TCG	2	6	442676	442681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_008322	AC	3	6	442778	442783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_008322	AAG	2	6	442814	442819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008322	CAC	2	6	442848	442853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_008322	CCT	2	6	442919	442924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_008322	TGTT	2	8	442945	442952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008322	CA	3	6	442960	442965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_008322	AGA	2	6	442978	442983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008322	GGT	2	6	443046	443051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_008322	TCCT	2	8	443075	443082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1410	NC_008322	CGT	2	6	507475	507480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_008322	TGT	2	6	507522	507527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_008322	TGT	3	9	511386	511394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_008322	TTATT	2	10	511453	511462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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