MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 12333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008322	TTTTGC	2	12	2117473	2117484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5502	NC_008322	A	6	6	2119054	2119059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008322	CTA	2	6	2119089	2119094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_008322	T	6	6	2119101	2119106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_008322	TAG	2	6	2119245	2119250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008322	TGA	2	6	2119459	2119464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_008322	TGG	2	6	2119488	2119493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_008322	TTG	2	6	2120513	2120518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_008322	T	7	7	2120547	2120553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_008322	CTT	2	6	2121087	2121092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_008322	ATG	2	6	2121191	2121196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_008322	TTCA	2	8	2121199	2121206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_008322	AAC	2	6	2121918	2121923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_008322	A	6	6	2122053	2122058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008322	ATG	2	6	2122809	2122814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_008322	TTG	2	6	2122823	2122828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_008322	TATT	2	8	2122855	2122862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_008322	ATA	2	6	2122897	2122902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_008322	CA	3	6	2123078	2123083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_008322	TCT	2	6	2123107	2123112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_008322	ACA	2	6	2123302	2123307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_008322	TTC	2	6	2123364	2123369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_008322	T	6	6	2123375	2123380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_008322	AAT	2	6	2123430	2123435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008322	CAAGC	2	10	2123465	2123474	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5526	NC_008322	TAATT	2	10	2123955	2123964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008322	CAT	2	6	2123980	2123985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_008322	TTAT	2	8	2124030	2124037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008322	TAA	2	6	2124085	2124090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_008322	GTTT	2	8	2124251	2124258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_008322	AG	3	6	2124302	2124307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_008322	CT	3	6	2124319	2124324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_008322	TGT	2	6	2124372	2124377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_008322	CAT	2	6	2124439	2124444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_008322	CTT	2	6	2124502	2124507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_008322	ATTG	2	8	2124564	2124571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_008322	ATC	2	6	2124604	2124609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008322	ACC	2	6	2124681	2124686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_008322	ATT	2	6	2124693	2124698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008322	A	6	6	2124717	2124722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008322	ATC	2	6	2124728	2124733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_008322	ATG	2	6	2124809	2124814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_008322	ATA	2	6	2124821	2124826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008322	TGG	2	6	2124847	2124852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_008322	CCT	2	6	2124858	2124863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_008322	TG	3	6	2124881	2124886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008322	GTG	2	6	2125037	2125042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_008322	AGC	2	6	2125238	2125243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_008322	AGTG	2	8	2125293	2125300	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_008322	GAC	2	6	2125302	2125307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_008322	CGG	2	6	2125316	2125321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_008322	GAT	2	6	2125420	2125425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_008322	A	6	6	2125478	2125483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_008322	TGT	2	6	2127040	2127045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_008322	TTTTA	2	10	2127054	2127063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_008322	TG	3	6	2127069	2127074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_008322	GAT	2	6	2127075	2127080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008322	CTG	2	6	2127134	2127139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_008322	TCA	2	6	2127140	2127145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_008322	TG	3	6	2127163	2127168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008322	T	7	7	2127218	2127224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008322	T	6	6	2127377	2127382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008322	CTTG	2	8	2129070	2129077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_008322	CAG	2	6	2129467	2129472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_008322	T	7	7	2129485	2129491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008322	GTA	2	6	2129503	2129508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008322	A	6	6	2129517	2129522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008322	CTCA	2	8	2129547	2129554	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_008322	AGG	2	6	2129611	2129616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_008322	A	6	6	2129949	2129954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_008322	TGCAT	2	10	2129961	2129970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5572	NC_008322	T	6	6	2129977	2129982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008322	ATTC	2	8	2134533	2134540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_008322	TTTA	2	8	2135233	2135240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_008322	TAT	2	6	2135256	2135261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_008322	CA	3	6	2135293	2135298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_008322	AGC	2	6	2138649	2138654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_008322	GCGG	2	8	2139556	2139563	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_008322	CACG	2	8	2139616	2139623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_008322	AATTA	2	10	2139656	2139665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_008322	TGA	2	6	2141320	2141325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008322	AG	3	6	2141398	2141403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_008322	CCA	2	6	2141489	2141494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_008322	TA	3	6	2141525	2141530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_008322	ATT	2	6	2142101	2142106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_008322	TGTA	2	8	2142116	2142123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_008322	GT	3	6	2142151	2142156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_008322	CTA	2	6	2144721	2144726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_008322	CGATG	2	10	2146952	2146961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5590	NC_008322	GCAA	2	8	2147020	2147027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5591	NC_008322	TGAT	2	8	2147037	2147044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008322	AAGC	2	8	2147053	2147060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5593	NC_008322	TAT	2	6	2147062	2147067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008322	AAATG	2	10	2147075	2147084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_008322	CAT	2	6	2148548	2148553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_008322	TAT	2	6	2148574	2148579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_008322	TGT	2	6	2148667	2148672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_008322	CCAGT	2	10	2148683	2148692	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5599	NC_008322	TG	3	6	2148715	2148720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_008322	T	6	6	2148791	2148796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008322	CG	3	6	2148812	2148817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_008322	GAA	2	6	2149299	2149304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_008322	T	6	6	2149322	2149327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008322	GGC	2	6	2149331	2149336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_008322	TTA	2	6	2149390	2149395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_008322	A	6	6	2149403	2149408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_008322	CCTT	2	8	2149417	2149424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_008322	AAG	2	6	2150049	2150054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_008322	CTT	2	6	2150072	2150077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_008322	ATC	2	6	2152481	2152486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_008322	GCA	2	6	2152513	2152518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_008322	TCA	2	6	2152540	2152545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_008322	A	6	6	2152551	2152556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_008322	A	6	6	2152581	2152586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_008322	TG	3	6	2152647	2152652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_008322	TTTA	2	8	2152660	2152667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_008322	CTA	2	6	2152720	2152725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_008322	TA	4	8	2152724	2152731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_008322	TTTA	2	8	2152744	2152751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_008322	AAG	2	6	2154075	2154080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008322	GGA	2	6	2154191	2154196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008322	GAA	2	6	2154204	2154209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_008322	TC	3	6	2154229	2154234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_008322	TCAT	2	8	2154422	2154429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_008322	TAA	2	6	2154522	2154527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_008322	ATG	2	6	2154542	2154547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_008322	TAAATT	2	12	2156449	2156460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_008322	AAGC	2	8	2156485	2156492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5629	NC_008322	CTAT	2	8	2157933	2157940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5630	NC_008322	ATT	2	6	2157941	2157946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_008322	ATA	2	6	2158702	2158707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_008322	TGG	2	6	2158709	2158714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_008322	T	6	6	2158716	2158721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_008322	AGTT	2	8	2158776	2158783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_008322	GAGT	2	8	2158794	2158801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5761	NC_008322	ATTC	2	8	2203395	2203402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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