MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008321	ATG	2	6	583950	583955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008321	ATA	2	6	583968	583973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008321	ATA	2	6	583989	583994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008321	TTTA	2	8	584001	584008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008321	CAT	2	6	584024	584029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_008321	TG	3	6	584034	584039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008321	A	6	6	584045	584050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008321	GGC	2	6	584109	584114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_008321	GCC	2	6	584121	584126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_008321	GAT	2	6	584138	584143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008321	AAC	2	6	584205	584210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008321	GA	3	6	585324	585329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008321	CGGA	2	8	585350	585357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_008321	AG	3	6	585393	585398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008321	TACG	2	8	585426	585433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_008321	AT	3	6	585484	585489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008321	TG	3	6	585498	585503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008321	AAAAC	2	10	585553	585562	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_008321	TCA	2	6	586356	586361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_008321	TGT	2	6	586364	586369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008321	GGC	2	6	586395	586400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_008321	GC	3	6	587962	587967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_008321	TGT	2	6	588858	588863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008321	T	7	7	588902	588908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008321	GCC	2	6	590192	590197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_008321	TTAAC	2	10	591884	591893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_008321	ATC	2	6	592431	592436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_008321	TGG	2	6	592878	592883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008321	TAG	2	6	593122	593127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008321	CTT	2	6	593141	593146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_008321	CTA	2	6	593216	593221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_008321	GC	3	6	593761	593766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_008321	TTTA	2	8	593779	593786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008321	TTGG	2	8	593874	593881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008321	GTG	2	6	593900	593905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008321	T	6	6	596676	596681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008321	GC	3	6	596697	596702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_008321	GTTAAA	2	12	599969	599980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008321	CTAGG	2	10	600005	600014	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1540	NC_008321	CGG	2	6	600275	600280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_008321	TGC	2	6	600297	600302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008321	T	6	6	600311	600316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008321	GCC	2	6	600343	600348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_008321	CCTG	2	8	600380	600387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_008321	A	7	7	600662	600668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008321	T	6	6	600692	600697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_008321	CAAT	2	8	600702	600709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_008321	TCC	2	6	601149	601154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_008321	AAATG	2	10	601162	601171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008321	TGC	2	6	601218	601223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_008321	TCAGC	2	10	601303	601312	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1552	NC_008321	TAA	2	6	602322	602327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008321	TGA	2	6	602331	602336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008321	AGT	2	6	602340	602345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008321	CACT	2	8	602353	602360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_008321	GTCG	2	8	603433	603440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_008321	TTCA	2	8	605086	605093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_008321	GTG	2	6	605140	605145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008321	CA	3	6	605203	605208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_008321	TAT	2	6	605325	605330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008321	T	6	6	605385	605390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008321	GCG	2	6	605393	605398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_008321	GTA	2	6	605429	605434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008321	TTA	2	6	605950	605955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008321	AT	3	6	606385	606390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008321	TAAA	2	8	606436	606443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008321	ATT	2	6	606453	606458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008321	ATT	2	6	606500	606505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008321	ATT	2	6	606521	606526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008321	AATC	2	8	606540	606547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_008321	CTAGA	2	10	606579	606588	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1572	NC_008321	CTG	2	6	607994	607999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_008321	GCTT	2	8	608005	608012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_008321	TCA	2	6	608034	608039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_008321	TGG	2	6	608136	608141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008321	TTGAG	2	10	609908	609917	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008321	TGA	2	6	609955	609960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008321	AATG	2	8	612057	612064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008321	TA	3	6	612065	612070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008321	TGAAA	2	10	612112	612121	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008321	A	6	6	612137	612142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008321	TCAT	2	8	612179	612186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_008321	AGTT	2	8	612192	612199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008321	TTA	2	6	612237	612242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_008321	TAG	2	6	612399	612404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_008321	TCA	2	6	612629	612634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_008321	CAA	3	9	612642	612650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_008321	GAA	2	6	612675	612680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_008321	CT	3	6	612699	612704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_008321	GGC	2	6	612729	612734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_008321	AG	3	6	612778	612783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008321	CGC	2	6	612796	612801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_008321	ATT	2	6	612837	612842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008321	TCA	2	6	612843	612848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_008321	GAT	2	6	612849	612854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008321	ATC	2	6	612890	612895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_008321	T	6	6	613863	613868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_008321	AGC	2	6	613883	613888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_008321	TGA	2	6	616060	616065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008321	GA	3	6	616076	616081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008321	ACA	2	6	616084	616089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_008321	AAT	2	6	616131	616136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008321	ACA	2	6	616192	616197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_008321	TCTT	2	8	616198	616205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_008321	TA	3	6	616220	616225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_008321	TGA	2	6	616238	616243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_008321	AT	4	8	616254	616261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008321	T	6	6	616263	616268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008321	AT	3	6	616270	616275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008321	TG	3	6	616289	616294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_008321	GTT	2	6	616693	616698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008321	GCATT	2	10	617740	617749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1613	NC_008321	GTT	2	6	619002	619007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_008321	GC	3	6	619059	619064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_008321	TGG	2	6	619090	619095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008321	TAG	2	6	619118	619123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008321	ATA	2	6	619136	619141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008321	ATT	2	6	622392	622397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_008321	AGA	2	6	625397	625402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008321	CTG	2	6	625501	625506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_008321	AAT	2	6	625510	625515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008321	GCT	2	6	625538	625543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_008321	TG	3	6	625549	625554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008321	TGA	2	6	625562	625567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008321	TTG	2	6	626846	626851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008321	TCTA	2	8	626865	626872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_008321	A	7	7	626872	626878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_008321	A	6	6	626894	626899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008321	GTG	2	6	626930	626935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008321	CGT	2	6	626947	626952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_008321	ATT	2	6	627026	627031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008321	CAA	2	6	627094	627099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_008321	CGC	2	6	632540	632545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_008321	T	8	8	632559	632566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_008321	TTAT	2	8	633289	633296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_008321	CAT	2	6	633336	633341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_008321	T	6	6	633344	633349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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