MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008321	TGAAGG	2	12	45741	45752	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008321	ATCACC	2	12	51118	51129	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008321	ATCGCC	2	12	56148	56159	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008321	TAACAC	2	12	65246	65257	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008321	TTTTGT	2	12	74150	74161	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008321	CGATAA	2	12	75886	75897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008321	GGAAAG	2	12	106669	106680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008321	GATCTC	2	12	112961	112972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008321	GCTTGT	2	12	128708	128719	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008321	CTTTTC	2	12	156975	156986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008321	TGAAGG	2	12	205311	205322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008321	TGAAGG	2	12	256504	256515	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008321	AACGGC	2	12	283093	283104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008321	GCAAAG	2	12	289461	289472	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008321	TGATAC	2	12	318145	318156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008321	GAACCA	2	12	332357	332368	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008321	TTATTG	2	12	438779	438790	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008321	CTGAAA	2	12	438927	438938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008321	TAAGCC	2	12	447178	447189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008321	AAATCT	2	12	460461	460472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008321	TTCTTA	2	12	463636	463647	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008321	GCTTAT	2	12	466948	466959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008321	CTCTGT	2	12	468940	468951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008321	GCTAAC	2	12	511433	511444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008321	TGCTTA	2	12	512589	512600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008321	CCCATA	2	12	528780	528791	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008321	CAAAGT	3	18	533946	533963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008321	TTCTTA	2	12	548175	548186	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008321	AACGAT	2	12	563771	563782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008321	GTTAAA	2	12	599969	599980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008321	AAGCAA	2	12	679695	679706	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008321	ATTAGC	2	12	683989	684000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008321	TAATGC	2	12	684259	684270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008321	ACTAAA	2	12	691543	691554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008321	TATTCA	2	12	705134	705145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008321	AAGATA	2	12	705362	705373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008321	CTAAAG	2	12	725998	726009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008321	TCTTTA	2	12	729976	729987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008321	CACTCA	2	12	750944	750955	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008321	AACGTT	2	12	754178	754189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008321	ATTTGT	2	12	792920	792931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008321	ATGCTT	2	12	802712	802723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008321	ATCCCT	2	12	819373	819384	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008321	CATCTA	2	12	898329	898340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008321	GGAACG	2	12	904601	904612	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008321	GTTTTT	2	12	940701	940712	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008321	ATATTT	2	12	945263	945274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008321	CTTTGG	2	12	983272	983283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008321	CTTTGG	2	12	985721	985732	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008321	TCCAAC	2	12	1006365	1006376	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008321	TAAAGA	2	12	1014976	1014987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008321	TTTGAT	2	12	1068179	1068190	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008321	GTTGCA	2	12	1068480	1068491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008321	TAATGA	2	12	1074014	1074025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008321	TTTGAT	2	12	1123731	1123742	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008321	CGAGTT	2	12	1128694	1128705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008321	GCTCTT	2	12	1149490	1149501	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008321	TGTAAT	2	12	1211251	1211262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008321	AAAACA	2	12	1222102	1222113	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008321	CGCATG	2	12	1238479	1238490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008321	TTCTTG	2	12	1241414	1241425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008321	TGAAAT	2	12	1241651	1241662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008321	GGCACT	2	12	1289486	1289497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008321	ATTGGT	2	12	1310469	1310480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008321	TAGTAA	2	12	1333017	1333028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008321	TTACGT	2	12	1337211	1337222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008321	TAACAA	2	12	1344119	1344130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008321	TGAGCT	2	12	1348007	1348018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008321	TGCTTA	2	12	1389443	1389454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008321	ATCATT	2	12	1402932	1402943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008321	TAAATC	2	12	1460001	1460012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008321	GAATGT	2	12	1519942	1519953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008321	ACGTTA	2	12	1567639	1567650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008321	AAAACA	2	12	1650884	1650895	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008321	GGGATT	2	12	1661627	1661638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008321	TTTTAG	2	12	1675059	1675070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008321	GGAACT	2	12	1751697	1751708	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008321	TTTGTG	2	12	1752377	1752388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008321	TGAAGG	2	12	1794458	1794469	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008321	TATTTA	2	12	1799720	1799731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008321	GACAGC	2	12	1848024	1848035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008321	ATAGGC	2	12	1855466	1855477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008321	ATTGCA	2	12	1856333	1856344	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008321	TATTGA	2	12	1860327	1860338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008321	ACGTAA	2	12	1894332	1894343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008321	ACTTCC	2	12	1947942	1947953	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008321	TATTTT	2	12	1992430	1992441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008321	GCAGTG	2	12	2006509	2006520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008321	TGGATA	2	12	2047734	2047745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008321	CAAAGA	2	12	2073855	2073866	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008321	GGCTTA	2	12	2087725	2087736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008321	TCAAGC	2	12	2119062	2119073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008321	GCTTAA	2	12	2127461	2127472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008321	AACTAA	2	12	2232934	2232945	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008321	GTTATC	2	12	2274398	2274409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008321	GATCGC	2	12	2284874	2284885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008321	AAAAAG	2	12	2378118	2378129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008321	AAATGC	2	12	2388741	2388752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008321	TAAAAG	2	12	2391514	2391525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008321	AAAAAC	2	12	2438246	2438257	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008321	AGCTGC	2	12	2450233	2450244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008321	TTTTAA	2	12	2465419	2465430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008321	TCAATA	2	12	2465507	2465518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008321	AAATTG	2	12	2466625	2466636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008321	TAGTTT	2	12	2522499	2522510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008321	ATTTTT	2	12	2525241	2525252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008321	TCAGAT	2	12	2677426	2677437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008321	CGCGAG	2	12	2704474	2704485	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008321	TTTAAC	2	12	2741780	2741791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008321	CATGCG	2	12	2745845	2745856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008321	AGAAAA	2	12	2764921	2764932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008321	CTTTAC	2	12	2769028	2769039	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008321	ATGCTT	2	12	2796213	2796224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008321	AAAACA	2	12	2856325	2856336	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008321	GTCCCA	2	12	2864199	2864210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008321	CTCAAT	2	12	2880676	2880687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008321	TTGATT	2	12	2892390	2892401	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008321	CTTAAC	2	12	2901148	2901159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008321	TCCCAC	2	12	2911711	2911722	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008321	TAAAAA	2	12	2931295	2931306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008321	CAGCTT	2	12	2978399	2978410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008321	AAAAAT	2	12	2978548	2978559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008321	CTGCAA	2	12	2983903	2983914	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008321	TAGAAA	2	12	2986458	2986469	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008321	CTTTTA	2	12	3036511	3036522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008321	CTGTAA	2	12	3054351	3054362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008321	TCACAA	2	12	3055405	3055416	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008321	GCATGG	2	12	3060109	3060120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008321	GTCTTG	2	12	3092961	3092972	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008321	GCCTAA	2	12	3168073	3168084	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008321	ATTTAC	2	12	3210925	3210936	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_008321	TTACGT	2	12	3312968	3312979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_008321	ATCATT	2	12	3313255	3313266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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142	NC_008321	AATATT	2	12	3339039	3339050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008321	TGTTAT	2	12	3372544	3372555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008321	CGCCCT	2	12	3380768	3380779	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_008321	GGAAGA	2	12	3557634	3557645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008321	CCTTCA	2	12	3571906	3571917	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.